Signální peptidová peptidáza - Signal peptide peptidase

Peptidáza_A22B
Identifikátory
SymbolPeptidáza_A22B
PfamPF04258
Pfam klanCL0130
InterProIPR007369
MEROPSA22
Peptidáza_A24
Identifikátory
SymbolPeptidáza_A24
PfamPF01478
Pfam klanCL0130
InterProIPR000045
MEROPSA24
OPM nadčeleď244
OPM protein3s0x

V molekulární biologii se Signální peptid Peptidáza (SPP) je typ proteinu, který specificky štěpí části jiných proteinů. Je to intramembrána aspartylproteáza se zachovaným aktivním webem motivy „YD“ a „GxGD“ v sousedství transmembránové domény (TMD). Jeho sekvence jsou vysoce konzervované u různých druhů obratlovců. SPP štěpí zbytek signální peptidy zanechané v membráně působením signální peptidáza[1] a také hraje klíčovou roli v imunní dohled a dozrávání určitých virové proteiny.[2]

Biologická funkce

Fyziologicky SPP zpracovává signální peptidy klasických MHC třída I preproteiny. Poté je prezentován fragment štěpení dlouhý devět aminokyselin HLA-E receptory a moduluje aktivitu přirozené zabijácké buňky.[3]

SPP také hraje patofyziologickou roli; štěpí strukturní nukleokapsidový protein (také známý jako jádrový protein) proteinu Hepatitida C. virus, a tím ovlivňuje rychlost reprodukce viru.[4]

U myší slouží neamerní peptid pocházející z proteinu SPP jako minoritní histokompatibilní antigen HM13 který hraje roli v odmítnutí transplantátu[5][6]

Homologní proteázy SPPL2A a SPPL2B podporovat intramembránové štěpení TNFa v aktivován dendritické buňky a může hrát imunomodulační role.[7][8] U SPPL2c a SPPL3 nejsou známy žádné substráty.

SPP nevyžadují kofaktory jak prokázal výraz v bakterie a čištění proteolyticky aktivní formy. C-koncová oblast definuje funkční doménu, která je sama o sobě dostatečná pro proteolytický aktivita.[9]

Vedoucí peptidáza typu IV

Další rodina signálních aspartátových endopeptidáz byla nalezena v bakteriích. Bakterie produkují řadu bílkovin prekurzory které podstoupí posttranslační methylace a proteolýza před vylučování jako aktivní proteiny. Prepilinové vedoucí peptidázy typu IV jsou enzymy které zprostředkovávají tento typ posttranslační modifikace. Pilin typu IV je protein nacházející se na povrchu Pseudomonas aeruginosa, Neisseria gonorrhoeae a další gramnegativní patogeny. Pilin podjednotky připojte infikování organismus na povrch hostitele epitelové buňky. Jsou syntetizovány jako prepilinové podjednotky, které se liší od zralého pilinu tím, že obsahují 6-8 zbytek vedoucí peptid skládající se z nabitého aminokyseliny. Zralé pilíře typu IV také obsahují a methylovaný N-terminál fenylalanin zbytek.

Bifunkční enzym prepilin peptidáza (PilD) z Pseudomonas aeruginosa je klíčovým determinantem u obou typů IV pilus biogeneze a extracelulární sekrece bílkovin, v roli vedoucí peptidázy a methyl transferáza (MTase). Je zodpovědný za endopeptidové výstřih jedinečného vůdce peptidy které charakterizují prekurzory pilinu typu IV a také bílkoviny s homologní vedoucí sekvence které jsou základními složkami dráhy obecné sekrece nalezené v různých gramnegativních látkách patogeny. Po odstranění hlavních peptidů je stejný enzym zodpovědný za druhý posttranslační modifikace který charakterizuje piliny typu IV a jejich homology, jmenovitě N-methylace nově exponovaného N-terminálu aminokyselina zbytek.[10]

Viz také

Reference

  1. ^ Weihofen A, Binns K, Lemberg MK, Ashman K, Martoglio B (2002). "Identifikace signálního peptidu peptidázy, aspartátové proteázy presenilinového typu". Věda. 296 (5576): 2215–8. doi:10.1126 / science.1070925. PMID  12077416.
  2. ^ Martoglio B, Golde TE (říjen 2003). „Intramembránové štěpení aspartátových proteáz a onemocnění: preseniliny, signální peptidová peptidáza a jejich homology“. Hučení. Mol. Genet. 12 Spec No 2: R201-6. doi:10,1093 / hmg / ddg303. PMID  12966028.
  3. ^ Lemberg MK, Bland FA, Weihofen A, Braud VM, Martoglio B (2001). „Intramembránová proteolýza signálních peptidů: zásadní krok při generování epitopů HLA-E“. J. Immunol. 167 (11): 6441–6. doi:10,4049 / jimmunol.167.11.6441. PMID  11714810.
  4. ^ Okamoto K, Mori Y, Komoda Y, Okamoto T, Okochi M, Takeda M, Suzuki T, Moriishi K, Matsuura Y (2008). „Intramembránové zpracování signální peptidovou peptidázou reguluje membránovou lokalizaci jádrového proteinu viru hepatitidy C a jeho šíření“. J. Virol. 82 (17): 8349–61. doi:10.1128 / JVI.00306-08. PMC  2519675. PMID  18562515.
  5. ^ Snell GD, Cudkowicz G, Bunker HP (červen 1967). "Histokompatibilní geny myší. VII. H-13, nový histokompatibilní lokus v páté vazebné skupině". Transplantace. 5 (3): 492–503. doi:10.1097/00007890-196705000-00011. PMID  5340356.
  6. ^ „Entrez Gene: H13 histocompatibility (minor) 13“.
  7. ^ Friedmann E, Hauben E, Maylandt K a kol. (2006). „SPPL2a a SPPL2b podporují intramembránovou proteolýzu TNFα v aktivovaných dendritických buňkách za účelem spuštění produkce IL-12“. Nat. Cell Biol. 8 (8): 843–8. doi:10.1038 / ncb1440. PMID  16829952.
  8. ^ Fluhrer R, Grammer G, Israel L a kol. (2006). „Intramembránové štěpení TNFalfa gama-sekretázou podobné aspartylproteáze GxGD SPPL2b“. Nat. Cell Biol. 8 (8): 894–6. doi:10.1038 / ncb1450. PMID  16829951.
  9. ^ Narayanan S, Sato T, Wolfe MS (červenec 2007). „C-koncová oblast signální peptidové peptidázy definuje funkční doménu pro intramembránovou katalýzu aspartátové proteázy“. J. Biol. Chem. 282 (28): 20172–9. doi:10,1074 / jbc.M701536200. PMID  17517891.
  10. ^ Lory S, Strom MS (červen 1997). "Vztah struktury a funkce prepilinové peptidázy typu IV Pseudomonas aeruginosa - přehled". Gen. 192 (1): 117–21. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00830-X. PMID  9224881.

Další čtení

externí odkazy