Beta-sekretáza 2 - Beta-secretase 2

BACE2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EWY, 3 ZKG, 3ZKI, 3ZKM, 3 ZKN, 3ZKQ, 3 ZKS, 3ZKX, 3ZL7, 3ZLQ, 4BEL, 4BFB
Identifikátory
Aliasy	BACE2, AEPLC, ALP56, ASP1, ASP21, BAE2, CDA13, CEAP1, DRAP, enzym štěpící APP v beta místě, beta-sekretáza 2
Externí ID	OMIM: 605668 MGI: 1860440 HomoloGene: 22696 Genové karty: BACE2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 21 (lidský)
Konec	41,282,530 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	97,442,936 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy; • vazba amyloid-beta; • aktivita hydrolázy; • aktivita endopeptidázy aspartátového typu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • povrch buňky; • endosom; • Golgiho aparát; • endoplazmatické retikulum; • membrána; • buněčná membrána; • cytoplazma; • trans-Golgiho síť; • hustá granule jádra;
Biologický proces	• zpracování peptidových hormonů; • proteinový katabolický proces; • amyloid-beta metabolický proces; • negativní regulace procesu biosyntézy proteinu amyloidního prekurzoru; • proteolýza; • proteolýza ektodomény membránového proteinu; • aktivace astrocytů; • homeostáza glukózy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	25825
	56175
	ENSG00000182240
	ENSMUSG00000040605
	Q9Y5Z0
	Q9JL18
	NM_138992; NM_012105; NM_138991
	NM_019517
	NP_036237; NP_620476; NP_620477
	NP_062390
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Beta-sekretáza 2 (ES 3.4.23.45, také známý jako Memapsin-1) je enzym^[5]^[6]^[7]^[8] který štěpí Glu-Val-Asn-Leu! Asp-Ala-Glu-Phe ve švédské variantě Alzheimerova amyloidního prekurzorového proteinu. BACE2 je blízko homolog z BACE1.

Funkce

Mozková depozice peptidu amyloidu beta je časným a kritickým rysem Alzheimerova choroba a častá komplikace Downův syndrom. Amyloid beta peptid je generován proteolytickým štěpením amyloidního prekurzorového proteinu 2 proteázami, z nichž jednou je protein kódovaný tímto genem. Tento gen se lokalizuje do „kritické oblasti dolů“ chromozomu 21. Kódovaný protein, člen rodiny proteinů peptidázy Al, je integrální membránový glykoprotein typu I a aspartátová proteáza. Pro tento gen byly popsány tři varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[8]Bylo hlášeno, že BACE2 je hlavní proteáza, která zprostředkovává uvolňování amyloidogenní ektodomény 17. Pmel v melanocytech. ^[9]

Interakce

BACE2 bylo prokázáno komunikovat s GGA1^[10] a GGA2.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000182240 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040605 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Turner, R.T .; Loy, J. A.; Nguyen, C .; Devasamudram, T .; Ghosh, A.K .; Koelsch, G .; Tang, J. (2002). „Specifičnost memapsinu 1 a její důsledky pro návrh selektivity inhibitorů memapsinu 2 (β-sekretázy)“. Biochemie. 41 (27): 8742–8746. doi:10.1021 / bi025926t. PMID 12093293.
^ Solans A, Estivill X, de La Luna S (září 2000). „Nová aspartylproteáza na 21q22.3, BACE2, je velmi podobná Alzheimerově amyloidovému prekurzorovému proteinu beta-sekretase“. Cytogenetika a genetika buněk. 89 (3–4): 177–84. doi:10.1159/000015608. PMID 10965118. S2CID 39880508.
^ Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, Watanabe H, Yada T, Park HS, Toyoda A, Ishii K, Totoki Y, Choi DK, Groner Y, Soeda E, Ohki M, Takagi T, Sakaki Y, Taudien S, Blechschmidt K , Polley A, Menzel U, Delabar J, Kumpf K, Lehmann R, Patterson D, Reichwald K, Rump A, Schillhabel M, Schudy A, Zimmermann W, Rosenthal A, Kudoh J, Schibuya K, Kawasaki K, Asakawa S, Shintani A, Sasaki T, Nagamine K, Mitsuyama S, Antonarakis SE, Minoshima S, Shimizu N, Nordsiek G, Hornischer K, Brant P, Scharfe M, Schon O, Desario A, Reichelt J, Kauer G, Blocker H, Ramser J, Beck A, Klages S, Hennig S, Riesselmann L, Dagand E, Haaf T, Wehrmeyer S, Borzym K, Gardiner K, Nizetic D, Francis F, Lehrach H, Reinhardt R, Yaspo ML (květen 2000). „Sekvence DNA lidského chromozomu 21“. Příroda. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Natur.405..311H. doi:10.1038/35012518. PMID 10830953.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BACE2 beta-site APP-štěpící enzym 2“.
^ BACE2 zpracovává PMEL za vzniku melanosomové amyloidové matrice v pigmentových buňkách Pubmed
^ ^A ^b He X, Chang WP, Koelsch G, Tang J (červenec 2002). „Cytosolická doména memapsinu 2 (beta-sekretáza) se váže na domény VHS GGA1 a GGA2: důsledky pro mechanismus endocytózy memapsinu 2“. FEBS Dopisy. 524 (1–3): 183–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03052-1. PMID 12135764. S2CID 42042430.

Další čtení

Aplin AE, Gibb GM, Jacobsen JS, Gallo JM, Anderton BH (srpen 1996). „In vitro fosforylace cytoplazmatické domény amyloidního prekurzorového proteinu glykogensyntázou kinázou-3beta“. Journal of Neurochemistry. 67 (2): 699–707. doi:10.1046 / j.1471-4159.1996.67020699.x. PMID 8764598. S2CID 11133791.
Yan R, Bienkowski MJ, Shuck ME, Miao H, Tory MC, Pauley AM, Brashier JR, Stratman NC, Mathews WR, Buhl AE, Carter DB, Tomasselli AG, Parodi LA, Heinrikson RL, Gurney ME (prosinec 1999). „Membránou ukotvená aspartylproteáza s aktivitou beta-sekretázy Alzheimerovy choroby“. Příroda. 402 (6761): 533–7. Bibcode:1999 Natur.402..533Y. doi:10.1038/990107. PMID 10591213. S2CID 4320087.
Sadik G, Kaji H, Takeda K, Yamagata F, Kameoka Y, Hashimoto K, Miyanaga K, Shinoda T (listopad 1999). "Zpracování amyloidního prekurzorového proteinu in vitro katepsinem D". International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 31 (11): 1327–37. doi:10.1016 / S1357-2725 (99) 00053-9. PMID 10605825.
Hussain I, Powell D, Howlett DR, Tew DG, Meek TD, Chapman C, Gloger IS, Murphy KE, Southan CD, Ryan DM, Smith TS, Simmons DL, Walsh FS, Dingwall C, Christie G (prosinec 1999). "Identifikace nové aspartátové proteázy (Asp 2) jako beta-sekretázy". Molekulární a buněčné neurovědy. 14 (6): 419–27. doi:10,1006 / mcne.1999.0811. PMID 10656250. S2CID 54308213.
Lin X, Koelsch G, Wu S, Downs D, Dashti A, Tang J (únor 2000). „Lidská aspartátproteáza memapsin 2 štěpí místo beta-sekretázy proteinu prekurzoru beta-amyloidu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (4): 1456–60. Bibcode:2000PNAS ... 97.1456L. doi:10.1073 / pnas.97.4.1456. PMC 26455. PMID 10677483.
Acquati F, Accarino M, Nucci C, Fumagalli P, Jovine L, Ottolenghi S, Taramelli R (únor 2000). „Gen kódující DRAP (BACE2), glykosylovaný transmembránový protein rodiny asparagových proteáz, se mapuje do kritické oblasti dolů“. FEBS Dopisy. 468 (1): 59–64. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01192-3. PMID 10683441. S2CID 30941017.
Bennett BD, Babu-Khan S, Loeloff R, Louis JC, Curran E, Citron M, Vassar R (červenec 2000). „Expresní analýza BACE2 v mozku a periferních tkáních“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (27): 20647–51. doi:10,1074 / jbc.M002688200. PMID 10749877.
Xin H, Stephans JC, Duan X, Harrowe G, Kim E, Grieshammer U, Kingsley C, Giese K (červen 2000). „Identifikace nové aspartátové proteázy odlišně exprimované v buněčných liniích lidského karcinomu prsu“. Biochimica et Biophysica Acta. 1501 (2–3): 125–37. doi:10.1016 / s0925-4439 (00) 00014-4. PMID 10838186.
Farzan M, Schnitzler CE, Vasilieva N, Leung D, Choe H (srpen 2000). „BACE2, homolog beta-sekretázy, se štěpí v místě beta a v oblasti amyloidu-beta v prekurzorovém proteinu amyloidu-beta“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (17): 9712–7. Bibcode:2000PNAS ... 97.9712F. doi:10.1073 / pnas.160115697. PMC 16930. PMID 10931940.
Iijima K, Ando K, Takeda S, Satoh Y, Seki T, Itohara S, Greengard P, Kirino Y, Nairn AC, Suzuki T (září 2000). „Neuronově specifická fosforylace Alzheimerova beta-amyloidového prekurzorového proteinu cyklin-dependentní kinázou 5“. Journal of Neurochemistry. 75 (3): 1085–91. doi:10.1046 / j.1471-4159.2000.0751085.x. PMID 10936190. S2CID 41050912.
Hussain I, Powell DJ, Howlett DR, Chapman GA, Gilmour L, Murdock PR, Tew DG, Meek TD, Chapman C, Schneider K, Ratcliffe SJ, Tattersall D, Testa TT, Southan C, Ryan DM, Simmons DL, Walsh FS , Dingwall C, Christie G (listopad 2000). „ASP1 (BACE2) štěpí amyloidový prekurzorový protein v místě beta-sekretázy“. Molekulární a buněčné neurovědy. 16 (5): 609–19. doi:10,1006 / mcne.2000.0884. PMID 11083922. S2CID 54379424.
Hussain I, Christie G, Schneider K, Moore S, Dingwall C (červen 2001). „Prodomainové zpracování Asp1 (BACE2) je autokatalytické“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (26): 23322–8. doi:10,1074 / jbc.M101069200. PMID 11316808.
Yan R, Munzner JB, Shuck ME, Bienkowski MJ (září 2001). „BACE2 funguje jako alternativní alfa-sekretáza v buňkách“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (36): 34019–27. doi:10,1074 / jbc.M105583200. PMID 11423558.
Grüninger-Leitch F, Schlatter D, Küng E, Nelböck P, Döbeli H (únor 2002). "Profil substrátu a inhibitoru BACE (beta-sekretázy) a srovnání s jinými asparagovými proteázami savců". The Journal of Biological Chemistry. 277 (7): 4687–93. doi:10,1074 / jbc.M109266200. PMID 11741910.
Turner RT, Loy JA, Nguyen C, Devasamudram T, Ghosh AK, Koelsch G, Tang J (červenec 2002). „Specifičnost memapsinu 1 a její důsledky pro návrh selektivity inhibitorů memapsinu 2 (beta-sekretázy)“. Biochemie. 41 (27): 8742–6. doi:10.1021 / bi025926t. PMID 12093293.
Kim YT, Downs D, Wu S, Dashti A, Pan Y, Zhai P, Wang X, Zhang XC, Lin X (listopad 2002). "Enzymové vlastnosti rekombinantního BACE2". European Journal of Biochemistry / FEBS. 269 (22): 5668–77. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.03277.x. PMID 12423367.
Kondoh K, Tsuji N, Kamagata C, Sasaki M, Kobayashi D, Yagihashi A, Watanabe N (březen 2003). „Nový gen aspartátové proteázy, ALP56, je v lidské rakovině prsu up-regulován nezávisle na genu pro katepsin D“. Výzkum a léčba rakoviny prsu. 78 (1): 37–44. doi:10.1023 / A: 1022149226430. PMID 12611455. S2CID 2195115.

externí odkazy

https://web.archive.org/web/20070318110931/http://www.ihop-net.org/UniPub/iHOP/gs/129262.html
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM): 605668
Člověk BACE2 umístění genomu a BACE2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000182240 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040605 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] Turner, R.T .; Loy, J. A.; Nguyen, C .; Devasamudram, T .; Ghosh, A.K .; Koelsch, G .; Tang, J. (2002). „Specifičnost memapsinu 1 a její důsledky pro návrh selektivity inhibitorů memapsinu 2 (β-sekretázy)“. Biochemie. 41 (27): 8742–8746. doi:10.1021 / bi025926t. PMID 12093293.

[pmid10965118-6] Solans A, Estivill X, de La Luna S (září 2000). „Nová aspartylproteáza na 21q22.3, BACE2, je velmi podobná Alzheimerově amyloidovému prekurzorovému proteinu beta-sekretase“. Cytogenetika a genetika buněk. 89 (3–4): 177–84. doi:10.1159/000015608. PMID 10965118. S2CID 39880508.

[pmid10830953-7] Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, Watanabe H, Yada T, Park HS, Toyoda A, Ishii K, Totoki Y, Choi DK, Groner Y, Soeda E, Ohki M, Takagi T, Sakaki Y, Taudien S, Blechschmidt K , Polley A, Menzel U, Delabar J, Kumpf K, Lehmann R, Patterson D, Reichwald K, Rump A, Schillhabel M, Schudy A, Zimmermann W, Rosenthal A, Kudoh J, Schibuya K, Kawasaki K, Asakawa S, Shintani A, Sasaki T, Nagamine K, Mitsuyama S, Antonarakis SE, Minoshima S, Shimizu N, Nordsiek G, Hornischer K, Brant P, Scharfe M, Schon O, Desario A, Reichelt J, Kauer G, Blocker H, Ramser J, Beck A, Klages S, Hennig S, Riesselmann L, Dagand E, Haaf T, Wehrmeyer S, Borzym K, Gardiner K, Nizetic D, Francis F, Lehrach H, Reinhardt R, Yaspo ML (květen 2000). „Sekvence DNA lidského chromozomu 21“. Příroda. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Natur.405..311H. doi:10.1038/35012518. PMID 10830953.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: BACE2 beta-site APP-štěpící enzym 2“.

[9] BACE2 zpracovává PMEL za vzniku melanosomové amyloidové matrice v pigmentových buňkách Pubmed

[pmid12135764-10] A ^b He X, Chang WP, Koelsch G, Tang J (červenec 2002). „Cytosolická doména memapsinu 2 (beta-sekretáza) se váže na domény VHS GGA1 a GGA2: důsledky pro mechanismus endocytózy memapsinu 2“. FEBS Dopisy. 524 (1–3): 183–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03052-1. PMID 12135764. S2CID 42042430.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Proteázy: aspartátové proteázy (ES 3.4.23 )
Obratlovců	Pepsin Chymosin Renin Signální peptidová peptidáza Beta sekretáza 1 2
Patogenní	Plasmepsin HIV-1 proteáza
Rostlina	Nepenthesin
Katepsin	D E

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )