SMC2 - SMC2

SMC2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4U4P
Identifikátory
Aliasy	SMC2, CAP-E, CAPE, SMC-2, SMC2L1, strukturní údržba chromozomů 2
Externí ID	OMIM: 605576 MGI: 106067 HomoloGene: 4705 Genové karty: SMC2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	104,141,419 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	52,488,260 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • ATP vazba; • jednořetězcová vazba DNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • chromozóm; • nukleoplazma; • kondenzinový komplex; • nukleární chromozom; • jádro; • extracelulární exosom; • kondenzovaný chromozom; • buněčné jádro;
Biologický proces	• kinetochore organizace; • kondenzace meiotického chromozomu; • organizace chromozomů; • meiotická segregace chromozomů; • buněčné dělení; • kondenzace chromozomů; • buněčný cyklus; • kondenzace mitotických chromozomů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10592
	14211
	ENSG00000136824
	ENSMUSG00000028312
	O95347; Q05D74
	Q8CG48
	NM_001042550; NM_001042551; NM_001265602; NM_006444
	NM_001301412; NM_008017
	NP_001036015; NP_001036016; NP_001252531; NP_006435; NP_006435.2
	NP_001288341; NP_032043
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Strukturální údržba proteinu chromozomů 2 (SMC-2) také známý jako protein spojený s chromozomy E (CAP-E) je a protein že u lidí je kódován SMC2 gen.^[5]^[6]

SMC-2 je podjednotka kondenzin I a II, velké proteinové komplexy podílející se na kondenzaci chromozomů.

Interakce

Bylo prokázáno, že SMC2 komunikovat s DNMT3B.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136824 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028312 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Schmiesing JA, Ball AR, Gregson HC, Alderton JM, Zhou S, Yokomori K (říjen 1998). "Identifikace dvou odlišných komplexů lidských SMC proteinů zapojených do dynamiky mitotických chromozomů". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (22): 12906–11. doi:10.1073 / pnas.95.22.12906. PMC 23650. PMID 9789013.
^ "Entrez Gene: SMC2 strukturní údržba chromozomů 2".
^ Geiman TM, Sankpal UT, Robertson AK, Chen Y, Mazumdar M, Heale JT, Schmiesing JA, Kim W, Yokomori K, Zhao Y, Robertson KD (2004). „Izolace a charakterizace nového komplexu DNA methyltransferázy spojujícího DNMT3B se složkami kondenzačního aparátu mitotických chromozomů“. Výzkum nukleových kyselin. 32 (9): 2716–29. doi:10.1093 / nar / gkh589. PMC 419596. PMID 15148359.

Další čtení

Ham MF, Takakuwa T, Rahadiani N, Tresnasari K, Nakajima H, Aozasa K (červenec 2007). „Kondenzinové mutace a abnormální chromozomální struktury v lymfomu spojeném s pyotoraxem“. Cancer Science. 98 (7): 1041–7. doi:10.1111 / j.1349-7006.2007.00500.x. PMID 17488335. S2CID 25888221.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Geiman TM, Sankpal UT, Robertson AK, Chen Y, Mazumdar M, Heale JT, Schmiesing JA, Kim W, Yokomori K, Zhao Y, Robertson KD (2004). „Izolace a charakterizace nového komplexu DNA methyltransferázy spojujícího DNMT3B se složkami kondenzačního aparátu mitotických chromozomů“. Výzkum nukleových kyselin. 32 (9): 2716–29. doi:10.1093 / nar / gkh589. PMC 419596. PMID 15148359.
Przewloka MR, Pardington PE, Yannone SM, Chen DJ, Cary RB (únor 2003). „Interakce in vitro a in vivo DNA ligázy IV s podjednotkou kondenzinového komplexu“. Molekulární biologie buňky. 14 (2): 685–97. doi:10,1091 / mbc.E01-11-0117. PMC 150001. PMID 12589063.
Kimura K, Cuvier O, Hirano T (únor 2001). „Kondenzace chromozomu lidským kondenzátovým komplexem ve vaječných extraktech z Xenopus“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (8): 5417–20. doi:10,1074 / jbc.C000873200. PMID 11136719.
Schmiesing JA, Gregson HC, Zhou S, Yokomori K (září 2000). „Lidský kondenzinový komplex obsahující hCAP-C-hCAP-E a CNAP1, homolog Xenopus XCAP-D2, se v rané fázi kondenzace mitotického chromozomu kolokalizuje fosforylovaným histonem H3“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (18): 6996–7006. doi:10.1128 / MCB.20.18.6996-7006.2000. PMC 88774. PMID 10958694.

externí odkazy

PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro lidskou strukturní údržbu proteinu chromozomů 2
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro myší strukturní údržbu proteinu chromozomů 2

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136824 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028312 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9789013-5] Schmiesing JA, Ball AR, Gregson HC, Alderton JM, Zhou S, Yokomori K (říjen 1998). "Identifikace dvou odlišných komplexů lidských SMC proteinů zapojených do dynamiky mitotických chromozomů". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (22): 12906–11. doi:10.1073 / pnas.95.22.12906. PMC 23650. PMID 9789013.

[entrez-6] "Entrez Gene: SMC2 strukturní údržba chromozomů 2".

[pmid15148359-7] Geiman TM, Sankpal UT, Robertson AK, Chen Y, Mazumdar M, Heale JT, Schmiesing JA, Kim W, Yokomori K, Zhao Y, Robertson KD (2004). „Izolace a charakterizace nového komplexu DNA methyltransferázy spojujícího DNMT3B se složkami kondenzačního aparátu mitotických chromozomů“. Výzkum nukleových kyselin. 32 (9): 2716–29. doi:10.1093 / nar / gkh589. PMC 419596. PMID 15148359.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]