CAPN2 - CAPN2

CAPN2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1KFU, 1KFX, 2NQA
Identifikátory
Aliasy	CAPN2, CANP2, CANPL2, CANPml, mCANP, calpain 2
Externí ID	OMIM: 114230 MGI: 88264 HomoloGene: 1326 Genové karty: CAPN2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	223,776,018 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	182,517,608 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • aktivita peptidázy cysteinového typu; • vazba kovových iontů; • vazba cytoskeletálního proteinu; • aktivita peptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • aktivita hydrolázy; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu závislá na vápníku; • vazba enzymu;
Buněčná složka	• Golgiho aparát; • pseudopodia; • membrána; • ohnisková adheze; • perinukleární endoplazmatické retikulum; • intracelulární; • dendrit; • endoplazmatické retikulum; • kortikální aktinový cytoskelet; • membránový vor; • chromatin; • lysozom; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • cytosol; • cytoplazma; • buněčná membrána; • mitochondriální mezimembránový prostor; • vnější strana plazmatické membrány; • buněčná projekce; • tělo neuronových buněk;
Biologický proces	• reakce na hypoxii; • automatické zpracování bílkovin; • proteolýza; • buněčná odpověď na stimul aminokyselin; • fúze myoblastů; • proteolýza zapojená do katabolického procesu buněčných bílkovin; • regulace organizace cytoskeletu; • vývoj blastocyst; • demontáž extracelulární matice; • ženské těhotenství; • pozitivní regulace apoptotického procesu buněk srdečního svalu; • regulace produkce interleukinu-6; • buněčná odpověď na interferon-beta; • reakce na peroxid vodíku; • behaviorální reakce na bolest; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • pozitivní regulace neuronové smrti; • pozitivní regulace fúze myoblastů; • pozitivní regulace procesu biosyntézy fosfatidylcholinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	824
	12334
	ENSG00000162909
	ENSMUSG00000026509
	P17655
	O08529
	NM_001146068; NM_001748
	NM_009794
	NP_001139540; NP_001739
	NP_033924
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Calpain-2 katalytická podjednotka je protein že u lidí je kódován CAPN2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Kalpainy, vápníkem aktivované neutrální proteázy, jsou nelysozomální, intracelulární cysteinové proteázy. Savčí calpainy zahrnují všudypřítomné proteiny specifické pro žaludek a specifické pro svaly. Všudypřítomné enzymy se skládají z heterodimerů s odlišnými velkými katalytickými podjednotkami spojenými se společnou malou regulační podjednotkou. Tento gen kóduje velkou podjednotku všudypřítomného enzymu calpain 2. Bylo hlášeno několik heterogenních transkripčních počátečních míst v 5 'UTR.^[7]

Interakce

CAPN2 bylo prokázáno komunikovat s Bcl-2.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162909 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026509 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Imajoh S, Aoki K, Ohno S, Emori Y, Kawasaki H, Sugihara H, Suzuki K (1988). "Molekulární klonování cDNA pro velkou podjednotku vysoce Ca2 + vyžadující formy lidské neutrální proteázy aktivované Ca2 +". Biochemie. 27 (21): 8122–8. doi:10.1021 / bi00421a022. PMID 2852952.
^ Hata A, Ohno S, Akita Y, Suzuki K (květen 1989). „Tandemově zopakované negativní prvky podobné zesilovači regulují transkripci lidského genu pro velkou podjednotku proteázy závislé na vápníku“. J. Biol. Chem. 264 (11): 6404–11. PMID 2539381.
^ „Entrez Gene: CAPN2 calpain 2, (m / II) velká podjednotka“.
^ Gil-Parrado S, Fernández-Montalván A, Assfalg-Machleidt I, Popp O, Bestvater F, Holloschi A, Knoch TA, Auerswald EA, Welsh K, Reed JC, Fritz H, Fuentes-Prior P, Spiess E, Salvesen GS, Machleidt W (červenec 2002). "Ionomycinem aktivovaný calpain spouští apoptózu. Pravděpodobná role členů rodiny Bcl-2". J. Biol. Chem. 277 (30): 27217–26. doi:10,1074 / jbc.M202945200. PMID 12000759.

Další čtení

Suzuki K, Sorimachi H, Yoshizawa T, Kinbara K, Ishiura S (1995). "Calpain: noví členové rodiny, aktivace a fyziologické funkce". Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 376 (9): 523–9. doi:10.1515 / bchm3.1995.376.9.523. PMID 8561910.
Cohen GM (1997). „Kaspázy: popravci apoptózy“. Biochem. J. 326 (Pt 1): 1–16. doi:10.1042 / bj3260001. PMC 1218630. PMID 9337844.
Reverter D, Sorimachi H, Bode W (2001). "Struktura lidského m-kalpainu bez vápníku: důsledky pro aktivaci a funkci vápníku". Trendy Cardiovasc. Med. 11 (6): 222–9. doi:10.1016 / S1050-1738 (01) 00112-8. PMID 11673052.
Kopp S (1976). „Reprodukovatelnost odpovědi na dotazník o symptomech žvýkací dysfunkce“. Komunitní dentální orální epidemiol. 4 (5): 205–9. doi:10.1111 / j.1600-0528.1976.tb00985.x. PMID 1067155.
Adachi Y, Kitahara-Ozawa A, Sugamura K, Lee WJ, Yodoi J, Maki M, Murachi T, Hatanaka M (1992). "Exprese genu calpain II v buňkách lidského hematopoetického systému infikovaných virem lidské leukémie typu T buněk typu I". J. Biol. Chem. 267 (27): 19373–8. PMID 1527057.
Ohno S, Minoshima S, Kudoh J, Fukuyama R, Shimizu Y, Ohmi-Imajoh S, Shimizu N, Suzuki K (1990). "Čtyři geny pro rodinu calpainů se nacházejí na čtyřech odlišných lidských chromozomech". Cytogenet. Cell Genet. 53 (4): 225–9. doi:10.1159/000132937. PMID 2209092.
Ishiguro H, Higashiyama S, Namikawa C, Kunimatsu M, Takano E, Tanaka K, Ohkubo I, Murachi T, Sasaki M (1987). "Interakce lidských calpainů I a II s vysokomolekulárními a nízkomolekulárními kininogeny a jejich těžkými řetězci: mechanismus interakce a role dvojmocných kationtů". Biochemie. 26 (10): 2863–70. doi:10.1021 / bi00384a030. PMID 3038169.
Srinivasula SM, Fernandes-Alnemri T, Zangrilli J, Robertson N, Armstrong RC, Wang L, Trapani JA, Tomaselli KJ, Litwack G, Alnemri ES (1996). „Homolog Mch6 podobný enzymu konvertujícímu Ced-3 / interleukin lbeta a enzym štěpící laminem Mch2alpha jsou substráty pro apoptotický mediátor CPP32“. J. Biol. Chem. 271 (43): 27099–106. doi:10.1074 / jbc.271.43.27099. PMID 8900201.
Corasaniti MT, Navarra M, Catani MV, Melino G, Nisticò G, Finazzi-Agrò A (1996). „NMDA a HIV-1 obalový protein, GP120, produkují nekrotickou, ale nikoli apoptotickou buněčnou smrt v lidských kulturách neuroblastomu CHP100 prostřednictvím mechanismu zahrnujícího calpain“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 229 (1): 299–304. doi:10.1006 / bbrc.1996.1796. PMID 8954122.
Fujitani K, Kambayashi J, Sakon M, Ohmi SI, Kawashima S, Yukawa M, Yano Y, Miyoshi H, Ikeda M, Shinoki N, Monden M (1997). "Identifikace mu-, m-kalpainů a kalpastatinu a zachycení aktivace mu-kalpainu v endotelových buňkách". J. Cell. Biochem. 66 (2): 197–209. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19970801) 66: 2 <197 :: AID-JCB7> 3.0.CO; 2-L. PMID 9213221.
Rock MT, Brooks WH, Roszman TL (1997). "Na vápníku závislé signální dráhy v T buňkách. Potenciální role calpainu, protein tyrosin fosfatázy 1b a p130Cas v integrinem zprostředkovaných signálních událostech". J. Biol. Chem. 272 (52): 33377–83. doi:10.1074 / jbc.272.52.33377. PMID 9407132.
Ueyama H, Kumamoto T, Fujimoto S, Murakami T, Tsuda T (1998). "Exprese tří genů izoformy calpainu v lidských kosterních svalech". J. Neurol. Sci. 155 (2): 163–9. doi:10.1016 / S0022-510X (97) 00309-2. PMID 9562261.
Strobl S, Fernandez-Catalan C, Braun M, Huber R, Masumoto H, Nakagawa K, Irie A, Sorimachi H, Bourenkow G, Bartunik H, Suzuki K, Bode W (2000). „Krystalová struktura lidského m-kalpainu bez vápníku naznačuje elektrostatický přepínací mechanismus pro aktivaci vápníkem“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (2): 588–92. doi:10.1073 / pnas.97.2.588. PMC 15374. PMID 10639123.
Masumoto H, Nakagawa K, Irie S, Sorimachi H, Suzuki K, Bourenkov GP, Bartunik H, Fernandez-Catalan C, Bode W, Strobl S (2000). "Krystalizace a předběžná rentgenová analýza rekombinantního lidského m-kalpainu plné délky". Acta Crystallogr. D. 56 (Pt 1): 73–5. doi:10.1107 / S0907444999013748. PMID 10666632.
Chua BT, Guo K, Li P (2000). „Přímé štěpení proteázou kalpainem aktivovanou vápníkem může vést k inaktivaci kaspáz“. J. Biol. Chem. 275 (7): 5131–5. doi:10.1074 / jbc.275.7.5131. PMID 10671558.
Lee MS, Kwon YT, Li M, Peng J, Friedlander RM, Tsai LH (2000). "Neurotoxicita indukuje štěpení p35 na p25 calpainem". Příroda. 405 (6784): 360–4. doi:10.1038/35012636. PMID 10830966.

externí odkazy

The MEROPS online databáze peptidáz a jejich inhibitorů: C02.002
Člověk CAPN2 umístění genomu a CAPN2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162909 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026509 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2852952-5] Imajoh S, Aoki K, Ohno S, Emori Y, Kawasaki H, Sugihara H, Suzuki K (1988). "Molekulární klonování cDNA pro velkou podjednotku vysoce Ca2 + vyžadující formy lidské neutrální proteázy aktivované Ca2 +". Biochemie. 27 (21): 8122–8. doi:10.1021 / bi00421a022. PMID 2852952.

[pmid2539381-6] Hata A, Ohno S, Akita Y, Suzuki K (květen 1989). „Tandemově zopakované negativní prvky podobné zesilovači regulují transkripci lidského genu pro velkou podjednotku proteázy závislé na vápníku“. J. Biol. Chem. 264 (11): 6404–11. PMID 2539381.

[entrez-7] „Entrez Gene: CAPN2 calpain 2, (m / II) velká podjednotka“.

[pmid12000759-8] Gil-Parrado S, Fernández-Montalván A, Assfalg-Machleidt I, Popp O, Bestvater F, Holloschi A, Knoch TA, Auerswald EA, Welsh K, Reed JC, Fritz H, Fuentes-Prior P, Spiess E, Salvesen GS, Machleidt W (červenec 2002). "Ionomycinem aktivovaný calpain spouští apoptózu. Pravděpodobná role členů rodiny Bcl-2". J. Biol. Chem. 277 (30): 27217–26. doi:10,1074 / jbc.M202945200. PMID 12000759.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Proteázy: cysteinové proteázy (ES 3.4.22 )
Caspase	Caspase 1 Caspase 2 Caspase 3 Kaspase 4 Caspase 5 Kaspase 6 Kaspase 7 Kaspase 8 Kaspase 9 Kaspase 10 Caspase 12 Caspase 13 Caspase 14
Odvozeno z ovoce	Papain Ficain Bromelain Actinidain
Calpain	CAPN1 CAPN2 CAPN3 CAPN5 CAPN6 CAPN7 CAPN8 CAPN9 CAPN10 CAPN11 CAPN12 CAPN13 CAPN14 CAPNS1 CAPNS2
Katepsin	B C F H K. L1 /L2 Ó S Ž Z
jiný	Clostripain Prokoagulant rakoviny Oddělit Autofagin Cruzipain