Chloramfenikol acetyltransferáza - Chloramphenicol acetyltransferase
| Chloramfenikol acetyltransferáza | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Ribbonový diagram chloramfenikol acetyltransferázy zastřihovač s vázaným chloramfenikolem. Z PDB: 3CLA. | |||||||||||
| Identifikátory | |||||||||||
| Symbol | KOČKA | ||||||||||
| Pfam | PF00302 | ||||||||||
| InterPro | IPR001707 | ||||||||||
| STRÁNKA | PDOC00093 | ||||||||||
| SCOP2 | 3cla / Rozsah / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
| Chloramfenikol acetyltransferáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 2.3.1.28 | ||||||||
| Číslo CAS | 9040-07-7 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Chloramfenikol acetyltransferáza (nebo KOČKA) je bakteriální enzym (ES 2.3.1.28 )[1] který detoxikuje antibiotikum chloramfenikol a je zodpovědný za rezistenci bakterií na chloramfenikol.[2] Tento enzym kovalentně váže acetyl skupina z acetyl-CoA na chloramfenikol, který zabraňuje vazbě chloramfenikolu na ribozomy. Zbytek histidinu, který se nachází v C-terminální části enzymu, hraje ústřední roli v jeho katalytickém mechanismu.
Krystalová struktura enzymu typu III z Escherichia coli s vázaným chloramfenikolem bylo stanoveno. CAT je trimer identických podjednotek (monomer Mr 25 000) a trimerní struktura je stabilizována řadou vodíkových vazeb, z nichž některé vedou k rozšíření beta-listu přes rozhraní podjednotky. Chloramfenikol se váže v hluboké kapse umístěné na hranici mezi sousedními podjednotkami trimeru, takže většina zbytků tvořících vazebnou kapsu patří do jedné podjednotky, zatímco katalyticky esenciální histidin patří do sousední podjednotky. His195 je vhodně umístěn tak, aby v reakci působil jako obecný bazický katalyzátor, a požadovaná tautomerní stabilizace je zajištěna neobvyklou interakcí s karbonylovým kyslíkem s hlavním řetězcem.[3]
aplikace
CAT se používá jako reportérový systém k měření úrovně promotoru nebo jeho tkáňově specifické exprese. Stanovení CAT zahrnuje monitorování acetylace radioaktivně značeného chloramfenikolu na a TLC talíř; Aktivita CAT je určena hledáním acetylovaných forem chloramfenikolu, které mají ve srovnání s neacetylovanou formou významně zvýšenou rychlost migrace.[4]
Reference
- ^ Engel J, Prockop DJ (1991). „Skládání kolagenových trojitých šroubovic na způsob zipu a účinky mutací, které narušují zip“. Annu. Biophys. Biophys. Chem. 20 (1): 137–152. doi:10.1146 / annurev.bb.20.060191.001033. PMID 1867713.
- ^ Shaw WV, Packman LC, Burleigh BD, Dell A, Morris HR, Hartley BS (1979). "Primární struktura chloramfenikol acetyltransferázy specifikovaná R plazmidy". Příroda. 282 (5741): 870–2. Bibcode:1979 Natur.282..870S. doi:10.1038 / 282870a0. PMID 390404.
- ^ Leslie AG (1990). "Rafinovaná krystalová struktura typu III chloramfenikol acetyltransferázy v rozlišení 1,75 A". J. Mol. Biol. 213 (1): 167–186. doi:10.1016 / S0022-2836 (05) 80129-9. PMID 2187098.
- ^ Gorman, CM; Moffat LF; Howard BH (1982). "Rekombinantní genomy, které exprimují chloramfenikol-acetyltransferázu v buňkách savců". Mol. Buňka. Biol. 2 (9): 1044–1051. doi:10.1128 / MCB.2.9.1044. PMC 369897. PMID 6960240.
