Indol-3-glycerol-fosfát syntáza - Indole-3-glycerol-phosphate synthase
| indol-3-glycerol-fosfát syntáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 4.1.1.48 | ||||||||
| Číslo CAS | 9031-60-1 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Indol-3-glycerolfosfát syntáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 trojrozměrná struktura bifunkčního enzymu fosforibosylanthranilát isomerázy: indoleglycerolfosfát syntáza z escherichia coli rafinovaná při rozlišení 2,0 angstromů | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | IGPS | ||||||||
| Pfam | PF00218 | ||||||||
| Pfam klan | CL0036 | ||||||||
| InterPro | IPR013798 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00536 | ||||||||
| SCOP2 | 1pii / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
v enzymologie, an indol-3-glycerol-fosfát syntáza (IGPS) (ES 4.1.1.48 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce
- 1- (2-karboxyfenylamino) -1-deoxy-D-ribulóza 5-fosfát L-C- (indol-3-yl) glycerol 3-fosfát + CO2 + H2Ó
Tento enzym tedy jeden má Podklad, 1- (2-karboxyfenylamino) -1-deoxy-D-ribulóza 5-fosfát, ale 3 produkty: L-C- (indol-3-yl) glycerol 3-fosfát, CO2, a H2Ó.
Tento enzym patří do rodiny lyázy konkrétně karboxy-lyázy, které štěpí vazby uhlík-uhlík. The systematické jméno této třídy enzymů je 1- (2-karboxyfenylamino) -1-deoxy-D-ribulóza-5-fosfátkarboxylyáza [cyklizující 1-C- (indol-3-yl) glycerol-3-fosfát tvořící]. Mezi další běžně používaná jména patří indoleglycerolfosfát syntetáza, indoleglycerolfosfát syntáza, indol-3-glycerofosfát syntáza, 1- (2-karboxyfenylamino) -1-deoxy-D-ribulóza-5-fosfát, a karboxylyáza (cyklizující). Tento enzym se účastní fenylalanin, tyrosin a tryptofan biosyntéza a dvousložkový systém - obecný. Zaměstnává jednoho kofaktor, pyruvát.
Strukturální studie
V některých bakterie „IGPS je jediný řetězec enzym. V jiných, jako např Escherichia coli, to je N-terminál doména bifunkčního enzymu, který také katalýzy N- (5'-fosforibosyl) antranilát izomeráza (ES 5.3.1.24 ) (PRAI) aktivita, třetí krok tryptofan biosyntéza. v houby IGPS je centrální doména trifunkčního enzymu, který obsahuje PRAI C-terminál doména a glutamin amidotransferáza (ES 2.4.2.- ) (GATase) N-terminální doména.
A struktura IGPS domény bifunkčního enzymu z mezofilní bakterie E-coli (eIGPS) byl srovnáván s monomerní indol-3-glycerolfosfát syntáza z hypertermofilní archaeon Sulfolobus solfataricus (SIGPS). Oba jsou jednobodové (beta / alfa) 8 barel proteiny, s jedním (eIGPS) nebo dvěma (sIGPS) dalšími šroubovice vloženo před první beta řetězec.[1]
Ke konci roku 2007, 11 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1A53, 1I4N, 1J5T, 1JCM, 1JUK, 1ČERVENEC, 1LBF, 1LBL, 1PII, 1VC4, a 2C3Z.
Reference
- ^ Goldman A (prosinec 1995). "Jak přimět mou krev vařit". Struktura. 3 (12): 1277–9. doi:10.1016 / s0969-2126 (01) 00263-5. PMID 8747452.
Další čtení
- Creighton TE, Yanofsky C (1966). „Indol-3-glycerolfosfát syntetáza Escherichia coli, enzym tryptofanového operonu“. J. Biol. Chem. 241 (20): 4616–24. PMID 5332729.
- Creighton TE; Yanofsky C (1970). „Chorismate to tryptophan (Escherichia coli) - Anthranilate syntetáza, PR transferáza, PRA izomeráza, InGP syntetáza, tryptofan syntetáza“. Metody Enzymol. 17A: 365–380. doi:10.1016/0076-6879(71)17215-1.
- Kung CC, Huang WN, Huang YC, Yeh KC (2006). „Proteomický průzkum proteinů vázajících měď v kořenech Arabidopsis imobilizovanou kovovou afinitní chromatografií a hmotnostní spektrometrií“. Proteomika. 6 (9): 2746–58. doi:10.1002 / pmic.200500108. PMID 16526091. S2CID 25896917.
| Tento EC 4.1 enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |