Katepsin L2 - Cathepsin L2

CTSV
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1FH0, 3H6S, 3KFQ
Identifikátory
Aliasy	CTSV, katepsin V, CATL2, CTSL2, CTSU
Externí ID	OMIM: 603308 MGI: 88564 HomoloGene: 76699 Genové karty: CTSV
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	97,039,643 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	64,370,890 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy cysteinového typu; • peptidová vazba; • aktivita peptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita aminopeptidázy; • aktivita hydrolázy; • aktivita endopeptidázy serinového typu; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu; • aktivita karboxypeptidázy cysteinového typu; • histonová vazba; • vazba kininogenu; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • perikaryon; • apikální část buňky; • sekreční granule; • extracelulární oblast; • mikrovilli; • vakuola; • lysozomální lumen; • neuronová projekce; • lysozom; • vnější strana plazmatické membrány; • extracelulární; • buněčné jádro; • jádro; • cytoplazmatický váček;
Biologický proces	• vývoj mužských pohlavních žláz; • reakce na organickou cyklickou sloučeninu; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • buněčná odpověď na hladovění; • demontáž extracelulární matice; • reakce na glukokortikoidy; • reakce na glukózu; • Diferenciace Sertoliho buněk; • reakce na gonadotropin; • proteolýza; • buněčná komunikace; • decidualizace; • spermatogeneze; • stárnutí mnohobuněčných organismů; • proteolýza zapojená do katabolického procesu buněčných bílkovin; • vývoj nervů; • autofagická buněčná smrt; • reakce na odorant; • regulace diferenciace keratinocytů; • negativní regulace množení keratinocytů; • zpracování bílkovin; • automatické zpracování bílkovin; • morfogeneze vlasových folikulů; • regulace reorganizace aktinového cytoskeletu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1515
	13039
	ENSG00000136943
	ENSMUSG00000021477
	O60911
	P06797
	NM_001333; NM_001201575
	NM_009984
	NP_001188504; NP_001324
	NP_034114
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Katepsin L2, také známý jako katepsin V a kódováno CTSV gen, je člověk gen.^[5]

Protein kódovaný tímto genem, který je členem peptidáza Rodina C1 je lysozomální cysteinová proteináza, která může hrát důležitou roli v rohovka fyziologie. Tento gen je exprimován v kolorektálním a karcinomy prsu ale ne normálně dvojtečka, mléčná žláza nebo peritumorální tkáně, což naznačuje možnou roli tohoto genu v nádor procesy.

Klinický význam

Katepsin L2 může hrát roli v patogenezi keratokonus.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136943 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021477 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: CTSL2 katepsin L2“.
^ Kenney MC, Chwa M, Atilano SR, Tran A, Carballo M, Saghizadeh M, Vasiliou V, Adachi W, Brown DJ (2005). „Zvýšené hladiny katalázy a katepsinu V / L2, ale snížené hodnoty TIMP-1 v rohovkách keratokonusu: důkazy, že při této poruše hraje roli oxidační stres“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 46 (3): 823–832. doi:10.1167 / iovs.04-0549. PMID 15728537.

externí odkazy

The MEROPS online databáze peptidáz a jejich inhibitorů: C01.009

Další čtení

Santamaría I, Velasco G, Cazorla M a kol. (1998). „Cathepsin L2, nová lidská cysteinová proteináza produkovaná karcinomy prsu a kolorektálního karcinomu“. Cancer Res. 58 (8): 1624–30. PMID 9563472.
Adachi W, Kawamoto S, Ohno I a kol. (1998). „Izolace a charakterizace lidského katepsinu V: hlavní proteináza v epitelu rohovky“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 39 (10): 1789–96. PMID 9727401.
Brömme D, Li Z, Barnes M, Mehler E (1999). "Funkční exprese lidského katepsinu V, distribuce v tkáních, elektrostatický povrchový potenciál, enzymatická charakterizace a chromozomální lokalizace". Biochemie. 38 (8): 2377–85. doi:10.1021 / bi982175f. PMID 10029531.
Itoh R, Kawamoto S, Adachi W a kol. (1999). "Genomická organizace a chromozomální lokalizace lidského genu pro kathepsin L2". DNA Res. 6 (2): 137–40. doi:10.1093 / dnares / 6.2.137. PMID 10382972.
Somoza JR, Zhan H, Bowman KK a kol. (2000). „Krystalová struktura lidského katepsinu V.“. Biochemie. 39 (41): 12543–51. doi:10.1021 / bi000951p. PMID 11027133.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Bernard D, Méhul B, Thomas-Collignon A a kol. (2003). „Analýza proteinů s kaseinolytickou aktivitou v extraktu lidské stratum corneum odhalila dosud neidentifikovanou cysteinovou proteázu a identifikovala takzvanou„ stratio corneum thiolproteázu “jako katepsin l2“. J. Invest. Dermatol. 120 (4): 592–600. doi:10.1046 / j.1523-1747.2003.12086.x. PMID 12648222.
Tolosa E, Li W, Yasuda Y a kol. (2003). „Katepsin V se podílí na degradaci invariantního řetězce v lidském brzlíku a je nadměrně exprimován v myasthenia gravis“. J. Clin. Investovat. 112 (4): 517–26. doi:10,1172 / JCI18028. PMC 171390. PMID 12925692.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování sekretovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR a kol. (2004). "DNA sekvence a analýza lidského chromozomu 9". Příroda. 429 (6990): 369–74. doi:10.1038 / nature02465. PMC 2734081. PMID 15164053.
Yasuda Y, Li Z, Greenbaum D a kol. (2004). „Katepsin V, nová a silná elastolytická aktivita vyjádřená v aktivovaných makrofágech“. J. Biol. Chem. 279 (35): 36761–70. doi:10,1074 / jbc.M403986200. PMID 15192101.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Hagemann S, Günther T, Dennemärker J, et al. (2005). „Lidská cysteinová proteáza katepsin V může kompenzovat myší katepsin L v myších pokožkách a vlasových folikulech“. Eur. J. Cell Biol. 83 (11–12): 775–80. doi:10.1078/0171-9335-00404. PMID 15679121.
Cheng T, Hitomi K, van Vlijmen-Willems IM a kol. (2006). „Cystatin M / E je vysoce afinitní inhibitor katepsinu V a katepsinu L prostřednictvím reaktivního místa, které je odlišné od vazebného místa pro legumain. Nová stopa role cystatinu M / E při epidermální rohovce“. J. Biol. Chem. 281 (23): 15893–9. doi:10,1074 / jbc.M600694200. PMID 16565075.
Burden RE, Snoddy P, Jefferies CA a kol. (2007). „Inhibice katepsinu L-podobných proteáz propeptidem katepsinu V“. Biol. Chem. 388 (5): 541–5. doi:10.1515 / BC.2007.053. PMID 17516850. S2CID 6680659.
Viken MK, Sollid HD, Joner G a kol. (2007). „Polymorfismy v genu pro katepsin L2 (CTSL2) vykazují souvislost s diabetem 1. typu a časným nástupem myasthenia gravis“. Hučení. Immunol. 68 (9): 748–55. doi:10.1016 / j.humimm.2007.05.009. PMID 17869649.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136943 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021477 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: CTSL2 katepsin L2“.

[Kenney05-6] Kenney MC, Chwa M, Atilano SR, Tran A, Carballo M, Saghizadeh M, Vasiliou V, Adachi W, Brown DJ (2005). „Zvýšené hladiny katalázy a katepsinu V / L2, ale snížené hodnoty TIMP-1 v rohovkách keratokonusu: důkazy, že při této poruše hraje roli oxidační stres“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 46 (3): 823–832. doi:10.1167 / iovs.04-0549. PMID 15728537.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Proteázy: cysteinové proteázy (ES 3.4.22 )
Caspase	Caspase 1 Caspase 2 Caspase 3 Kaspase 4 Caspase 5 Kaspase 6 Kaspase 7 Kaspase 8 Kaspase 9 Kaspase 10 Caspase 12 Caspase 13 Caspase 14
Odvozeno z ovoce	Papain Ficain Bromelain Actinidain
Calpain	CAPN1 CAPN2 CAPN3 CAPN5 CAPN6 CAPN7 CAPN8 CAPN9 CAPN10 CAPN11 CAPN12 CAPN13 CAPN14 CAPNS1 CAPNS2
Katepsin	B C F H K. L1 /L2 Ó S Ž Z
jiný	Clostripain Prokoagulant rakoviny Oddělit Autofagin Cruzipain

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )