SPPL2A - SPPL2A

SPPL2A
Identifikátory
Aliasy	SPPL2A, IMP3, PSL2, signální peptidová peptidáza jako 2A
Externí ID	OMIM: 608238 MGI: 1913802 HomoloGene: 36411 Genové karty: SPPL2A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	50,765,709 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	126,933,235 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita homodimerizace proteinu; • aktivita endopeptidázy aspartátového typu; • aktivita peptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • aktivita aspartové endopeptidázy, intramembránové štěpení;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • endozom; • pozdní endosom; • membrána; • membrána pozdního endozomu; • intracelulární membránou vázaná organela; • integrální součást cytoplazmatické strany membrány endoplazmatického retikula; • lysozomální membrána; • Golgiho membrána vezikul; • lysozom; • integrální součást lumenální strany membrány endoplazmatického retikula; • extracelulární exosom; • buněčná membrána;
Biologický proces	• proteolýza membránových proteinů; • proteolýza; • proteolýza ektodomény membránového proteinu; • membránový protein intracelulární doména proteolýza; • regulace imunitní odpovědi; • regulace signální dráhy zprostředkované faktorem nekrózy nádorů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84888
	66552
	ENSG00000138600
	ENSMUSG00000027366
	Q8TCT8
	Q9JJF9
	NM_032802
	NM_023220
	NP_116191
	NP_075709
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Signální peptid jako peptidáza 2A, také známý jako SPPL2A, je člověk gen.^[5]

Funkce

Tento gen je členem signální peptid peptidáza rodina podobná proteáze (SPPL) a kóduje lysozomální / pozdní endosomální membránový protein^[6] se zachovanými motivy aktivního místa 'YD' a 'GxGD' v sousedních transmembránových doménách (TMD). Tento protein hraje roli ve vrozené a adaptivní imunitě štěpením TNFa v aktivován dendritické buňky.^[7]^[8] Pseudogen tohoto genu také leží na chromozomu 15.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138600 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027366 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SPPL2A signální peptid jako peptidáza 2A“.
^ Behnke J, Schneppenheim J, Koch-Nolte F, Haag F, Saftig P, Schröder B (2011). „Signální peptid-peptidáza jako 2a (SPPL2a) je zaměřena na lysosomy / pozdní endosomy pomocí tyrosinového motivu v jeho C-koncovém ocasu“. FEBS Dopisy. 585 (19): 2951–7. doi:10.1016 / j.febslet.2011.08.043. PMID 21896273.
^ Friedmann E, Hauben E, Maylandt K a kol. (2006). „SPPL2a a SPPL2b podporují intramembránovou proteolýzu TNFalfa v aktivovaných dendritických buňkách za účelem spuštění produkce IL-12“. Nat. Cell Biol. 8 (8): 843–8. doi:10.1038 / ncb1440. PMID 16829952.
^ Fluhrer R, Grammer G, Israel L a kol. (2006). „Intramembránové štěpení TNFalfa gama-sekretázou podobné aspartylproteáze GxGD SPPL2b“ (PDF). Nat. Cell Biol. 8 (8): 894–6. doi:10.1038 / ncb1450. PMID 16829951.

Další čtení

Weihofen A, Binns K, Lemberg MK a kol. (2002). "Identifikace signálního peptidu peptidázy, aspartátové proteázy presenilinového typu". Věda. 296 (5576): 2215–8. doi:10.1126 / science.1070925. PMID 12077416.
Grigorenko AP, Moliaka YK, Korovaitseva GI, Rogaev EI (2002). "Nová třída polytopických proteinů s doménami spojenými s domnělou aktivitou proteázy". Biochemistry Mosc. 67 (7): 826–35. doi:10.1023 / A: 1016365227942. PMID 12139484.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Granneman S, Gallagher JE, Vogelzangs J a kol. (2003). „Lidské proteiny Imp3 a Imp4 tvoří ternární komplex s hMpp10, který interaguje pouze s U3 snoRNA v komplexech ribonukleoproteinů 60–80S“. Nucleic Acids Res. 31 (7): 1877–87. doi:10,1093 / nar / gkg300. PMC 152815. PMID 12655004.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Friedmann E, Lemberg MK, Weihofen A, et al. (2005). „Konsenzuální analýza signální peptidové peptidázy a homologních lidských aspartátových proteáz odhaluje opačnou topologii katalytických domén ve srovnání s preseniliny“. J. Biol. Chem. 279 (49): 50790–8. doi:10,1074 / jbc.M407898200. PMID 15385547.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2007). "Signální sekvence a klíčové slovo trap in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA opatřených oligo". DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Kirkin V, Cahuzac N, Guardiola-Serrano F a kol. (2007). „Intracelulární doména ligandu Fas je uvolňována štěpením ADAM10 a SPPL2a v T-buňkách“. Buněčná smrt se liší. 14 (9): 1678–87. doi:10.1038 / sj.cdd.4402175. PMID 17557115.

Tento článek o gen na lidský chromozom 15 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138600 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027366 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: SPPL2A signální peptid jako peptidáza 2A“.

[pmid21896273-6] Behnke J, Schneppenheim J, Koch-Nolte F, Haag F, Saftig P, Schröder B (2011). „Signální peptid-peptidáza jako 2a (SPPL2a) je zaměřena na lysosomy / pozdní endosomy pomocí tyrosinového motivu v jeho C-koncovém ocasu“. FEBS Dopisy. 585 (19): 2951–7. doi:10.1016 / j.febslet.2011.08.043. PMID 21896273.

[7] Friedmann E, Hauben E, Maylandt K a kol. (2006). „SPPL2a a SPPL2b podporují intramembránovou proteolýzu TNFalfa v aktivovaných dendritických buňkách za účelem spuštění produkce IL-12“. Nat. Cell Biol. 8 (8): 843–8. doi:10.1038 / ncb1440. PMID 16829952.

[8] Fluhrer R, Grammer G, Israel L a kol. (2006). „Intramembránové štěpení TNFalfa gama-sekretázou podobné aspartylproteáze GxGD SPPL2b“ (PDF). Nat. Cell Biol. 8 (8): 894–6. doi:10.1038 / ncb1450. PMID 16829951.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]