Katepsin F - Cathepsin F
Katepsin F je protein že u lidí je kódován CTSF gen.[5][6][7]
Katepsiny jsou cysteinové proteinázy rodiny papainů, které představují hlavní složku lysozomálního proteolytického systému. Obecně obsahují katepsiny signální sekvenci, následovanou propeptidem a poté katalyticky aktivní zralou oblastí. Velmi dlouhý (251-aminokyselinové zbytky) proregion prekurzoru katepsinu F obsahuje C-koncovou doménu podobnou prosegmentu katepsinových L-podobných enzymů, 50-zbytkový flexibilní linkerový peptid a předpokládanou N-koncovou doménu přijmout záhyb podobný cystatinu. Proregion katepsinu F je jedinečný v cysteinových proteázách rodiny papainů v tom, že obsahuje tento další N-koncový segment, u kterého se předpokládá sdílení strukturních podobností s inhibitory cysteinových proteáz nadčeledi cystatinů. Tato doména podobná cystatinu obsahuje některé prvky, o nichž je známo, že jsou důležité pro inhibiční aktivitu. CTSF kóduje predikovaný protein o 484 aminokyselinách, který obsahuje signální peptid se 19 zbytky. Katepsin F obsahuje pět potenciálních N-glykosylačních míst a může být zaměřen na endozomální / lysozomální kompartment cestou dráhy manózového 6-fosfátového receptoru. Gen katepsinu F je všudypřítomně exprimován a mapuje se na chromozom 11q13, blízký genu kódujícímu katepsin W.[7]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000174080 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000083282 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Wang B, Shi GP, Yao PM, Li Z, Chapman HA, Bromme D (prosinec 1998). "Lidský katepsin F. Molekulární klonování, funkční exprese, lokalizace tkáně a enzymatická charakterizace". J Biol Chem. 273 (48): 32000–8. doi:10.1074 / jbc.273.48.32000. PMID 9822672.
- ^ Santamaria I, Velasco G, Pendas AM, Paz A, Lopez-Otin C (červen 1999). „Molekulární klonování a strukturní a funkční charakterizace lidského katepsinu F, nové cysteinové proteinázy rodiny papainů s dlouhou doménou propeptidů“. J Biol Chem. 274 (20): 13800–9. doi:10.1074 / jbc.274.20.13800. PMID 10318784.
- ^ A b „Entrez Gene: CTSF katepsin F“.
Další čtení
- Nägler DK, Sulea T, Ménard R (1999). „Plná délka cDNA lidského katepsinu F předpovídá přítomnost cystatinové domény na N-konci cysteinové proteázy zymogenu.“ Biochem. Biophys. Res. Commun. 257 (2): 313–8. doi:10.1006 / bbrc.1999.0461. PMID 10198209.
- Wex T, Levy B, Wex H, Brömme D (1999). „Lidské katepsiny F a W: nová podskupina katepsinů“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 259 (2): 401–7. doi:10.1006 / bbrc.1999.0700. PMID 10362521.
- Wex T, Wex H, Brömme D (2000). „Lidský gen pro katepsin F - fúzní produkt mezi rodovým katepsinem a genem pro cystatin“. Biol. Chem. 380 (12): 1439–42. doi:10.1515 / BC.1999.185. PMID 10661872. S2CID 28469574.
- Shi GP, Bryant RA, Riese R a kol. (2000). „Role pro katepsin F při zpracování invariantního řetězce a nakládání peptidů hlavní histokompatibility komplexu třídy II makrofágy“. J. Exp. Med. 191 (7): 1177–86. doi:10.1084 / jem.191.7.1177. PMC 2193169. PMID 10748235.
- Deussing J, Tisljar K, Papazoglou A, Peters C (2000). "Myší katepsin F: klonování cDNA, genomová organizace a chromozomální přiřazení genu". Gen. 251 (2): 165–73. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00196-7. PMID 10876093.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Oörni K, Sneck M, Brömme D a kol. (2004). „Cysteinová proteáza katepsin F je exprimována v lidských aterosklerotických lézích, je vylučována kultivovanými makrofágy a modifikuje lipoproteinové částice s nízkou hustotou in vitro“. J. Biol. Chem. 279 (33): 34776–84. doi:10,1074 / jbc.M310814200. PMID 15184381.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Vazquez-Ortiz G, Pina-Sanchez P, Vazquez K a kol. (2006). „Nadměrná exprese katepsinu F, metaloproteináz matrix 11 a 12 u rakoviny děložního čípku“. Rakovina BMC. 5 (1): 68. doi:10.1186/1471-2407-5-68. PMC 1175083. PMID 15989693.
- Kaakinen R, Lindstedt KA, Sneck M a kol. (2007). „Angiotensin II zvyšuje expresi a sekreci katepsinu F v kultivovaných makrofágech získaných z lidských monocytů: účinek zprostředkovaný receptorem angiotenzinu II typu 2“. Ateroskleróza. 192 (2): 323–7. doi:10.1016 / j.atheroskleróza.2006.08.001. PMID 16963053.
externí odkazy
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |