CBLL1 - CBLL1

CBLL1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2MQ1, 3VK6
Identifikátory
Aliasy	CBLL1, HAKAI, RNF188, Cbl protoonkogen jako 1
Externí ID	OMIM: 606872 MGI: 2144842 HomoloGene: 11734 Genové karty: CBLL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	107,761,667 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	31,499,616 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • identická vazba na protein; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • aktivita transferázy; • vazba iontů zinku;
Buněčná složka	• komplex ubikvitin ligázy; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • jaderná skvrna; • cytoplazma; • Komplex RNA N6-methyladenosin methyltransferáza;
Biologický proces	• pozitivní regulace buněčné migrace; • negativní regulace buněčné adheze; • pozitivní regulace endocytózy; • regulace buněčné adheze; • ubikvitinace bílkovin; • vstup bakterie do hostitelské buňky; • buněčná adheze; • Methylace mRNA; • vývoj mnohobuněčných organismů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	79872
	104836
	ENSG00000105879
	ENSMUSG00000020659
	Q75N03
	Q9JIY2
	NM_001284291; NM_024814
	NM_001253847; NM_001253848; NM_134048
	NP_001271220; NP_079090
	NP_001240776; NP_001240777; NP_598809
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

The E3 ubikvitin-protein ligáza Hakai (HAKAI) také známý jako Sekvencovitý protein transformující lymfom B linie linie Casitas 1 (CBLL1) je enzym že u lidí je kódováno CBLL1 gen.^[5] Tento gen kóduje E3 ubikvitinová ligáza pro E-kadherin komplex a zprostředkovává jeho ubikvitinace, endocytóza a degradace v lysozomy. Kódovaný protein obsahuje doménu RING-finger a předpokládá se také, že má roli při kontrole proliferace buněk.

Funkce

Hakai funguje jako Prst doména prsten -obsahující E3 ubikvitinová ligáza pro E-kadherin. Hakai zprostředkovává E-kadherin ubikvitinace a jeho degradace proteazomy. „Hakai“ znamená „zničení“ v japonský. Proteozomální degradaci E-kadherinu lze regulovat pomocí fosforylace. Hakai vazebné místo je součástí E-kadherinu cytoplazmatická doména který obsahuje několik tyrosiny.^[6] Tyrosinkinázy jako Src a Se setkal může fosforylovat E-kadherin a zvýšit vazbu Hakai na E-kadherin.^[7] Dva lysiny Bylo prokázáno, že cytoplazmatická doména E-kadherinu je místem pro ubikvitinaci.^[8] Hakai také komunikuje s spojovací faktor spojený s proteinem vázajícím polypyrimidinový trakt.^[9]

Viz také

CBL (gen); název genu „CBLL1“ pochází z „proteinu podobného Cbl 1“

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105879 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020659 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fujita Y, Krause G, Scheffner M, Zechner D, Leddy HE, Behrens J, Sommer T, Birchmeier W (březen 2002). „Hakai, protein podobný c-Cbl, ubikvitinuje a indukuje endocytózu komplexu E-kadherin“. Přírodní buněčná biologie. 4 (3): 222–31. doi:10.1038 / ncb758. PMID 11836526. S2CID 40423770.
^ Aparicio LA, Valladares M, Blanco M, Alonso G, Figueroa A (červen 2012). „Biologický vliv Hakai na rakovinu: desetileté hodnocení“. Recenze metastázy rakoviny. 31 (1–2): 375–86. doi:10.1007 / s10555-012-9348-x. PMC 3350634. PMID 22349934.
^ Mukherjee M, Chow SY, Yusoff P, Seetharaman J, Ng C, Sinniah S, Koh XW, Asgar NF, Li D, Yim D, Jackson RA, Yew J, Qian J, Iyu A, Lim YP, Zhou X, Sze SK Guy GR, Sivaraman J (březen 2012). „Struktura nové domény vázající fosfotyrosin v Hakai, která cílí na E-kadherin“. Časopis EMBO. 31 (5): 1308–19. doi:10.1038 / emboj.2011.496. PMC 3298002. PMID 22252131.
^ Hartsock A, Nelson WJ (2012). „Konkurenční regulace degradace juxtamembránové domény E-kadherinu vazbou p120-kateninu a ubikvitinací zprostředkovanou Hakai“. PLOS ONE. 7 (5): e37476. doi:10.1371 / journal.pone.0037476. PMC 3365061. PMID 22693575.
^ Figueroa A, Fujita Y, Gorospe M (listopad 2009). „Hacking RNA: Hakai podporuje tumorigenezi zvýšením funkce RNA vázání PSF“. Buněčný cyklus. 8 (22): 3648–51. doi:10,4161 / cc.8.22.9909. PMC 2808762. PMID 19855157.

externí odkazy

Člověk CBLL1 umístění genomu a CBLL1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105879 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020659 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11836526-5] Fujita Y, Krause G, Scheffner M, Zechner D, Leddy HE, Behrens J, Sommer T, Birchmeier W (březen 2002). „Hakai, protein podobný c-Cbl, ubikvitinuje a indukuje endocytózu komplexu E-kadherin“. Přírodní buněčná biologie. 4 (3): 222–31. doi:10.1038 / ncb758. PMID 11836526. S2CID 40423770.

[pmid22349934-6] Aparicio LA, Valladares M, Blanco M, Alonso G, Figueroa A (červen 2012). „Biologický vliv Hakai na rakovinu: desetileté hodnocení“. Recenze metastázy rakoviny. 31 (1–2): 375–86. doi:10.1007 / s10555-012-9348-x. PMC 3350634. PMID 22349934.

[pmid22252131-7] Mukherjee M, Chow SY, Yusoff P, Seetharaman J, Ng C, Sinniah S, Koh XW, Asgar NF, Li D, Yim D, Jackson RA, Yew J, Qian J, Iyu A, Lim YP, Zhou X, Sze SK Guy GR, Sivaraman J (březen 2012). „Struktura nové domény vázající fosfotyrosin v Hakai, která cílí na E-kadherin“. Časopis EMBO. 31 (5): 1308–19. doi:10.1038 / emboj.2011.496. PMC 3298002. PMID 22252131.

[8] Hartsock A, Nelson WJ (2012). „Konkurenční regulace degradace juxtamembránové domény E-kadherinu vazbou p120-kateninu a ubikvitinací zprostředkovanou Hakai“. PLOS ONE. 7 (5): e37476. doi:10.1371 / journal.pone.0037476. PMC 3365061. PMID 22693575.

[pmid19855157-9] Figueroa A, Fujita Y, Gorospe M (listopad 2009). „Hacking RNA: Hakai podporuje tumorigenezi zvýšením funkce RNA vázání PSF“. Buněčný cyklus. 8 (22): 3648–51. doi:10,4161 / cc.8.22.9909. PMC 2808762. PMID 19855157.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

Enzymy: CO CS a CN ligázy (ES 6.1-6.3)
6.1: Uhlík-kyslík	Aminoacyl tRNA syntetáza Alanin Arginin Asparagin Aspartát Cystein D-alanin - poly (fosforibitol) ligáza Glutamát Glutamin Glycin Histidin Isoleucin Leucin Lysin Methionin Fenylalanin Prolin Serine Threonin Tryptofan Tyrosin Valine
6.2: Uhlík-síra	Sukcinyl koenzym syntetáza Acetyl-CoA syntetáza Mastná kyselina s dlouhým řetězcem - CoA ligáza
6.3: Uhlík-dusík	Glutamin syntetáza Ubikvitin ligáza Cullin Von Hippel – Lindau nádorový supresor UBE3A Mdm2 Komplex podporující anafázu UBR1 Glutathion syntetáza CTP syntetáza Adenylosukcinát syntáza Argininosukcinát syntáza Holokarboxyláza syntetáza GMP syntáza Asparagin syntetáza Karbamoylfosfát syntetáza Já II Glutamát-cysteinová ligáza

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )