Joomyeong Kim - Joomyeong Kim

Joomyeong Kim
Joomyeong Kim.jpg
Profesor Joomyeong Kim
narozený
Joomyeong Kim
NárodnostAmerický / jiho-korejský
VzděláváníLSU Medical Center v New Orleans, LA (Ph. D.)
Soulská národní univerzita (M.S., B.S.)
Alma materLSU Medical Center v New Orleans, LA (Ph. D., 1995)
Vědecká kariéra
PoleGenomický otisk; Epigenetika
InstituceNárodní laboratoř v Oak Ridge
Lawrence Livermore National Laboratory
Louisianská státní univerzita

Joomyeong Kim je Russell Thompson, Jr. rodinný profesor biologie na Louisianská státní univerzita. Mezi jeho výzkumné zájmy patří genomový otisk a epigenetika. Laboratoř Dr. Kim se zabývá hlavně pochopením funkcí a regulačních mechanismů, jimiž se řídí geny, kterým podléhá genomový otisk.[1] Poté, co dříve charakterizoval vtisknutou doménu umístěnou na proximálním myším chromozomu 7 / lidském chromozomu 19q13.4, se jeho laboratoř v současné době zaměřuje na pochopení regulačních mechanismů směřujících mono alelickou expresi sedmi otištěných genů v klastru: Peg3, Usp29, Zfp264, APeg3 ( otcovsky vyjádřeno) a Zim1, Zim2, Zim3 (vyjádřeno mateřsky).[2][3][4][5][6][7][8] Jako druhý směr projektu studuje jeho laboratoř funkci dominantního genu v klastru Peg3 jako regulátor transkripce.[9][10][11][12] Minulé projekty v laboratoři Kim zahrnovaly studium epigenetické nestability potištěných genů během tumorigeneze,[13][14][15] potenciální role AEBP2 jako PRC2 zaměřené na bílkoviny a ve vývoji buněk nervového hřebenu,[16][17][18] stejně jako metylace DNA myší a člověka retrotranspozony.[19][20]


Vzdělávání

Vybrané publikace

  • Kim J, Ekram MB, Kim H, Faisal M, Frey WD, Huang JM, Tran K, Kim MM, Yu S (2012). „Otisk kontrolní oblasti (ICR) domény Peg3“. Hum Mol Genet. 21 (12): 2677–87. doi:10,1093 / hmg / dds092. PMC  3363340. PMID  22394678.
  • Thiaville MM, Kim H, Frey WD, Kim J (2013). „Identifikace evolučně konzervovaného cis-regulačního prvku ovládajícího doménu s potiskem Peg3“. PLOS ONE. 8 (9): e75417. doi:10.1371 / journal.pone.0075417. PMC  3769284. PMID  24040411.
  • Kim J, Frey WD, He H, Kim H, Ekram MB, Bakshi A, Faisal M, Perera BP, Ye A, Teruyama R (2013). „Mutační účinky Peg3 na reprodukci a rodiny genů specifických pro placentu“. PLOS ONE. 8 (12): e83359. doi:10.1371 / journal.pone.0083359. PMC  3877027. PMID  24391757.
  • Thiaville MM, Huang JM, Kim H, Ekram MB, Roh TY, Kim J (leden 2013). "Motiv vázající DNA a cílové geny potištěného transkripčního faktoru PEG3". Gen. 512 (2): 314–20. doi:10.1016 / j.gene.2012.10.005. PMC  3513644. PMID  23078764.

Reference

  1. ^ „Joomyeong Kim“. Citováno 15. listopadu 2017.
  2. ^ Kim J, Ekram MB, Kim H, Faisal M, Frey WD, Huang JM, Tran K, Kim MM, Yu S (2012). „Otisk kontrolní oblasti (ICR) domény Peg3“. Hum Mol Genet. 21 (12): 2677–87. doi:10,1093 / hmg / dds092. PMC  3363340. PMID  22394678.
  3. ^ Thiaville MM, Kim H, Frey WD, Kim J (2013). „Identifikace evolučně konzervovaného cis-regulačního prvku ovládajícího doménu s potiskem Peg3“. PLOS ONE. 8 (9): e75417. doi:10.1371 / journal.pone.0075417. PMC  3769284. PMID  24040411.
  4. ^ Kim J, Ye A (2016). „Fylogenetická a epigenetická stopa domnělých zesilovačů domény Peg3“. PLOS ONE. 11 (4): e0154216. doi:10.1371 / journal.pone.0154216. PMC  4841594. PMID  27104590.
  5. ^ Perera BP, Kim J (2016). „Alternativní propagátoři Peg3 s mateřskou specifičností“. Sci Rep. 6: 24438. doi:10.1038 / srep24438. PMC  4830991. PMID  27075691.
  6. ^ He H, Perera BP, Ye A, Kim J (2016). „Rodičovské a sexuální konflikty o doménu opatřenou Peg3“. Sci Rep. 6: 38136. doi:10.1038 / srep38136. PMC  128876. PMID  27901122.
  7. ^ He H, Ye A, Perera BP, Kim J (2017). „Role YY1 v doméně s potiskem Peg3“. Sci Rep. 7: 6427. doi:10.1038 / s41598-017-06817-5. PMC  5526879. PMID  28743993.
  8. ^ Bretz CL, Kim J (2017). „Nastavení metylace DNA řízené transkripcí na lokusu Peg3 myši“. Epigenetika. 19. září [Epub před tiskem] (11): 945–952. doi:10.1080/15592294.2017.1377869. PMC  5788428. PMID  28925797.
  9. ^ Ye A, He H, Kim J (2014). "Otcovsky exprimovaný Peg3 kontroluje mateřsky exprimovaný Zim1 jako trans faktor". PLOS ONE. 9 (9): e108596. doi:10.1371 / journal.pone.0108596. PMC  4180786. PMID  25265264.
  10. ^ Lee S, Ye A, Kim J (2015). „Motiv vazby na DNA zesíleného transkripčního faktoru PEG3“. PLOS ONE. 10 (12): e0145531. doi:10.1371 / journal.pone.0145531. PMC  4686966. PMID  26692216.
  11. ^ Ye A, He H, Kim J (2016). „PEG3 se váže na H19-ICR jako transkripční represor“. Epigenetika. 11 (12): 889–900. doi:10.1080/15592294.2016.1255385. PMC  5193492. PMID  27824289.
  12. ^ Ye A, He H, Kim J (2017). "PEG3 kontrola na savčím MSL komplexu". PLOS ONE. 12 (6): e0178363. doi:10.1371 / journal.pone.0178363. PMC  5469463. PMID  28609438.
  13. ^ Kim J, Bretz CL, Lee S (2015). "Epigenetická nestabilita vtisknutých genů u lidských rakovin". Nucleic Acids Res. 43 (22): 10689–99. doi:10.1093 / nar / gkv867. PMC  4678850. PMID  26338779.
  14. ^ Bretz CL, Langohr IM, Lee S, Kim J (2015). "Epigenetická nestabilita při otiskování kontrolních oblastí v neoplasmu T-buněk indukovaných Krasem (G12D)". Epigenetika. 10 (12): 1111–201. doi:10.1080/15592294.2015.1110672. PMC  4844204. PMID  26507119.
  15. ^ Bretz CL, Langohr IM, Kim J (2017). „Epigenetická odpověď potištěných domén během karcinogeneze“. Klinická epigenetika. 9: 90. doi:10.1186 / s13148-017-0393-8. PMC  5572065. PMID  28855972.
  16. ^ Kim H, Kang K, Kim J (2009). „AEBP2 jako potenciální cílový protein pro Polycomb Repression Complex PRC2“. Nucleic Acids Res. 37 (9): 2940–50. doi:10.1093 / nar / gkp149. PMC  2685092. PMID  19293275.
  17. ^ Kim H, Kang K, Ekram MB, Roh TY, Kim J (2011). „Aebp2 jako epigenetický regulátor pro buňky neurální lišty“. PLOS ONE. 6 (9): e25174. doi:10.1371 / journal.pone.0025174. PMC  3176318. PMID  21949878.
  18. ^ Kim H, Ekram MB, Bakshi A, Kim J (2015). „AEBP2 jako transkripční aktivátor a jeho role v buněčné migraci“. Genomika. 105 (2): 108–15. doi:10.1016 / j.ygeno.2014.11.007. PMC  4314425. PMID  25451679.
  19. ^ Bakshi A, Kim J (2014). „Profilování savčích epigenomů na základě retrotransposonu: methylace DNA IAP LTR v embryonálních kmenových, somatických a rakovinných buňkách“. Genomika. 104 (6): 538–44. doi:10.1016 / j.ygeno.2014.09.009. PMC  4262695. PMID  25277721.
  20. ^ Bakshi A, Herke SW, Batzer MA, Kim J (2016). „Variace methylace ADNA repetící Alu specifických pro člověka“. Epigenetika. 11 (2): 163–73. doi:10.1080/15592294.2015.1130518. PMC  4846114. PMID  26890526.

externí odkazy