Viridiplantae - Viridiplantae
Viridiplantae | |
---|---|
![]() | |
Sortiment thalofyt Viridiplantae v a kamenný bazén, Tchaj-wan | |
Vědecká klasifikace ![]() | |
Doména: | Eukaryota |
(bez hodnocení): | Diaphoretickes |
(bez hodnocení): | Archaeplastida |
(bez hodnocení): | Viridiplantae Cavalier-Smith, 1981 |
Podskupiny | |
Synonyma | |
|
Viridiplantae (doslova „zelené rostliny“)[5] plocha clade z eukaryotický organismy, které obsahují přibližně 450 000–500 000 druhů a hrají důležitou roli v suchozemských i vodních ekosystémech.[6] Jsou tvořeny zelené řasy, které jsou primárně vodní, a suchozemské rostliny (embryofyty ), které se v nich objevily.[7][8][9] Zelené řasy tradičně vylučují suchozemské rostliny, což je činí paraphyletic skupina. Vzhledem k tomu, že si uvědomili, že embryofyty se vynořily zevnitř zelených řas, někteří autoři je začnou zahrnovat.[10][11][12][13][14] Mají buňky celulóza v jejich buněčných stěnách a primárních chloroplastech odvozených od endosymbióza s sinice které obsahují chlorofyly a a b a nedostatek fykobiliny.
V některých klasifikačních systémech byla skupina považována za a království,[15] pod různými jmény, např. Viridiplantae, Chlorobiontanebo jednoduše Plantae, druhý rozšiřuje tradiční rostlinná říše zahrnout zelené řasy. Adl et al., který vytvořil klasifikaci pro všechny eukaryoty v roce 2005 představil název Chloroplastida pro tuto skupinu, odrážející skupinu, která má primární chloroplasty se zelenou chlorofyl. Jméno Viridiplantae odmítli z toho důvodu, že některé druhy nejsou rostlinami, jak se tradičně chápe.[16] Viridiplantae se skládají ze dvou subtypů: Chlorophyta a Streptophyta stejně jako bazální Mesostigmatophyceae a Chlorokybophyceae.[17][18] Dohromady s Rhodophyta a glaukofyty, Viridiplantae jsou považovány za patřící do většího cladu zvaného Archaeplastida nebo Primoplantae.
Taxonomické hodnocení eukaryoty na základě myosin distribuce ukázala, že Viridiplantae ztratily myosiny třídy I.[19]
Fylogeneze a klasifikace
Leliaert et al. 2012
Zjednodušená fylogeneze Viridiplantae, podle Leliaert et al. 2012.[20]
- Viridiplantae
- chlorofyty jádra
- prasinofyty (paraphyletic)
Kladogram
Níže je uvedena konsensuální rekonstrukce vztahů zelených řas, založená hlavně na molekulárních datech.[22][20][21][23][12][24][25][18][26][27]
Viridiplantae/ |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zelené řasy |
Více konvenčně, Mesostigmatophyceae, Spirotaeniaa Cholokybophyceae jsou bazální Streptophyta.
Reference
- ^ Copeland HF (1938). "Království organismů". Kvart. Biol. 13 (4): 383–420. doi:10.1086/394568.
- ^ Copeland HF (1956). Klasifikace nižších organismů. Palo Alto: Pacific Books. p. 6.
- ^ Whittaker RH (leden 1969). „Nové koncepty království nebo organismů. Evoluční vztahy jsou lépe reprezentovány novými klasifikacemi než tradičními dvěma královstvími.“ (PDF). Věda. 163 (3863): 150–60. CiteSeerX 10.1.1.403.5430. doi:10.1126 / science.163.3863.150. PMID 5762760. Archivovány od originál (PDF) dne 2017-11-17. Citováno 2015-01-31.
- ^ van den Hoek C, Jahns HM (1978). Einführung in die Phykologie (v němčině). Stuttgart: Georg Thieme Verlag. ISBN 9783135511016.
- ^ A b Cavalier-Smith T (1981). „Království Eukaryote: sedm nebo devět?“. Bio systémy. 14 (3–4): 461–81. doi:10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID 7337818.
- ^ Leebens-Mack JH, Barker MS, Carpenter EJ, Deyholos MK, Gitzendanner MA, Graham SW a kol. (Iniciativa Tisíc rostlinných transkriptomů) (říjen 2019). „Tisíc transkriptomů rostlin a fylogenomika zelených rostlin“. Příroda. 574 (7780): 679–685. doi:10.1038 / s41586-019-1693-2. PMC 6872490. PMID 31645766.
- ^ Cocquyt E, Verbruggen H, Leliaert F, Zechman FW, Sabbe K, De Clerck O (únor 2009). "Zisk a ztráta genů faktoru prodloužení v zelených řasách". BMC Evoluční biologie. 9: 39. doi:10.1186/1471-2148-9-39. PMC 2652445. PMID 19216746.
- ^ Becker B (2007). Funkce a vývoj vakuolárního kompartmentu v zelených řasách a suchozemských rostlinách (Viridiplantae). International Review of Cytology. 264. str.1–24. doi:10.1016 / S0074-7696 (07) 64001-7. ISBN 9780123742636. PMID 17964920.
- ^ Kim E, Graham LE (červenec 2008). Redfield RJ (ed.). „Analýza EEF2 zpochybňuje monofylii Archaeplastida a Chromalveolata“. PLOS ONE. 3 (7): e2621. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2621K. doi:10.1371 / journal.pone.0002621. PMC 2440802. PMID 18612431.
- ^ Delwiche CF, Timme RE (červen 2011). „Rostliny“. Aktuální biologie. 21 (11): R417–22. doi:10.1016 / j.cub.2011.04.021. PMID 21640897.
- ^ „Domovská stránka zelených řas Charophycean“. www.life.umd.edu. Citováno 2018-02-24.
- ^ A b Ruhfel BR, Gitzendanner MA, Soltis PS, Soltis DE, Burleigh JG (únor 2014). „Od řas k krytosemenným rostlinám odvozujícím fylogenezi zelených rostlin (Viridiplantae) z 360 plastidových genomů“. BMC Evoluční biologie. 14: 23. doi:10.1186/1471-2148-14-23. PMC 3933183. PMID 24533922.
- ^ Delwiche CF, Cooper ED (říjen 2015). „Evoluční původ pozemské flóry“. Aktuální biologie. 25 (19): R899–910. doi:10.1016 / j.cub.2015.08.029. PMID 26439353.
- ^ Parfrey LW, Lahr DJ, Knoll AH, Katz LA (srpen 2011). „Odhad načasování časné eukaryotické diverzifikace pomocí multigenových molekulárních hodin“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 108 (33): 13624–9. Bibcode:2011PNAS..10813624P. doi:10.1073 / pnas.1110633108. PMC 3158185. PMID 21810989.
- ^ „Viridiplantae“. Citováno 2009-03-08.
- ^ Adl SM, Simpson AG, Farmer MA, Andersen RA, Anderson OR, Barta JR, et al. (2005). „Nová vyšší klasifikace eukaryot s důrazem na taxonomii protistů“. The Journal of Eukaryotic Microbiology. 52 (5): 399–451. doi:10.1111 / j.1550-7408.2005.00053.x. PMID 16248873. S2CID 8060916.
- ^ Simon A, Glöckner G, Felder M, Melkonian M, Becker B (únor 2006). „EST analýza šupinatě zeleného bičíkatého Mesostigma viride (Streptophyta): důsledky pro vývoj zelených rostlin (Viridiplantae)“. Biologie rostlin BMC. 6: 2. doi:10.1186/1471-2229-6-2. PMC 1413533. PMID 16476162.
- ^ A b Sánchez-Baracaldo P, Raven JA, Pisani D, Knoll AH (září 2017). „Rané fotosyntetické eukaryoty obývané stanoviště s nízkou slaností“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 114 (37): E7737 – E7745. doi:10.1073 / pnas.1620089114. PMC 5603991. PMID 28808007.
- ^ Odronitz F, Kollmar M (2007). „Kreslení stromu eukaryotického života na základě analýzy 2269 ručně anotovaných myosinů od 328 druhů“. Genome Biology. 8 (9): R196. doi:10.1186 / gb-2007-8-9-r196. PMC 2375034. PMID 17877792.
- ^ A b Leliaert F, Smith DR, Moreau H, Herron MD, Verbruggen H, Delwiche CF, De Clerck O (2012). "Fylogeneze a molekulární vývoj zelených řas" (PDF). Kritické recenze v rostlinných vědách. 31: 1–46. doi:10.1080/07352689.2011.615705. S2CID 17603352.
- ^ A b Marin B (září 2012). „Vnořeno do třídy Chlorellales nebo nezávislé třídy? Fylogeneze a klasifikace Pedinophyceae (Viridiplantae) odhalená molekulárními fylogenetickými analýzami kompletních operonů rRNA kódovaných nukleárními a plastidy“. Protist. 163 (5): 778–805. doi:10.1016 / j.protis.2011.11.004. PMID 22192529.
- ^ Lewis LA, McCourt RM (říjen 2004). „Zelené řasy a původ suchozemských rostlin“. American Journal of Botany. 91 (10): 1535–56. doi:10,3732 / ajb.91.10.1535. PMID 21652308.
- ^ Laurin-Lemay S, Brinkmann H, Philippe H (srpen 2012). „Původ suchozemských rostlin se vrátil ve světle sekvenční kontaminace a chybějících údajů“. Aktuální biologie. 22 (15): R593–4. doi:10.1016 / j.cub.2012.06.013. PMID 22877776.
- ^ Leliaert F, Tronholm A, Lemieux C, Turmel M, DePriest MS, Bhattacharya D, Karol KG, Fredericq S, Zechman FW, Lopez-Bautista JM (květen 2016). „Fylogenomické analýzy chloroplastů odhalily nejhlubší větev větví linie Chlorophyta, Palmophyllophyceae. Nov.“. Vědecké zprávy. 6: 25367. Bibcode:2016NatSR ... 625367L. doi:10.1038 / srep25367. PMC 4860620. PMID 27157793.
- ^ Adl SM, Simpson AG, Lane CE, Lukeš J, Bass D, Bowser SS, Brown MW, Burki F, Dunthorn M, Hampl V, Heiss A, Hoppenrath M, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, McManus H, Mitchell EA, Mozley-Stanridge SE, Parfrey LW, Pawlowski J, Rueckert S, Shadwick L, Shadwick L, Schoch CL, Smirnov A, Spiegel FW (září 2012). „Revidovaná klasifikace eukaryot“. The Journal of Eukaryotic Microbiology. 59 (5): 429–93. doi:10.1111 / j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872. PMID 23020233.
- ^ Gitzendanner MA, Soltis PS, Wong GK, Ruhfel BR, Soltis DE (březen 2018). „Plastidová fylogenomická analýza zelených rostlin: miliarda let evoluční historie“. American Journal of Botany. 105 (3): 291–301. doi:10.1002 / ajb2.1048. PMID 29603143.
- ^ Riediger M, Hihara Y, Hess WR (01.06.2018). „Od sinic a řas po suchozemské rostliny: regulační síť RpaB / Ycf27 v přechodu“. Perspektivy ve fykologii. 5 (1): 13–25. doi:10.1127 / pip / 2018/0078.