SNRPB - SNRPB
Malé nukleové ribonukleoproteiny asociované proteiny B a B ' je protein že u lidí je kódován SNRPB gen.[5][6]
Funkce
Protein kódovaný tímto genem je jedním z několika jaderných proteinů, které se běžně vyskytují u malých ribonukleoproteinových částic (snRNP) U1, U2, U4 / U6 a U5. Tyto snRNP jsou zapojeny do sestřihu pre-mRNA a kódovaný protein může také hrát roli v sestřihu pre-mRNA nebo struktuře snRNP. Autoprotilátky od pacientů se systémovým lupus erythematodes často rozpoznávají epitopy na kódovaném proteinu. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy (B a B ').[6]
Interakce
SNRPB bylo prokázáno komunikovat s DDX20[7] a Coilin.[8]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125835 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027404 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Griffith AJ, Schmauss C, Craft J (červenec 1992). „Myší gen kódující vysoce konzervovaný protein Sm B obsahuje nefunkční alternativní 3 'sestřihové místo“. Gen. 114 (2): 195–201. doi:10.1016/0378-1119(92)90574-9. PMID 1376292.
- ^ A b „Entrez Gene: SNRPB malé nukleární ribonukleoproteinové polypeptidy B a B1“.
- ^ Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (prosinec 1999). „Gemin3: Nový DEAD box protein, který interaguje s SMN, produktem genu spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. PMC 2168095. PMID 10601333.
- ^ Hebert MD, Szymczyk PW, Shpargel KB, Matera AG (říjen 2001). „Coilin tvoří most mezi Cajalovými těly a SMN, proteinem spinální svalové atrofie“. Genes Dev. 15 (20): 2720–9. doi:10,1101 / gad.908401. PMC 312817. PMID 11641277.
Další čtení
- Will CL, Lührmann R (2001). "Spliceosomální biogeneze, struktura a funkce UsnRNP". Curr. Opin. Cell Biol. 13 (3): 290–301. doi:10.1016 / S0955-0674 (00) 00211-8. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-F770-0. PMID 11343899.
- Schmauss C, Lerner MR (1990). „Blízce příbuzné malé nukleární ribonukleoproteinové polypeptidy N a B / B 'lze odlišit protilátkami i rozdíly v jejich mRNA a genových strukturách“. J. Biol. Chem. 265 (18): 10733–9. PMID 1693924.
- Elkon KB, Hines JJ, Chu JL, Parnassa A (1990). "Epitopové mapování rekombinantních HeLa SmB a B 'peptidů získaných polymerázovou řetězovou reakcí". J. Immunol. 145 (2): 636–43. PMID 1694885.
- Chu JL, Elkon KB (1991). „Malé nukleární ribonukleoproteiny, SmB a B ', jsou produkty jediného genu.“ Gen. 97 (2): 311–2. doi:10.1016 / 0378-1119 (91) 90069-N. PMID 1825643.
- Sharpe NG, Williams DG, Latchman DS (1990). "Regulovaná exprese malého nukleového ribonukleoproteinového proteinového proteinu SmN v diferenciaci embryonálních kmenových buněk". Mol. Buňka. Biol. 10 (12): 6817–20. doi:10.1128 / mcb.10.12.6817. PMC 362965. PMID 2174118.
- Schmauss C, McAllister G, Ohosone Y, Hardin JA, Lerner MR (1989). „Porovnání Sm-autoantigenů asociovaných se snRNP: lidský N, potkaní N a lidský B / B'". Nucleic Acids Res. 17 (4): 1733–43. doi:10.1093 / nar / 17.4.1733. PMC 331831. PMID 2522186.
- Feeney RJ, Sauterer RA, Feeney JL, Zieve GW (1989). "Cytoplazmatické shromáždění a jaderná akumulace zralých malých jaderných ribonukleoproteinových částic". J. Biol. Chem. 264 (10): 5776–83. PMID 2522439.
- Ohosone Y, Mimori T, Griffith A, Akizuki M, Homma M, Craft J, Hardin JA (1989). "Molekulární klonování cDNA kódující Sm autoantigen: derivace cDNA pro B polypeptid U série malých jaderných ribonukleoproteinových částic". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (11): 4249–53. Bibcode:1989PNAS ... 86,4249O. doi:10.1073 / pnas.86.11.4249. PMC 287428. PMID 2524838.
- van Dam A, Winkel I, Zijlstra-Baalbergen J, Smeenk R, Cuypers HT (1989). "Klonované lidské snRNP proteiny B a B 'se liší pouze ve své karboxy-terminální části". EMBO J.. 8 (12): 3853–60. doi:10.1002 / j.1460-2075.1989.tb08563.x. PMC 402073. PMID 2531083.
- Huntriss JD, Latchman DS, Williams DG (1993). „Autoprotilátky proti lupusu rozlišují mezi vysoce homologními Sm polypeptidy B / B 'a SmN vazbou na epitop omezený na B / B'". Clin. Exp. Immunol. 92 (2): 263–7. doi:10.1111 / j.1365-2249.1993.tb03390.x. PMC 1554819. PMID 7683587.
- Gerrelli D, Grimaldi K, Horn D, Mahadeva U, Sharpe N, Latchman DS (1993). „Srdeční forma tkáňově specifického proteinu SmN je identická s mozkovou a embryonální formou proteinu“. J. Mol. Buňka. Cardiol. 25 (3): 321–9. doi:10.1006 / jmcc.1993.1038. PMID 8510173.
- Simons A, Melamed-Bessudo C, Wolkowicz R, Sperling J, Sperling R, Eisenbach L, Rotter V (1997). „PACT: klonování a charakterizace buněčného proteinu vázajícího p53, který interaguje s Rb“. Onkogen. 14 (2): 145–55. doi:10.1038 / sj.onc.1200825. PMID 9010216.
- Liu Q, Fischer U, Wang F, Dreyfuss G (1997). „Produkt genu pro spinální muskulární atrofii, SMN, a jeho přidružený protein SIP1 jsou v komplexu s proteiny spliceosomal snRNP.“ Buňka. 90 (6): 1013–21. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80367-0. PMID 9323129. S2CID 10855404.
- Fury MG, Zhang W, Christodoulopoulos I, Zieve GW (1997). "Více proteinů: interakce proteinů mezi bílkovinami snRNP společného jádra". Exp. Cell Res. 237 (1): 63–9. doi:10.1006 / excr.1997.3750. PMID 9417867.
- Bedford MT, Reed R, Leder P (1998). „Interakce zprostředkované WW doménou odhalují protein spojený s spliceosomy, který váže třetí třídu motivu bohatého na prolin: motiv bohatý na prolin glycin a methionin“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (18): 10602–7. Bibcode:1998PNAS ... 9510602B. doi:10.1073 / pnas.95.18.10602. PMC 27941. PMID 9724750.
- Kambach C, Walke S, Young R, Avis JM, de la Fortelle E, Raker VA, Lührmann R, Li J, Nagai K (1999). "Krystalové struktury dvou proteinových komplexů Sm a jejich důsledky pro sestavení spliceosomálních snRNP". Buňka. 96 (3): 375–87. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80550-4. PMID 10025403. S2CID 17379935.
- Gray TA, Smithwick MJ, Schaldach MA, Martone DL, Graves JA, McCarrey JR, Nicholls RD (1999). "Společná regulace a molekulární evoluce duplikovaných lokusů SNRPB '/ B a SNRPN". Nucleic Acids Res. 27 (23): 4577–84. doi:10.1093 / nar / 27.23.4577. PMC 148745. PMID 10556313.
- Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (1999). „Gemin3: Nový DEAD box protein, který interaguje s SMN, produktem genu spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. PMC 2168095. PMID 10601333.
- Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Yong J, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (2000). „Gemin4. Nová složka komplexu SMN, která se nachází jak v drahokamech, tak v jadérech“. J. Cell Biol. 148 (6): 1177–86. doi:10.1083 / jcb.148.6.1177. PMC 2174312. PMID 10725331.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |