Plasmepsin - Plasmepsin
| Plasmepsin I | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 3.4.23.38 | ||||||||
| Číslo CAS | 180189-87-1 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
| Plasmepsin II | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 3.4.23.39 | ||||||||
| Číslo CAS | 159447-18-4 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
Plasmepsiny jsou třídou nejméně 10 enzymů (ES 3.4.23.38 a ES 3.4.23.39 ) produkovaný Plasmodium falciparum parazit. Existuje deset různých izoforem těchto proteinů a deset genů, které je kódují Plasmodium (Plm I, II, III, IV, V, VI, VII, IX, X a HAP). Bylo navrženo, že rodina plazmepsinů je u jiného člověka menší Plasmodium druh. Exprese Plm I, II, IV, V, IX, X a HAP se vyskytuje v erytrocytovém cyklu a exprese Plm VI, VII, VIII se vyskytuje v exoerytrocytovém cyklu. Díky své činnosti degradující hemoglobin jsou důležitou příčinou příznaků u malárie trpící. V důsledku toho je tato skupina enzymů potenciálním cílem pro antimalarická léčiva.
Plazmepsiny jsou kyselina asparagová proteázy, což znamená jejich Aktivní stránky obsahuje dva kyselina asparagová zbytky. Tihle dva kyselina asparagová zbytek působí jako donor protonů a akceptor protonů a katalyzuje hydrolýzu peptidová vazba v bílkoviny.
Existují čtyři typy plazmepsinů, které spolu úzce souvisejí, ale liší se specificitou místa štěpení. Plazmepsiny I a II se štěpí hemoglobin mezi zbytky Fenylalanin 33 a Leucin 34 podjednotky α-globinu.
Název plazmepsin může pocházet z Plasmodium (organismus) a pepsin (běžný proteáza kyseliny asparagové s podobnou molekulární strukturou).
Nejbližší (nepatogenní) enzymatický ekvivalent u lidí je beta-sekretáza enzym.
Reference
- ^ Silva AM, Lee AY, Gulnik SV, Maier P, Collins J, Bhat TN, Collins PJ, Cachau RE, Luker KE, Gluzman IY, Francis SE, Oksman A, Goldberg DE, Erickson JW (září 1996). „Struktura a inhibice plazmepsinu II, enzymu degradujícího hemoglobin z Plasmodium falciparum“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (19): 10034–9. doi:10.1073 / pnas.93.19.10034. PMC 38331. PMID 8816746.
Další čtení
- Dame JB, Reddy GR, Yowell CA, Dunn BM, Kay J, Berry C (1994). "Sekvence, exprese a modelovaná struktura aspartátové proteinázy z parazita lidské malárie Plasmodium falciparum". Mol. Biochem. Parazitol. 64 (2): 177–90. doi:10.1016/0166-6851(94)90024-8. PMID 7935597.
- Bernstein NK, Cherney MM, Loetscher H, Ridley RG, James MN (1999). "Krystalová struktura nového aspartátového proteinasu zymogenu proplasmepsinu II z plasmodium falciparum". Nat. Struct. Biol. 6 (1): 32–7. doi:10.1038/4905. PMID 9886289.
- Karubiu W, Bhakat S, Soliman ME (2015). „Flap Dynamika plazmepsinproteáz: Navrhované parametry a přehled molekulární dynamiky“. Mol. Biosyst. doi:10.1039 / C4MB00631C.
externí odkazy
- The MEROPS online databáze peptidáz a jejich inhibitorů: Plasmepsin I A01.022, Plasmepsin II A01.023
- plazmepsin v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)