Kaspase 7 - Caspase 7 - Wikipedia

CASP7
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1F1J, 1GQF, 1I4O, 1I51, 1K86, 1K88, 1KMC, 1 SHJ, 1SHL, 2QL5, 2QL7, 2QL9, 2QLB, 2QLF, 2QLJ, 3EDR, 3H1P, 3IBC, 3IBF, 3R5K, 4FDL, 4FEA, 4HQ0, 4HQR, 4JB8, 4JJ8, 4JR1, 4JR2, 4LSZ, 4ZVR, 4ZVQ, 4ZVO, 4ZVU, 4ZVT, 4ZVS, 4ZVP, 5IC6
Identifikátory
Aliasy	CASP7, CASP-7, CMH-1, ICE-LAP3, LICE2, MCH3, Caspase 7
Externí ID	OMIM: 601761 MGI: 109383 HomoloGene: 11168 Genové karty: CASP7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	113,730,907 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	56,442,344 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy cysteinového typu; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • aktivita peptidázy; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu podílející se na fázi provádění apoptózy; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu zapojená do apoptotického procesu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• proteolýza; • buněčná odpověď na staurosporin; • fáze provádění apoptózy; • apoptotický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	840
	12369
	ENSG00000165806
	ENSMUSG00000025076
	P55210
	P97864
NM_001227; NM_001267056; NM_001267057; NM_001267058; NM_033338;
	NM_033339; NM_033340; NM_001320911
	NM_007611
NP_001218; NP_001253985; NP_001253986; NP_001253987; NP_001307840;
	NP_203124; NP_203125; NP_203126
	NP_031637
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kaspáza-7, cysteinová peptidáza související s apoptózou, také známý jako CASP7, je lidský protein kódovaný CASP7 gen.CASP7 ortology ^[5] byly identifikovány téměř ve všech savci pro které jsou k dispozici úplná data genomu. Unikátní ortology jsou také přítomny v ptactvo, ještěrky, lissamphibians, a teleosts.

Funkce

Caspase-7 je členem kaspáza (Cysteine aspumělecký protease) rodina proteinů a bylo prokázáno, že je exekutorovým proteinem apoptóza. Sekvenční aktivace kaspáz hraje ústřední roli ve fázi provádění buňky apoptóza. Kaspázy existují jako neaktivní proenzymy které procházejí proteolytickým zpracováním upstream kaspázami (kaspáza-8, -9) na konzervovaných aspartátových zbytcích za vzniku dvou podjednotek, velké a malé, které dimerizují za vzniku aktivního enzymu ve formě heterotetrameru. Předchůdce této kaspázy je štěpen kaspáza 3, kaspáza 10, a kaspáza 9. Aktivuje se na podněty buněčné smrti a indukuje apoptózu. Alternativní sestřih má za následek čtyři varianty přepisu, kódující tři odlišné izoformy.^[6]

Interakce

Caspase 7 bylo prokázáno komunikovat s:

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165806 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025076 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "OrthoMaM fylogenetický marker: sekvence kódující CASP7". Archivovány od originál dne 04.03.2016. Citováno 2009-12-20.
^ „Entrez Gene: CASP7 kaspáza 7, cysteinová peptidáza související s apoptózou“.
^ Guo Y, Srinivasula SM, Druilhe A, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (duben 2002). „Kaspáza-2 indukuje apoptózu uvolňováním proapoptotických proteinů z mitochondrií“. J. Biol. Chem. 277 (16): 13430–7. doi:10,1074 / jbc.M108029200. PMID 11832478.
^ Srinivasula SM, Ahmad M, Fernandes-Alnemri T, Litwack G, Alnemri ES (prosinec 1996). „Molekulární uspořádání Fas-apoptotické dráhy: Fas / APO-1 proteáza Mch5 je CrmA-inhibovatelná proteáza, která aktivuje více cysteinových proteáz podobných Ced-3 / ICE“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (25): 14486–91. doi:10.1073 / pnas.93.25.14486. PMC 26159. PMID 8962078.
^ Tamm I, Wang Y, Sausville E, Scudiero DA, Vigna N, Oltersdorf T, Reed JC (prosinec 1998). „Protein survivin z rodiny IAP inhibuje aktivitu kaspázy a apoptózu indukovanou Fas (CD95), Bax, kaspázami a protirakovinovými léky“. Cancer Res. 58 (23): 5315–20. PMID 9850056.
^ Shin S, Sung BJ, Cho YS, Kim HJ, Ha NC, Hwang JI, Chung CW, Jung YK, Oh BH (leden 2001). „Anti-apoptotický protein, lidský survivin, je přímým inhibitorem kaspázy-3 a -7.“ Biochemie. 40 (4): 1117–23. doi:10.1021 / bi001603q. PMID 11170436.
^ Riedl SJ, Renatus M, Schwarzenbacher R, Zhou Q, Sun C, Fesik SW, Liddington RC, Salvesen GS (březen 2001). "Strukturální základ pro inhibici kaspázy-3 pomocí XIAP". Buňka. 104 (5): 791–800. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00274-4. PMID 11257232. S2CID 17915093.
^ Roy N, Deveraux QL, Takahashi R, Salvesen GS, Reed JC (prosinec 1997). „Proteiny c-IAP-1 a c-IAP-2 jsou přímými inhibitory specifických kaspáz“. EMBO J.. 16 (23): 6914–25. doi:10.1093 / emboj / 16.23.6914. PMC 1170295. PMID 9384571.
^ Deveraux QL, Takahashi R, Salvesen GS, Reed JC (červenec 1997). „IAP vázaný na X je přímým inhibitorem proteáz buněčné smrti“. Příroda. 388 (6639): 300–4. doi:10.1038/40901. PMID 9230442. S2CID 4395885.
^ Suzuki Y, Nakabayashi Y, Nakata K, Reed JC, Takahashi R (červenec 2001). „X-vázaný inhibitor proteinu apoptózy (XIAP) inhibuje kaspázu-3 a -7 různými způsoby“. J. Biol. Chem. 276 (29): 27058–63. doi:10,1074 / jbc.M102415200. PMID 11359776.

Další čtení

Cohen GM (1997). „Kaspázy: popravci apoptózy“. Biochem. J. 326 (Pt 1): 1–16. doi:10.1042 / bj3260001. PMC 1218630. PMID 9337844.

externí odkazy

The MEROPS online databáze peptidáz a jejich inhibitorů: C14.004
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P55210 (Human Caspase-7) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165806 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025076 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[OrthoMaM-5] "OrthoMaM fylogenetický marker: sekvence kódující CASP7". Archivovány od originál dne 04.03.2016. Citováno 2009-12-20.

[6] „Entrez Gene: CASP7 kaspáza 7, cysteinová peptidáza související s apoptózou“.

[pmid11832478-7] Guo Y, Srinivasula SM, Druilhe A, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (duben 2002). „Kaspáza-2 indukuje apoptózu uvolňováním proapoptotických proteinů z mitochondrií“. J. Biol. Chem. 277 (16): 13430–7. doi:10,1074 / jbc.M108029200. PMID 11832478.

[pmid8962078-8] Srinivasula SM, Ahmad M, Fernandes-Alnemri T, Litwack G, Alnemri ES (prosinec 1996). „Molekulární uspořádání Fas-apoptotické dráhy: Fas / APO-1 proteáza Mch5 je CrmA-inhibovatelná proteáza, která aktivuje více cysteinových proteáz podobných Ced-3 / ICE“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (25): 14486–91. doi:10.1073 / pnas.93.25.14486. PMC 26159. PMID 8962078.

[pmid9850056-9] Tamm I, Wang Y, Sausville E, Scudiero DA, Vigna N, Oltersdorf T, Reed JC (prosinec 1998). „Protein survivin z rodiny IAP inhibuje aktivitu kaspázy a apoptózu indukovanou Fas (CD95), Bax, kaspázami a protirakovinovými léky“. Cancer Res. 58 (23): 5315–20. PMID 9850056.

[pmid11170436-10] Shin S, Sung BJ, Cho YS, Kim HJ, Ha NC, Hwang JI, Chung CW, Jung YK, Oh BH (leden 2001). „Anti-apoptotický protein, lidský survivin, je přímým inhibitorem kaspázy-3 a -7.“ Biochemie. 40 (4): 1117–23. doi:10.1021 / bi001603q. PMID 11170436.

[pmid11257232-11] Riedl SJ, Renatus M, Schwarzenbacher R, Zhou Q, Sun C, Fesik SW, Liddington RC, Salvesen GS (březen 2001). "Strukturální základ pro inhibici kaspázy-3 pomocí XIAP". Buňka. 104 (5): 791–800. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00274-4. PMID 11257232. S2CID 17915093.

[pmid9384571-12] Roy N, Deveraux QL, Takahashi R, Salvesen GS, Reed JC (prosinec 1997). „Proteiny c-IAP-1 a c-IAP-2 jsou přímými inhibitory specifických kaspáz“. EMBO J.. 16 (23): 6914–25. doi:10.1093 / emboj / 16.23.6914. PMC 1170295. PMID 9384571.

[pmid9230442-13] Deveraux QL, Takahashi R, Salvesen GS, Reed JC (červenec 1997). „IAP vázaný na X je přímým inhibitorem proteáz buněčné smrti“. Příroda. 388 (6639): 300–4. doi:10.1038/40901. PMID 9230442. S2CID 4395885.

[pmid11359776-14] Suzuki Y, Nakabayashi Y, Nakata K, Reed JC, Takahashi R (červenec 2001). „X-vázaný inhibitor proteinu apoptózy (XIAP) inhibuje kaspázu-3 a -7 různými způsoby“. J. Biol. Chem. 276 (29): 27058–63. doi:10,1074 / jbc.M102415200. PMID 11359776.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

Proteázy: cysteinové proteázy (ES 3.4.22 )
Caspase	Caspase 1 Caspase 2 Caspase 3 Kaspase 4 Caspase 5 Kaspase 6 Kaspase 7 Kaspase 8 Kaspase 9 Kaspase 10 Caspase 12 Caspase 13 Caspase 14
Odvozeno z ovoce	Papain Ficain Bromelain Actinidain
Calpain	CAPN1 CAPN2 CAPN3 CAPN5 CAPN6 CAPN7 CAPN8 CAPN9 CAPN10 CAPN11 CAPN12 CAPN13 CAPN14 CAPNS1 CAPNS2
Katepsin	B C F H K. L1 /L2 Ó S Ž Z
jiný	Clostripain Prokoagulant rakoviny Oddělit Autofagin Cruzipain

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )