SPPL2B - SPPL2B

SPPL2B
Identifikátory
Aliasy	SPPL2B, IMP-4, IMP4, PSH4, PSL1, signální peptidová peptidáza jako 2B
Externí ID	OMIM: 608239 MGI: 1920468 HomoloGene: 10605 Genové karty: SPPL2B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	2,355,095 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	80,868,708 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita homodimerizace proteinu; • aktivita endopeptidázy aspartátového typu; • aktivita peptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • aktivita aspartové endopeptidázy, intramembránové štěpení;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • endozom; • centrosome; • Golgiho aparát; • membrána; • integrální součást cytoplazmatické strany membrány endoplazmatického retikula; • Golgiho membrána; • nukleoplazma; • lysozomální membrána; • aktinový cytoskelet; • Golgiho membrána vezikul; • lysozom; • integrální součást lumenální strany membrány endoplazmatického retikula; • endosomová membrána; • buněčná membrána;
Biologický proces	• proteolýza membránových proteinů; • proteolýza; • proteolýza ektodomény membránového proteinu; • membránový protein intracelulární doména proteolýza; • regulace imunitní odpovědi; • regulace signální dráhy zprostředkované faktorem nekrózy nádorů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	56928
	73218
	ENSG00000005206
	ENSMUSG00000035206
	Q8TCT7
	Q3TD49
	NM_001077238; NM_152988
	NM_175195; NM_001358803; NM_001358804
	NP_001070706; NP_694533
	NP_780404; NP_001345732; NP_001345733
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Signální peptid jako peptidáza 2B, také známý jako SPPL2B, je člověk gen.^[5]

Tento gen je členem signální peptid peptidáza rodina podobná proteázám (SPPL) s konzervovanými motivy aktivního místa „YD“ a „GxGD“ v sousedních transmembránových doménách (TMD). Tento enzym se lokalizuje v endosomech, lysozomech a plazmatické membráně. Tento protein hraje roli ve vrozené a adaptivní imunitě štěpením TNFa v aktivován dendritické buňky.^[6]^[7] Pro tento gen bylo nalezeno několik variant transkriptu kódujících různé izoformy.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000005206 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035206 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SPPL2B signální peptid jako peptidáza 2B“.
^ Friedmann E, Hauben E, Maylandt K a kol. (2006). „SPPL2a a SPPL2b podporují intramembránovou proteolýzu TNFalfa v aktivovaných dendritických buňkách za účelem spuštění produkce IL-12“. Nat. Cell Biol. 8 (8): 843–8. doi:10.1038 / ncb1440. PMID 16829952. S2CID 129089.
^ Fluhrer R, Grammer G, Israel L a kol. (2006). „Intramembránové štěpení TNFalfa gama-sekretázou podobné aspartylproteáze GxGD SPPL2b“. Nat. Cell Biol. 8 (8): 894–6. doi:10.1038 / ncb1450. PMID 16829951. S2CID 23712486.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Nagase T, Kikuno R, Ishikawa K a kol. (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (2): 143–50. doi:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID 10819331.
Weihofen A, Binns K, Lemberg MK a kol. (2002). "Identifikace signálního peptidu peptidázy, aspartátové proteázy presenilinového typu". Věda. 296 (5576): 2215–8. doi:10.1126 / science.1070925. PMID 12077416. S2CID 45633906.
Grigorenko AP, Moliaka YK, Korovaitseva GI, Rogaev EI (2003). "Nová třída polytopických proteinů s doménami spojenými s domnělou aktivitou proteázy". Biochemistry Mosc. 67 (7): 826–35. doi:10.1023 / A: 1016365227942. PMID 12139484. S2CID 11785597.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Grimwood J, Gordon LA, Olsen A a kol. (2004). „Sekvence DNA a biologie lidského chromozomu 19“ (PDF). Příroda. 428 (6982): 529–35. doi:10.1038 / nature02399. PMID 15057824. S2CID 4420825.
Friedmann E, Lemberg MK, Weihofen A, et al. (2005). „Konsenzuální analýza signální peptidové peptidázy a homologních lidských aspartátových proteáz odhaluje opačnou topologii katalytických domén ve srovnání s preseniliny“. J. Biol. Chem. 279 (49): 50790–8. doi:10,1074 / jbc.M407898200. PMID 15385547.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Krawitz P, Haffner C, Fluhrer R a kol. (2006). „Diferenciální lokalizace a identifikace kritického aspartátu naznačují neredundantní proteolytické funkce presenilinových homologů SPPL2b a SPPL3“. J. Biol. Chem. 280 (47): 39515–23. doi:10,1074 / jbc.M501645200. PMID 15998642.
Fluhrer R, Grammer G, Israel L a kol. (2006). „Intramembránové štěpení TNFalfa gama-sekretázou podobné aspartylproteáze GxGD SPPL2b“ (PDF). Nat. Cell Biol. 8 (8): 894–6. doi:10.1038 / ncb1450. PMID 16829951. S2CID 23712486.
Friedmann E, Hauben E, Maylandt K a kol. (2006). „SPPL2a a SPPL2b podporují intramembránovou proteolýzu TNFalfa v aktivovaných dendritických buňkách za účelem spuštění produkce IL-12“. Nat. Cell Biol. 8 (8): 843–8. doi:10.1038 / ncb1440. PMID 16829952. S2CID 129089.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000005206 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035206 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: SPPL2B signální peptid jako peptidáza 2B“.

[6] Friedmann E, Hauben E, Maylandt K a kol. (2006). „SPPL2a a SPPL2b podporují intramembránovou proteolýzu TNFalfa v aktivovaných dendritických buňkách za účelem spuštění produkce IL-12“. Nat. Cell Biol. 8 (8): 843–8. doi:10.1038 / ncb1440. PMID 16829952. S2CID 129089.

[7] Fluhrer R, Grammer G, Israel L a kol. (2006). „Intramembránové štěpení TNFalfa gama-sekretázou podobné aspartylproteáze GxGD SPPL2b“. Nat. Cell Biol. 8 (8): 894–6. doi:10.1038 / ncb1450. PMID 16829951. S2CID 23712486.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]