SNRPG - SNRPG

SNRPG
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3CW1, 3PGW, 3S6N, 4F7U, 4PJO, 4V98, 4WZJ, 3JCR
Identifikátory
Aliasy	SNRPGSMG, Sm-G, malý nukleový ribonukleoproteinový polypeptid G
Externí ID	OMIM: 603542 HomoloGene: 37730 Genové karty: SNRPG
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	70,293,740 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • SMN-Sm proteinový komplex; • cytosol; • katalytický krok 2 spliceosom; • spliceosomální tri-snRNP komplex; • U5 snRNP; • Spliceozomální komplex typu U12; • U2 snRNP; • methylosom; • U7 snRNP; • prekatalytický spliceosom; • malý nukleární ribonukleoproteinový komplex; • P granule; • spliceosomální komplex; • U4 snRNP; • Prespliceosom typu U2; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • U1 snRNP; • Komplex U4 / U6 x U5 tri-snRNP; • Prekatalytický spliceosom typu U2; • Spliceosom katalytického kroku 2 typu U2;
Biologický proces	• ukončení transkripce RNA polymerázy II; • Zpracování mRNA; • sestava spliceozomálního komplexu; • Sestřih RNA; • metabolický proces histonové mRNA; • jaderný dovoz; • sestava spliceosomal snRNP; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6637
	n / a
	ENSG00000143977
	n / a
	P62308; Q49AN9
	n / a
NM_003096; NM_001317165; NM_001317166; NM_001317167; NM_001317168;
	NM_001317169; NM_001317171
	n / a
NP_001304094; NP_001304095; NP_001304096; NP_001304097; NP_001304098;
	NP_001304100; NP_003087; NP_001304097.1; NP_001304098.1
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Malý nukleární ribonukleoprotein G. je protein že u lidí je kódován SNRPG gen.^[3]^[4]

Interakce

Bylo prokázáno, že SNRPG komunikovat s DDX20^[5] a TACC1.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143977 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hermann H, Fabrizio P, Raker VA, Foulaki K, Hornig H, Brahms H, Lührmann R (červen 1995). "Sn proteiny SmRNP sdílejí dva evolučně konzervované sekvenční motivy, které se účastní interakcí proteinu Sm". EMBO J.. 14 (9): 2076–88. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07199.x. PMC 398308. PMID 7744013.
^ „Entrez Gene: SNRPG malý nukleární ribonukleoproteinový polypeptid G“.
^ Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (prosinec 1999). „Gemin3: Nový DEAD box protein, který interaguje s SMN, produktem genu spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. PMC 2168095. PMID 10601333.
^ Conte N, Charafe-Jauffret E, Delaval B, Adélaïde J, Ginestier C, Geneix J, Isnardon D, Jacquemier J, Birnbaum D (srpen 2002). „Karcinogeneze a translační kontroly: TACC1 je u lidských zhoubných nádorů a asociací s regulátory mRNA snížena“. Onkogen. 21 (36): 5619–30. doi:10.1038 / sj.onc.1205658. PMID 12165861.

Další čtení

Heinrichs V, Hackl W, Lührmann R (1992). "Přímá vazba malého nukleárního ribonukleoproteinu G na místo Sm malé jaderné RNA. Zesíťování proteinu G ultrafialovým světlem na úsek AAU v místě Sm (AAUUUGUGG) malého jaderného ribonukleoproteinu U1 rekonstituovaného in vitro". J. Mol. Biol. 227 (1): 15–28. doi:10.1016 / 0022-2836 (92) 90678-D. PMID 1387914.
Plessel G, Lührmann R, Kastner B (1997). „Elektronová mikroskopie montážních meziproduktů jádra snRNP: morfologické podobnosti mezi heteromerem proteinu bez RNA (E.F.G) a neporušeným jádrem snRNP“. J. Mol. Biol. 265 (2): 87–94. doi:10.1006 / jmbi.1996.0713. PMID 9020971.
Fury MG, Zhang W, Christodoulopoulos I, Zieve GW (1997). "Více proteinů: interakce proteinů mezi běžnými jádrovými proteiny snRNP". Exp. Cell Res. 237 (1): 63–9. doi:10.1006 / excr.1997.3750. PMID 9417867.
Bühler D, Raker V, Lührmann R, Fischer U (1999). „Základní role pro tudorovu doménu SMN v sestavě spliceozomálního U snRNP: důsledky pro spinální svalovou atrofii“. Hučení. Mol. Genet. 8 (13): 2351–7. doi:10,1093 / hmg / 8,13 2351. PMID 10556282.
Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (1999). „Gemin3: Nový DEAD box protein, který interaguje s SMN, produktem genu spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. PMC 2168095. PMID 10601333.
Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Yong J, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (2000). „Gemin4. Nová složka komplexu SMN, která se nachází jak v drahokamech, tak v jadérech“. J. Cell Biol. 148 (6): 1177–86. doi:10.1083 / jcb.148.6.1177. PMC 2174312. PMID 10725331.
Urlaub H, Raker VA, Kostka S, Lührmann R (2001). „Interakce RNA proteinu-Sm ve vnitřním kruhu spliceosomální struktury jádra snRNP“. EMBO J.. 20 (1–2): 187–96. doi:10.1093 / emboj / 20.1.187. PMC 140196. PMID 11226169.
Pellizzoni L, Baccon J, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (2002). „Čištění přirozeného přežití komplexů motorických neuronů a identifikace Gemin6 jako nové složky“. J. Biol. Chem. 277 (9): 7540–5. doi:10,1074 / jbc.M110141200. PMID 11748230.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Conte N, Charafe-Jauffret E, Delaval B, Adélaïde J, Ginestier C, Geneix J, Isnardon D, Jacquemier J, Birnbaum D (2002). „Karcinogeneze a translační kontroly: TACC1 je u lidských zhoubných nádorů a asociací s regulátory mRNA snížena“. Onkogen. 21 (36): 5619–30. doi:10.1038 / sj.onc.1205658. PMID 12165861.
Conte N, Delaval B, Ginestier C, Ferrand A, Isnardon D, Larroque C, Prigent C, Séraphin B, Jacquemier J, Birnbaum D (2003). "TACC1-chTOG-Aurora A proteinový komplex u rakoviny prsu". Onkogen. 22 (50): 8102–16. doi:10.1038 / sj.onc.1206972. PMID 14603251.
Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Lührmann R (2004). „Lidský 18S U11 / U12 snRNP obsahuje sadu nových proteinů, které nebyly nalezeny ve spliceozomu závislém na U2“. RNA. 10 (6): 929–41. doi:10,1261 / rna.7320604. PMC 1370585. PMID 15146077.
Ma Y, Dostie J, Dreyfuss G, Van Duyne GD (2005). „Heterodimer Gemin6-Gemin7 z přežití komplexu motorických neuronů má strukturu podobnou proteinu Sm“. Struktura. 13 (6): 883–92. doi:10.1016 / j.str.2005.03.014. PMID 15939020.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P62308 (Malý nukleární ribonukleoprotein G) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143977 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7744013-3] Hermann H, Fabrizio P, Raker VA, Foulaki K, Hornig H, Brahms H, Lührmann R (červen 1995). "Sn proteiny SmRNP sdílejí dva evolučně konzervované sekvenční motivy, které se účastní interakcí proteinu Sm". EMBO J.. 14 (9): 2076–88. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07199.x. PMC 398308. PMID 7744013.

[entrez-4] „Entrez Gene: SNRPG malý nukleární ribonukleoproteinový polypeptid G“.

[pmid10601333-5] Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (prosinec 1999). „Gemin3: Nový DEAD box protein, který interaguje s SMN, produktem genu spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. PMC 2168095. PMID 10601333.

[pmid12165861-6] Conte N, Charafe-Jauffret E, Delaval B, Adélaïde J, Ginestier C, Geneix J, Isnardon D, Jacquemier J, Birnbaum D (srpen 2002). „Karcinogeneze a translační kontroly: TACC1 je u lidských zhoubných nádorů a asociací s regulátory mRNA snížena“. Onkogen. 21 (36): 5619–30. doi:10.1038 / sj.onc.1205658. PMID 12165861.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Protein vázající RNA: Ribonukleoproteiny
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70 tis /U1 spliceozomální RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Jiný přepis	Telomeráza
Překlad	Ribozom
Vault ribonukleoprotein částice	Hlavní protein trezoru
jiný	Částice pro rozpoznávání signálu