Paulinella - Paulinella

Paulinella
Paulinella chromatophora.jpg
Vědecká klasifikace E
Clade:SAR
Kmen:Cercozoa
Třída:Imbricatea
Objednat:Euglyphida
Rodina:Paulinellidae
Rod:Paulinella
Lauterborn[1]
Zadejte druh
Paulinella chromatophora
Lauterborn 1895
Druh
Synonyma

Calycomonas Lohmann 1908

Paulinella je rod asi devíti[6] druhy sladké vody améboidy.

Jeho nejslavnějšími členy jsou tři fotosyntetické druhy P. chromatophora, P. micropora a P. longichromatophora, přičemž první dvě jsou sladkovodní formy a třetí mořská forma,[7] který nedávno (z evolučního hlediska) přijal a sinice jako endosymbiont.[8] K události trvalé endosymbiózy pravděpodobně došlo u a kyanobiont.[9] Plastid se často označuje jako „kyanel“ nebo chromatofor. Endosymbiotická událost se stala asi před 90–140 miliony let u bakteriálních druhů, které se lišily asi před 500 miliony let od některých známých sinic.[10][11] To je zarážející, protože chloroplasty všech ostatních známých fotosyntetických eukaryoty pocházejí nakonec z jediného cyanobakteria endosymbionta, který byl přijat pravděpodobně před více než miliardou let rodovým archaeplastidan (a následně přijat do jiných eukaryot skupiny, dalšími událostmi endosymbiózy). The P. chromatophora symbiont souvisela s Prochlorococcus a Synechococcus sinice (sestra ve skupině sestávající z žijících členů těchto dvou rodů).[3] Chromoforový genom prošel redukcí a je nyní jen o třetinu větší než genom jeho nejbližších volně žijících příbuzných, ale stále 10krát větší než většina plastidových genomů. Některé z genů byly ztraceny, jiné migrovaly do jádra améby prostřednictvím přenosu endosymbiotických genů.[12] Jiné geny zdegenerovaly kvůli Mullerova ráčna - akumulace škodlivých mutací způsobených genetickou izolací a pravděpodobně byly nahrazeny geny z jiných mikrobů horizontální přenos genů.[13] Jaderné geny P. chromatophora (regiony, které symbiont nezměnil) nejvíce souvisejí s heterotrofní P. ovalis.[14] P. ovalis také mají alespoň dva geny podobné sinicím, které byly pravděpodobně integrovány do svého genomu prostřednictvím horizontálního přenosu genů ze své kořisti sinic. Podobné geny mohly fotosyntetické druhy připravit tak, aby přijímaly chromatofor.[15]

Reference

  1. ^ M.D. Guiry in Guiry, M.D. & Guiry, G.M. 2013. AlgaeBase. Celosvětová elektronická publikace, National University of Ireland, Galway. http://www.algaebase.org; prohledáno 4. března 2013.
  2. ^ A b C d E F G h „Paulinella“. Integrovaný taxonomický informační systém. Citováno 28. ledna 2008.
  3. ^ A b Birger Marin, Eva CM Nowack, Gernot Glöckner a Michael Melkonian (2007). „Předchůdce chromatoforu Paulinella získal karboxysomální operon horizontálním přenosem genů z γ-proteobakteria podobného Nitrococcus“. BMC Evol. Biol. 7: 85. doi:10.1186/1471-2148-7-85. PMC  1904183. PMID  17550603.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  4. ^ A b „Paulinella“. Taxonomie NCBI. Bethesda, MD: Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 4. ledna 2019. Řádkové (plné) buněčné organismy; Eukaryota; Rhizaria; Cercozoa; Imbricatea; Silicofilosea; Euglyphida; Paulinellidae
  5. ^ "Paulinella ovalis". Citováno 31. ledna 2008.
  6. ^ „Eukaryoty“. Citováno 28. ledna 2008.
  7. ^ Evoluční dynamika chromatoforového genomu u tří fotosyntetických druhů Paulinella - Nature
  8. ^ Laura Wegener Parfrey; Erika Barbero; Elyse Lasser; Micah Dunthorn; Debashish Bhattacharya; David J Patterson & Laura A Katz (prosinec 2006). „Hodnocení podpory pro současnou klasifikaci eukaryotické rozmanitosti“. PLOS Genet. 2 (12): e220. doi:10.1371 / journal.pgen.0020220. PMC  1713255. PMID  17194223.
  9. ^ Vries, Jan de; Gould, Sven B. (15. ledna 2018). „Monoplastidové úzké hrdlo v oblasti řas a vývoje rostlin“. Journal of Cell Science. 131 (2): jcs203414. doi:10.1242 / jcs.203414. ISSN  0021-9533. PMID  28893840.
  10. ^ Sánchez-Baracaldo, Patricia; Raven, John A .; Pisani, Davide; Knoll, Andrew H. (12. září 2017). „Rané fotosyntetické eukaryoty obývané stanoviště s nízkou slaností“. Sborník Národní akademie věd. 114 (37): E7737 – E7745. doi:10.1073 / pnas.1620089114. ISSN  0027-8424. PMC  5603991. PMID  28808007.
  11. ^ Pérez-Zamorano, Bernardo; Valadez-Cano, Cecilio; Delaye, Luis (15. března 2016). „Jak skutečně stará je Paulinella Chromatophora?“ Šek | url = hodnota (Pomoc). PLOS Currents Strom života. 8. doi:10,1371 / proudy.tol.e68a099364bb1a1e129a17b4e06b0c6b. PMC  4866557. PMID  28515968. Citováno 4. dubna 2019 - přescurents.plos.org.
  12. ^ Zhang, Ru; Nowack, Eva C. M .; Cena, Dana C .; Bhattacharya, Debashish; Grossman, Arthur R. (1. dubna 2017). „Dopad intenzity a kvality světla na expresi chromatoforů a jaderných genů u améby Paulinella chromatophora s rodícími se fotosyntetickými organelami“. The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology. 90 (2): 221–234. doi:10.1111 / tpj.13488. PMID  28182317.
  13. ^ Tato malá améba se dopustila velké krádeže: Vědci odhalili, jak málo známá améba pohltila bakterii, aby se stala fotosyntetickou
  14. ^ Patrick J. Keeling (2004). „Rozmanitost a evoluční historie plastidů a jejich hostitelů“. American Journal of Botany. 91 (10): 1481–1493. doi:10.3732 / ajb.91.10.1481. PMID  21652304.
  15. ^ Steal My Sunshine | Vědecký časopis