Formylmethanofuran - tetrahydromethanopterin N-formyltransferáza - Formylmethanofuran—tetrahydromethanopterin N-formyltransferase

formylmethanofuran-tetrahydromethanopterin N-formyltransferáza
2fhj.jpg
tetramer formylmethanofuran-THMPT-formyltransferázy, Methanopyrus kandleri
Identifikátory
EC číslo2.3.1.101
Číslo CAS105669-83-8
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum
Genová ontologieAmiGO / QuickGO
FTR
PDB 1m5s EBI.jpg
formylmethanofuran: tetrahydromethanopterin fromyltransferáza z methanosarcina barkeri
Identifikátory
SymbolFTR
PfamPF01913
InterProIPR022667
SCOP21ftr / Rozsah / SUPFAM
TCDB9.A.17
FTR, proximální lalok
PDB 1m5h EBI.jpg
formylmethanofuran: tetrahydromethanopterin formyltransferáza z Archaeoglobus fulgidus
Identifikátory
SymbolFTR_C
PfamPF02741
InterProIPR002770
SCOP21ftr / Rozsah / SUPFAM

v enzymologie, a formylmethanofuran-tetrahydromethanopterin N-formyltransferáza (ES 2.3.1.101 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce

formylmethanofuran + 5,6,7,8-tetrahydromethanopterin methanofuran + 5-formyl-5,6,7,8-tetrahydromethanopterin

Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou formylmethanofuran a 5,6,7,8-tetrahydromethanopterin, zatímco jeho dva produkty jsou methanofuran a 5-formyl-5,6,7,8-tetrahydromethanopterin.

Tento enzym patří do rodiny transferázy, konkrétně ty acyltransferázy přenos jiné skupiny než aminoacylové skupiny. The systematické jméno této třídy enzymů je formylmethanofuran: 5,6,7,8-tetrahydromethanopterin 5-formyltransferáza. Mezi další běžně používaná jména patří formylmethanofuran-tetrahydromethanopterin formyltransferáza, formylmethanofuran: tetrahydromethanopterin formyltransferáza, N-formylmethanofuran (CHO-MFR): tetrahydromethanopterin (H4MPT), formyltransferáza, FTR, formylmethanofuran: 5,6,7,8-tetrahydromethanopterin, a N5-formyltransferáza. Tento enzym se účastní biosyntéza folátu.

Ftr z termofilní methanogen Methanopyrus kandleri (který má optimální růst teplota 98 stupňů C) je hypertermofilní enzym to je absolutně závislé na přítomnosti lyotropních látek soli pro aktivitu a termostabilitu. The Krystalická struktura Ftr, odhodlaný k odhalí homotetramer složený v podstatě ze dvou dimery. Každá podjednotka je rozdělena na dva těsně spojené laloky, které se skládají převážně z antiparalelní beta list lemovaný alfa helixy vytvoření sendviče alfa / beta struktura. Přibližná poloha Aktivní stránky byl zjištěn v oblasti poblíž dimer rozhraní.[1] Ftr z mezofilní methanogen Methanosarcina barkeri a archeon redukující sírany Archaeoglobus fulgidus mají podobnou strukturu.[2]

V methylotrofní bakterie Methylobacterium extorquens, Ftr interaguje se třemi dalšími polypeptidy za vzniku Ftr / hydrolázy komplex který katalýzy the hydrolýza formyl-tetrahydromethanopterinu za vzniku během růstu na substrátech C1.[3]

Strukturální studie

Ke konci roku 2007, 5 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1FTR, 1M5H, 1M5S, 2FHJ, a 2FHK.

Reference

  1. ^ Ermler U, Merckel M, Thauer R, Shima S (květen 1997). „Formylmethanofuran: tetrahydromethanopterin formyltransferáza z Methanopyrus kandleri - nový pohled na závislost na soli a termostabilitu“. Struktura. 5 (5): 635–46. doi:10.1016 / s0969-2126 (97) 00219-0. PMID  9195883.
  2. ^ Mamat B, Roth A, Grimm C, Ermler U, Tziatzios C, Schubert D, Thauer RK, Shima S (září 2002). „Krystalové struktury a enzymatické vlastnosti tří formyltransferáz z archea: adaptace na prostředí a evoluční vztah“. Protein Sci. 11 (9): 2168–78. doi:10.1110 / ps.0211002. PMC  2373594. PMID  12192072.
  3. ^ Pomper BK, Saurel O, Milon A, Vorholt JA (červenec 2002). „Tvorba mravenčanu komplexem formyltransferáza / hydroláza (Fhc) z Methylobacterium extorquens AM1“. FEBS Lett. 523 (1–3): 133–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 02962-9. PMID  12123819. S2CID  26661124.

Další čtení

  • Donnelly MI, Wolfe RS (1986). „Role formylmethanofuranu: tetrahydromethanopterin formyltransferáza v methanogenezi z oxidu uhličitého“. J. Biol. Chem. 261 (35): 16653–9. PMID  3097011.
  • Leigh JA, Rinehart KL, Wolfe RS (1984). "Struktura methanofuranu, redukčního faktoru oxidu uhličitého Methanobacterium thermoautotrophicum". J. Am. Chem. Soc. 106 (12): 3636–3640. doi:10.1021 / ja00324a037.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR022667