Malý nukleární ribonukleoprotein D2 - Small nuclear ribonucleoprotein D2
Malý nukleární ribonukleoprotein Sm D2 je protein že u lidí je kódován SNRPD2 gen.[5][6][7]
Protein kódovaný tímto genem patří do rodiny malých jaderných ribonukleoproteinových jádrových proteinů. Je nezbytný pro sestřih pre-mRNA a biogenezi malých jaderných ribonukleoproteinů. Na tomto místě dochází k alternativnímu sestřihu a byly identifikovány dvě varianty transkriptu kódující stejný protein.[7]
Interakce
Bylo prokázáno, že malý nukleární ribonukleoprotein D2 komunikovat s DDX20,[8] Malý nukleární ribonukleoprotein D1,[9][10] Malý nukleární ribonukleoproteinový polypeptid F,[9] CDC5L[11] a SMN1.[12]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125743 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040824 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Lehmeier T, Raker V, Hermann H, Luhrmann R (leden 1995). „cDNA klonování Sm proteinů D2 a D3 z lidských malých jaderných ribonukleoproteinů: důkaz přímé interakce D1-D2“. Proc Natl Acad Sci U S A. 91 (25): 12317–21. Bibcode:1994PNAS ... 9112317L. doi:10.1073 / pnas.91.25.12317. PMC 45428. PMID 7527560.
- ^ Lehmeier T, Foulaki K, Luhrmann R (leden 1991). „Důkazy pro tři odlišné D proteiny, které reagují odlišně s anti-Sm autoprotilátkami, v jádrech hlavních snRNP U1, U2, U4 / U6 a U5“. Nucleic Acids Res. 18 (22): 6475–84. doi:10.1093 / nar / 18.22.6475. PMC 332598. PMID 1701240.
- ^ A b „Entrez Gene: SNRPD2 malý nukleární ribonukleoproteinový D2 polypeptid 16,5 kDa“.
- ^ Charroux, B; Pellizzoni L; Perkinson RA; Ševčenko A; Mann M; Dreyfuss G (prosinec 1999). „Gemin3: Nový DEAD box protein, který interaguje s SMN, produktem genu spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. J. Cell Biol. SPOJENÉ STÁTY. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. ISSN 0021-9525. PMC 2168095. PMID 10601333.
- ^ A b Fury, MG; Zhang W; Christodoulopoulos I; Zieve G W (listopad 1997). "Více proteinů: interakce proteinů mezi běžnými jádrovými proteiny snRNP". Exp. Cell Res. SPOJENÉ STÁTY. 237 (1): 63–9. doi:10.1006 / excr.1997.3750. ISSN 0014-4827. PMID 9417867.
- ^ Kambach, C; Walke S; Young R; Avis J M; de la Fortelle E; Raker VA; Lührmann R; Li J; Nagai K (únor 1999). "Krystalové struktury dvou proteinových komplexů Sm a jejich důsledky pro sestavení spliceosomálních snRNP". Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 96 (3): 375–87. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80550-4. ISSN 0092-8674. PMID 10025403. S2CID 17379935.
- ^ Ajuh, P; Kuster B; Panov K; Zomerdijk J C; Mann M; Lamond A I (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. EMBO J.. ANGLIE. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ISSN 0261-4189. PMC 305846. PMID 11101529.
- ^ Meister, G; Bühler D; Laggerbauer B; Zobawa M; Lottspeich F; Fischer U (srpen 2000). „Charakterizace jaderného komplexu 20S obsahujícího přežití proteinu motorických neuronů (SMN) a specifické podskupiny proteinů spliceosomálního Sm“. Hučení. Mol. Genet. ANGLIE. 9 (13): 1977–86. doi:10,1093 / hmg / 9,13.1977. ISSN 0964-6906. PMID 10942426.
Další čtení
- Rokeach LA, Haselby JA, Hoch SO (1988). "Molekulární klonování cDNA kódující lidský autoprotigen Sm-D". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 85 (13): 4832–6. Bibcode:1988PNAS ... 85.4832R. doi:10.1073 / pnas.85.13.4832. PMC 280530. PMID 3260384.
- Liu Q, Fischer U, Wang F, Dreyfuss G (1997). „Produkt genu pro spinální muskulární atrofii, SMN, a jeho přidružený protein SIP1 jsou v komplexu s proteiny spliceosomal snRNP.“ Buňka. 90 (6): 1013–21. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80367-0. PMID 9323129. S2CID 10855404.
- Fury MG, Zhang W, Christodoulopoulos I, Zieve GW (1998). "Více proteinů: interakce proteinů mezi běžnými jádrovými proteiny snRNP". Exp. Cell Res. 237 (1): 63–9. doi:10.1006 / excr.1997.3750. PMID 9417867.
- Kambach C, Walke S, Young R a kol. (1999). "Krystalové struktury dvou proteinových komplexů Sm a jejich důsledky pro sestavení spliceosomálních snRNP". Buňka. 96 (3): 375–87. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80550-4. PMID 10025403. S2CID 17379935.
- Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA a kol. (2000). „Gemin3: Nový DEAD box protein, který interaguje s SMN, produktem genu spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. PMC 2168095. PMID 10601333.
- Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA a kol. (2000). „Gemin4. Nová složka komplexu SMN, která se nachází jak v drahokamech, tak v jadérech“. J. Cell Biol. 148 (6): 1177–86. doi:10.1083 / jcb.148.6.1177. PMC 2174312. PMID 10725331.
- Meister G, Bühler D, Laggerbauer B a kol. (2000). „Charakterizace jaderného komplexu 20S obsahujícího přežití proteinu motorických neuronů (SMN) a specifické podskupiny proteinů spliceozomálního Sm“. Hučení. Mol. Genet. 9 (13): 1977–86. doi:10,1093 / hmg / 9,13.1977. PMID 10942426.
- Ajuh P, Kuster B, Panov K a kol. (2001). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. EMBO J.. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
- Selenko P, Sprangers R, Stier G a kol. (2001). "Struktura domény SMN tudor a její interakce s proteiny Sm". Nat. Struct. Biol. 8 (1): 27–31. doi:10.1038/83014. PMID 11135666. S2CID 27071310.
- Urlaub H, Raker VA, Kostka S, Lührmann R (2001). „Interakce RNA proteinu-Sm ve vnitřním kruhu spliceosomální struktury jádra snRNP“. EMBO J.. 20 (1–2): 187–96. doi:10.1093 / emboj / 20.1.187. PMC 140196. PMID 11226169.
- Gubitz AK, Mourelatos Z, Abel L a kol. (2002). „Gemin5, nová složka proteinu WD repetice komplexu SMN, která váže proteiny Sm“. J. Biol. Chem. 277 (7): 5631–6. doi:10,1074 / jbc.M109448200. PMID 11714716.
- Pellizzoni L, Baccon J, Rappsilber J a kol. (2002). „Čištění přirozeného přežití komplexů motorických neuronů a identifikace Gemin6 jako nové složky“. J. Biol. Chem. 277 (9): 7540–5. doi:10,1074 / jbc.M110141200. PMID 11748230.
- Friesen WJ, Wyce A, Paushkin S a kol. (2002). „Nová WD opakovaná proteinová složka methylosomu váže proteiny Sm“. J. Biol. Chem. 277 (10): 8243–7. doi:10,1074 / jbc.M109984200. PMID 11756452.
- Fong YW, Zhou Q (2002). "Stimulační účinek spojovacích faktorů na transkripční prodloužení". Příroda. 414 (6866): 929–33. doi:10.1038 / 414929a. PMID 11780068. S2CID 1518837.
- Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR a kol. (2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
- Baccon J, Pellizzoni L, Rappsilber J a kol. (2002). „Identifikace a charakterizace Gemin7, nové složky přežití komplexu motorických neuronů“. J. Biol. Chem. 277 (35): 31957–62. doi:10,1074 / jbc.M203478200. PMID 12065586.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Blagoev B, Kratchmarova I, Ong SE, et al. (2003). „Proteomická strategie k objasnění funkčních interakcí protein-protein aplikovaných na signalizaci EGF“. Nat. Biotechnol. 21 (3): 315–8. doi:10.1038 / nbt790. PMID 12577067. S2CID 26838266.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
