NUP98 - NUP98
Protein komplexu jaderných pórů Nup98-Nup96 je protein že u lidí je kódován NUP98 gen.[5]
Funkce
Signálem zprostředkovaný import a export jaderných zbraní probíhá prostřednictvím komplexu jaderných pórů (NPC), který je složen z přibližně 30 jedinečných proteinů souhrnně známých jako nukleoporiny. Nukleoporin o molekulové hmotnosti 98 kD je generován cestou biogeneze, která zahrnuje syntézu a proteolytické štěpení 186 kD prekurzorového proteinu. Toto štěpení vede k nukleoporinu 98 kD i nukleoporinu 96 kD, oba jsou lokalizovány na nukleoplazmatické straně NPC. Studie na potkanech ukazují, že 98 kD nukleoporin funguje jako jeden z několika nukleoporinů dokovacích míst transportních substrátů. Bylo prokázáno, že lidský gen fúzuje s několika geny po translokacích chromozomů u akutní myeloidní leukémie (AML) a akutní lymfocytární leukémie T-buněk (T-ALL). Tento gen je jedním z několika genů umístěných v potištěné genové doméně 11p15.5, důležité oblasti potlačující nádory. Změny v této oblasti byly spojeny s Beckwith-Wiedemannovým syndromem, Wilmsovým nádorem, rhabdomyosarkomem, adrenokortikálním karcinomem a rakovinou plic, vaječníků a prsu. Alternativní sestřih tohoto genu vede k několika variantám transkriptu; ne všechny varianty však byly plně popsány.[6]
Interakce
NUP98 bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110713 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000063550 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Arai Y, Hosoda F, Kobayashi H, Arai K, Hayashi Y, Kamada N, Kaneko Y, Ohki M (červen 1997). „Translokace chromozomu inv (11) (p15q22) de novo a myeloidních malignit souvisejících s léčbou vede k fúzi genu nukleoporinu, NUP98, s domnělým genem RNA helikázy, DDX10.“ Krev. 89 (11): 3936–44. doi:10,1182 / krev. V89.11.3936. PMID 9166830.
- ^ „Entrez Gene: NUP98 nukleoporin 98 kDa“.
- ^ Kasper LH, Brindle PK, Schnabel CA, Pritchard CE, Cleary ML, van Deursen JM (leden 1999). „CREB vazebný protein interaguje s nukleoporinově specifickými FG opakováními, které aktivují transkripci a zprostředkovávají onkogenicitu NUP98-HOXA9“. Mol. Buňka. Biol. 19 (1): 764–76. doi:10,1128 / mcb.19.1.764. PMC 83933. PMID 9858599.
- ^ Moroianu J, Blobel G, Radu A (září 1997). „RanGTP zprostředkovaný jaderný export karyofherinu alfa zahrnuje jeho interakci s nukleoporinem Nup153“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (18): 9699–704. doi:10.1073 / pnas.94.18.9699. PMC 23253. PMID 9275187.
- ^ Bonifaci N, Moroianu J, Radu A, Blobel G (květen 1997). „Karyopherin beta2 zprostředkovává jaderný import proteinu vázajícího mRNA“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (10): 5055–60. doi:10.1073 / pnas.94.10.5055. PMC 24630. PMID 9144189.
- ^ Griffis ER, Xu S, Powers MA (únor 2003). „Nup98 se lokalizuje na jaderné i cytoplazmatické straně jaderného póru a váže se na dva odlišné nukleoporinové subkomplexy“. Mol. Biol. Buňka. 14 (2): 600–10. doi:10,1091 / mbc.E02-09-0582. PMC 149995. PMID 12589057.
- ^ Pritchard CE, Fornerod M, Kasper LH, van Deursen JM (duben 1999). „RAE1 je převáděcí faktor exportující mRNA, který se váže na motiv NUP98 podobný GLEBS v komplexu jaderných pórů prostřednictvím více domén“. J. Cell Biol. 145 (2): 237–54. doi:10.1083 / jcb.145.2.237. PMC 2133102. PMID 10209021.
- ^ Fontoura BM, Blobel G, Yaseen NR (říjen 2000). „Nukleoporin Nup98 je místem pro výměnu GDP / GTP při běhu a ukončení jaderného importu zprostředkovaného karyofherinem beta 2“. J. Biol. Chem. 275 (40): 31289–96. doi:10,1074 / jbc.M004651200. PMID 10875935.
Další čtení
- Slape C, Aplan PD (2004). "Úloha fúzí genů NUP98 při hematologické malignitě". Leuku. Lymfom. 45 (7): 1341–50. doi:10.1080/10428190310001659325. PMID 15359631. S2CID 20926084.
- Moore MA, Chung KY, Plasilova M, Schuringa JJ, Shieh JH, Zhou P, Morrone G (2007). "NUP98 dysregulace v myeloidní leukemogenezi". Ann. N. Y. Acad. Sci. 1106: 114–42. doi:10.1196 / annals.1392.019. PMID 17442773. S2CID 25039911.
- Radu A, Moore MS, Blobel G (1995). "Peptidová repetiční doména nukleoporinu Nup98 funguje jako dokovací místo v transportu přes komplex jaderných pórů". Buňka. 81 (2): 215–22. doi:10.1016/0092-8674(95)90331-3. PMID 7736573. S2CID 19024872.
- Nakamura T, Largaespada DA, Lee MP, Johnson LA, Ohyashiki K, Toyama K, Chen SJ, Willman CL, Chen IM, Feinberg AP, Jenkins NA, Copeland NG, Shaughnessy JD (1996). „Fúze nukleoporinového genu NUP98 na HOXA9 translokací chromozomu t (7; 11) (p15; p15) v lidské myeloidní leukémii“. Nat. Genet. 12 (2): 154–8. doi:10.1038 / ng0296-154. PMID 8563753. S2CID 6400265.
- Borrow J, Shearman AM, Stanton VP, Becher R, Collins T, Williams AJ, Dubé I, Katz F, Kwong YL, Morris C, Ohyashiki K, Toyama K, Rowley J, Housman DE (1996). „Translokace t (7; 11) (p15; p15) u akutní myeloidní leukémie fúzuje geny pro nukleoporin NUP98 a homeoprotein třídy I HOXA9.“ Nat. Genet. 12 (2): 159–67. doi:10.1038 / ng0296-159. PMID 8563754. S2CID 21252465.
- Hu T, Guan T, Gerace L (1996). „Molekulární a funkční charakterizace komplexu p62, sestavy glykoproteinů komplexu nukleárních pórů“. J. Cell Biol. 134 (3): 589–601. doi:10.1083 / jcb.134.3.589. PMC 2120945. PMID 8707840.
- Stutz F, Izaurralde E, Mattaj IW, Rosbash M (1996). „Role opakujících se domén nukleoporinových FG při exportu proteinu a RNA viru lidské imunodeficience typu 1 a RNA z jádra“. Mol. Buňka. Biol. 16 (12): 7144–50. doi:10,1128 / mcb.16.12.7144. PMC 231718. PMID 8943370.
- Yaseen NR, Blobel G (1997). "Klonování a charakterizace lidského karyofherinu beta3". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (9): 4451–6. doi:10.1073 / pnas.94.9.4451. PMC 20743. PMID 9114010.
- Bonifaci N, Moroianu J, Radu A, Blobel G (1997). „Karyopherin beta2 zprostředkovává jaderný import proteinu vázajícího mRNA“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (10): 5055–60. doi:10.1073 / pnas.94.10.5055. PMC 24630. PMID 9144189.
- Grandi P, Dang T, Pané N, Shevchenko A, Mann M, Forbes D, Hurt E (1997). „Nup93, homolog obratlovců kvasinek Nic96p, tvoří komplex s novým proteinem 205 kDa a je vyžadován pro správné sestavení jaderných pórů“. Mol. Biol. Buňka. 8 (10): 2017–38. doi:10.1091 / mbc.8.10.2017. PMC 25664. PMID 9348540.
- Zolotukhin AS, Felber BK (1999). „Nukleoporiny nup98 a nup214 se účastní jaderného exportu viru lidské imunodeficience typu 1 Rev“. J. Virol. 73 (1): 120–7. doi:10.1128 / JVI.73.1.120-127.1999. PMC 103815. PMID 9847314.
- Kasper LH, Brindle PK, Schnabel CA, Pritchard CE, Cleary ML, van Deursen JM (1999). „CREB vazebný protein interaguje s nukleoporinově specifickými FG opakováními, které aktivují transkripci a zprostředkovávají onkogenicitu NUP98-HOXA9“. Mol. Buňka. Biol. 19 (1): 764–76. doi:10,1128 / mcb.19.1.764. PMC 83933. PMID 9858599.
- Fontoura BM, Blobel G, Matunis MJ (1999). „Konzervovaná cesta biogeneze pro nukleoporiny: proteolytické zpracování 186 kilodaltonového prekurzoru generuje Nup98 a nový nukleoporin, Nup96“. J. Cell Biol. 144 (6): 1097–112. doi:10.1083 / jcb.144.6.1097. PMC 2150585. PMID 10087256.
- Pritchard CE, Fornerod M, Kasper LH, van Deursen JM (1999). „RAE1 je převáděcí faktor exportující mRNA, který se váže na motiv NUP98 podobný GLEBS v komplexu jaderných pórů prostřednictvím více domén“. J. Cell Biol. 145 (2): 237–54. doi:10.1083 / jcb.145.2.237. PMC 2133102. PMID 10209021.
- Ahuja HG, Felix CA, Aplan PD (1999). „Chromozomální translokace t (11; 20) (p15; q11) spojená s myelodysplastickým syndromem souvisejícím s terapií vede k fúzi NUP98-TOP1.“ Krev. 94 (9): 3258–61. doi:10.1182 / krev. V94.9.3258. PMID 10556215.
- Bachi A, Braun IC, Rodrigues JP, Panté N, Ribbeck K, von Kobbe C, Kutay U, Wilm M, Görlich D, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (2000). „C-koncová doména TAP interaguje s komplexem jaderných pórů a podporuje export specifických substrátů RNA nesoucích CTE“. RNA. 6 (1): 136–58. doi:10.1017 / S1355838200991994. PMC 1369901. PMID 10668806.
- Fontoura BM, Blobel G, Yaseen NR (2000). „Nukleoporin Nup98 je místem pro výměnu GDP / GTP při běhu a ukončení jaderného importu zprostředkovaného karyofherinem beta 2“. J. Biol. Chem. 275 (40): 31289–96. doi:10,1074 / jbc.M004651200. PMID 10875935.
- Rodrigues JP, Sitterlin D, Bachi A, Wu X, Wilm M, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (2000). „Protein matrice viru vezikulární stomatitidy inhibuje expresi genu hostitelské buňky zaměřením na nukleoporin Nup98“. Mol. Buňka. 6 (5): 1243–52. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00120-9. PMID 11106761.
- Hofmann W, Reichart B, Ewald A, Müller E, Schmitt I, Stauber RH, Lottspeich F, Jockusch BM, Scheer U, Hauber J, Dabauvalle MC (2001). „Požadavky na kofaktor pro jaderný export prvku Rev response element (RRE) - a retrovirových RNA obsahujících konstitutivní transportní prvek (CTE). Neočekávaná role aktinu“. J. Cell Biol. 152 (5): 895–910. doi:10.1083 / jcb.152.5.895. PMC 2198816. PMID 11238447.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
