LSM2 - LSM2
Sm-like protein LSm2 spojený s U6 snRNA je protein že u lidí je kódován LSM2 gen.[5][6][7]
Funkce
Sm-podobné proteiny byly identifikovány v různých organismech na základě sekvenční homologie s rodinou proteinů Sm (viz SNRPD2; MIM 601061). Sm-podobné proteiny obsahují Sm sekvenční motiv, který se skládá ze 2 oblastí oddělených linkerem různé délky, který se skládá jako smyčka. Předpokládá se, že proteiny podobné Sm tvoří stabilní heteromer přítomný v částicích tri-snRNP, které jsou důležité pro sestřih pre-mRNA. [Dodáno společností OMIM][7]
Interakce
LSM2 bylo prokázáno komunikovat s DDX20,[8] LSM3,[9][10][11][12] LSM8[9][10] a LSM7.[9][10]
Reference
- ^ A b C ENSG00000204392, ENSG00000231502, ENSG00000172850, ENSG00000236826, ENSG00000224979 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000225998, ENSG00000204392, ENSG00000231502, ENSG0000017282, ENSG0000017282, ENSG0000017282, ENSG000001728 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000007050 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Achsel T, Brahms H, Kastner B, Bachi A, Wilm M, Lührmann R (říjen 1999). „Heteromer lidského proteinu podobného Sm ve tvaru koblihy se váže na 3'-konec U6 snRNA, čímž usnadňuje tvorbu duplexu U4 / U6 in vitro“. Časopis EMBO. 18 (20): 5789–802. doi:10.1093 / emboj / 18.20.5789. PMC 1171645. PMID 10523320.
- ^ Olavesen MG, Snoek M, Campbell RD (březen 1993). "Lokalizace nového genu sousedícího s geny HSP70 v lidských a myších MHC". Imunogenetika. 37 (5): 394–6. doi:10.1007 / BF00216806. PMID 8428774. S2CID 1809207.
- ^ A b "Entrez Gene: LSM2 LSM2 homolog, U6 spojená s malou jadernou RNA (S. cerevisiae)".
- ^ Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (prosinec 1999). „Gemin3: Nový DEAD box protein, který interaguje s SMN, produktem genu spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. The Journal of Cell Biology. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. PMC 2168095. PMID 10601333.
- ^ A b C Lehner B, Sanderson CM (červenec 2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Výzkum genomu. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
- ^ A b C Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (leden 2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
- ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E „Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.
Další čtení
- Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (prosinec 1999). „Gemin3: Nový DEAD box protein, který interaguje s SMN, produktem genu spinální svalové atrofie a je součástí drahokamů“. The Journal of Cell Biology. 147 (6): 1181–94. doi:10.1083 / jcb.147.6.1181. PMC 2168095. PMID 10601333.
- Friesen WJ, Dreyfuss G (srpen 2000). „Specifické sekvence proteinů Sm a Sm-like (Lsm) zprostředkovávají jejich interakci s genovým produktem onemocnění spinální svalové atrofie (SMN)“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (34): 26370–5. doi:10,1074 / jbc.M003299200. PMID 10851237.
- Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R „Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (srpen 2000). "Profilování genové exprese v ose lidského hypotalamu - hypofýzy - nadledvin a klonování cDNA plné délky". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS ... 97,9543H. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
- Eystathioy T, Peebles CL, Hamel JC, Vaughn JH, Chan EK (březen 2002). "Autoprotilátka proti hLSm4 a heptamernímu LSm komplexu v anti-Sm séru". Artritida a revmatismus. 46 (3): 726–34. doi:10.1002 / čl. 12220. PMID 11920408.
- Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (duben 2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
- Ingelfinger D, Arndt-Jovin DJ, Lührmann R, Achsel T (prosinec 2002). „Lidské proteiny LSm1-7 se kolokalizují s enzymy degradujícími mRNA Dcp1 / 2 a Xrnl v odlišných cytoplazmatických ložiscích.“. RNA. 8 (12): 1489–501. doi:10.1017 / S1355838202021726 (neaktivní 11. 10. 2020). PMC 1370355. PMID 12515382.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)
- Xie T, Rowen L, Aguado B, Ahearn ME, Madan A, Qin S, Campbell RD, Hood L (prosinec 2003). „Analýza oblasti genově hustého hlavního histokompatibilního komplexu třídy III a její srovnání s myší“. Výzkum genomu. 13 (12): 2621–36. doi:10,1101 / gr. 1736803. PMC 403804. PMID 14656967.
- Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (leden 2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
- Lehner B, Sanderson CM (červenec 2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Výzkum genomu. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
- Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (leden 2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Přírodní biotechnologie. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E „Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
externí odkazy
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9Y333 (U6 snRNA asociovaný Sm-like protein LSm2) na PDBe-KB.
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |