SMC4 - SMC4

SMC4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4U4P
Identifikátory
Aliasy	SMC4, CAP-C, CAPC, SMC-4, SMC4L1, hCAP-C, strukturní údržba chromozomů 4
Externí ID	OMIM: 605575 MGI: 1917349 HomoloGene: 4015 Genové karty: SMC4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	160,434,954 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	69,034,623 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita heterodimerizace proteinu; • vazba nukleotidů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • jednořetězcová vazba DNA;
Buněčná složka	• chromozóm; • buněčné jádro; • kondenzinový komplex; • nukleoplazma; • cytoplazma; • cytosol; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• mitotická segregace sesterských chromatid; • meiotická segregace chromozomů; • buněčné dělení; • buněčný cyklus; • kinetochore organizace; • kondenzace mitotických chromozomů; • kondenzace meiotického chromozomu; • kondenzace chromozomů; • organizace chromozomů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10051
	70099
	ENSG00000113810
	ENSMUSG00000034349
	Q9NTJ3
	Q8CG47
	NM_001002799; NM_001002800; NM_001288753; NM_005496
	NM_133786; NM_001356976
	NP_001002800; NP_001275682; NP_005487
	NP_598547; NP_001343905
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Strukturální údržba proteinu chromozomů 4 (SMC-4) také známý jako polypeptid asociovaný s chromozomy C (CAP-C) nebo XCAP-C homolog je protein že u lidí je kódován SMC4 gen.^[5]^[6]^[7] SMC-4 je základní podjednotkou kondenzin I a II, velké proteinové komplexy podílející se na kondenzaci chromozomů.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113810 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034349 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Schmiesing JA, Ball AR Jr, Gregson HC, Alderton JM, Zhou S, Yokomori K (listopad 1998). "Identifikace dvou odlišných komplexů lidských SMC proteinů zapojených do dynamiky mitotických chromozomů". Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (22): 12906–11. doi:10.1073 / pnas.95.22.12906. PMC 23650. PMID 9789013.
^ Nishiwaki T, Daigo Y, Kawasoe T, Nagasawa Y, Ishiguro H, Fujita M, Furukawa Y, Nakamura Y (červen 1999). „Izolace a charakterizace lidské cDNA homologní s genem XCAP-C Xenopus laevis patřícím do rodiny strukturních udržování chromozomů (SMC)“. J Hum Genet. 44 (3): 197–202. doi:10,1007 / s100380050142. PMID 10319587.
^ "Entrez Gene: SMC4 strukturní údržba chromozomů 4".

Další čtení

Hirano T (2002). „ABC proteinů SMC: dvouramenné ATPázy pro kondenzaci, soudržnost a opravu chromozomů“. Genes Dev. 16 (4): 399–414. doi:10,1101 / gad.955102. PMID 11850403.
Ball Jr AR, Yokomori K (2001). "Strukturální udržování rodiny proteinů chromozomů (SMC) u savců". Chromosome Res. 9 (2): 85–96. doi:10.1023 / A: 1009287518015. PMID 11321372. S2CID 23761326.
Ham MF, Takakuwa T, Rahadiani N, et al. (2007). „Kondenzinové mutace a abnormální chromozomální struktury v lymfomu spojeném s pyotoraxem“. Cancer Sci. 98 (7): 1041–7. doi:10.1111 / j.1349-7006.2007.00500.x. PMID 17488335. S2CID 25888221.
Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G a kol. (2006). „Fosfoproteomová analýza lidského mitotického vřetena“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103 (14): 5391–6. doi:10.1073 / pnas.0507066103. PMC 1459365. PMID 16565220.
Geiman TM, Sankpal UT, Robertson AK a kol. (2004). „Izolace a charakterizace nového komplexu DNA methyltransferázy spojujícího DNMT3B se složkami kondenzačního aparátu mitotických chromozomů“. Nucleic Acids Res. 32 (9): 2716–29. doi:10.1093 / nar / gkh589. PMC 419596. PMID 15148359.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Kimura K, Cuvier O, Hirano T (2001). „Kondenzace chromozomu lidským kondenzátovým komplexem ve vaječných extraktech z Xenopus“. J. Biol. Chem. 276 (8): 5417–20. doi:10,1074 / jbc.C000873200. PMID 11136719.
Schmiesing JA, Gregson HC, Zhou S, Yokomori K (2000). „Komplex lidského kondenzátu obsahující hCAP-C – hCAP-E a CNAP1, homolog Xenopus XCAP-D2, kolokalizuje s fosforylovaným histonem H3 během rané fáze kondenzace mitotických chromozomů“. Mol. Buňka. Biol. 20 (18): 6996–7006. doi:10.1128 / MCB.20.18.6996-7006.2000. PMC 88774. PMID 10958694.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.

externí odkazy

SMC4 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
SMC4 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro udržování lidské struktury chromozomů protein 4 (SMC4)
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro Myší strukturní údržbu proteinu chromozomů 4 (SMC4)

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113810 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034349 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9789013-5] Schmiesing JA, Ball AR Jr, Gregson HC, Alderton JM, Zhou S, Yokomori K (listopad 1998). "Identifikace dvou odlišných komplexů lidských SMC proteinů zapojených do dynamiky mitotických chromozomů". Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (22): 12906–11. doi:10.1073 / pnas.95.22.12906. PMC 23650. PMID 9789013.

[pmid10319587-6] Nishiwaki T, Daigo Y, Kawasoe T, Nagasawa Y, Ishiguro H, Fujita M, Furukawa Y, Nakamura Y (červen 1999). „Izolace a charakterizace lidské cDNA homologní s genem XCAP-C Xenopus laevis patřícím do rodiny strukturních udržování chromozomů (SMC)“. J Hum Genet. 44 (3): 197–202. doi:10,1007 / s100380050142. PMID 10319587.

[entrez-7] "Entrez Gene: SMC4 strukturní údržba chromozomů 4".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]