ELMO1 - ELMO1
Pohltení a protein buněčné motility 1 je protein že u lidí je kódován ELMO1 gen.[5][6] ELMO1 se nachází na chromozomu číslo sedm u lidí a nachází se na chromozomu číslo třináct u myší.
Struktura
Lidský pohlcení a protein buněčné motility 1, ELMO1, je dlouhý 720 zbytků. Protein obsahuje následující tři domény:
- N-terminál Pásovec doména (zbytky 82-262)
- centrální ELMO (Engulfment a Cell Modoména) (301-492)
- C-terminál pleckstrinová homologická doména (zbytky 527-674)
ELMO1 má také bohatý motiv na extrémním konci C. Analýza sekundární struktury předpověděla, že existují alfa-helikální oblasti jak na N, tak na C-konci.[7]
Struktura pleckstrinové homologické domény ELMO1 byla stanovena rentgenovou krystalografií.[7]
Funkce
Protein kódovaný tímto genem interaguje s dedikátorem proteinu cyto-kineze 1 za účelem podpory fagocytózy a ovlivnění změn tvaru buněk. Podobnost s proteinem C. elegans naznačuje, že tento protein může fungovat při apoptóze a při migraci buněk. Alternativní sestřih tohoto genu vede k mnoha variantám transkriptu kódujících různé izoformy.[6]
Interakce
ELMO1 bylo prokázáno komunikovat s Dock180[5][8] a HCK. ELMO1 přímo interaguje s doménou SH3 HCK. Asociace mezi ELMO1 a HCK závisí na interakcích polyprolinu.[9]
Když je ELMO1 v komplexu s DOCK180, Rac GTPase -závislé biologické procesy jsou aktivovány. Doména pH ELMO1 funguje v transu, aby stabilizovala DOCK180 a byla odolná vůči degradaci. Když se ELMO1 váže na DOCK180, uvolňuje sterickou inhibici DOCK180, která poté aktivuje Rac GTPázu. Probohatý motiv C konce na ELMO1 je nezbytný pro vazbu ELMO1 na doménu SH3 na N konci DOCK180.[7] Komplex ELMO1 a DOCK180 působí jako regulátor Rac během vývoje buňky a buněčné migrace. Mutace obou interakčních míst pro DOCK180 na ELMO1 povede k narušení komplexu ELMO1-DOCK180. ELMO1 v komplexu s DOCK180 i CrkII vede k maximální účinnosti fagocytóza v cele. Tento komplex molekul se odehrává proti proudu Rac během fagocytózy.[5]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000155849 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041112 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C Gumienny TL, Brugnera E, Tosello-Trampont AC, Kinchen JM, Haney LB, Nishiwaki K, Walk SF, Nemergut ME, Macara IG, Francis R, Schedl T, Qin Y, Van Aelst L, Hengartner MO, Ravichandran KS (říjen 2001 ). „CED-12 / ELMO, nový člen dráhy CrkII / Dock180 / Rac, je vyžadován pro fagocytózu a migraci buněk“ (PDF). Buňka. 107 (1): 27–41. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00520-7. PMID 11595183. S2CID 15232864.
- ^ A b „Entrez Gene: ELMO1 engulfment and cell motility 1“.
- ^ A b C PDB: 2VSZ; Komander D, Patel M, Laurin M, Fradet N, Pelletier A, Barford D, Côté JF (listopad 2008). „Alfa-helikální rozšíření homologní domény ELMO1 pleckstrin zprostředkovává přímou interakci s DOCK180 a je kritické v Rac signalizaci“. Mol. Biol. Buňka. 19 (11): 4837–51. doi:10,1091 / mbc.E08-04-0345. PMC 2575150. PMID 18768751.
- ^ Brugnera E, Haney L, Grimsley C, Lu M, Walk SF, Tosello-Trampont AC, Macara IG, Madhani H, Fink GR, Ravichandran KS (srpen 2002). „Nekonvenční aktivita Rac-GEF je zprostředkována komplexem Dock180-ELMO.“ Nat. Cell Biol. 4 (8): 574–82. doi:10.1038 / ncb824. PMID 12134158. S2CID 36363774.
- ^ Scott MP, Zappacosta F, Kim EY, Annan RS, Miller WT (srpen 2002). "Identifikace nových ligandů domény SH3 pro kinázu rodiny Src Hck. Protein syndromu Wiskott-Aldrich (WASP), protein interagující s WASP (WIP) a ELMO1". J. Biol. Chem. 277 (31): 28238–46. doi:10,1074 / jbc.M202783200. PMID 12029088.
Další čtení
- Ohara O, Nagase T, Ishikawa K a kol. (1997). „Konstrukce a charakterizace knihoven cDNA lidského mozku vhodných pro analýzu klonů cDNA kódujících relativně velké proteiny“. DNA Res. 4 (1): 53–9. doi:10.1093 / dnares / 4.1.53. PMID 9179496.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Scott MP, Zappacosta F, Kim EY a kol. (2002). "Identifikace nových ligandů domény SH3 pro kinázu rodiny Src Hck. Protein syndromu Wiskott-Aldrich (WASP), protein interagující s WASP (WIP) a ELMO1". J. Biol. Chem. 277 (31): 28238–46. doi:10,1074 / jbc.M202783200. PMID 12029088.
- Brugnera E, Haney L, Grimsley C a kol. (2002). „Nekonvenční aktivita Rac-GEF je zprostředkována komplexem Dock180-ELMO.“ Nat. Cell Biol. 4 (8): 574–82. doi:10.1038 / ncb824. PMID 12134158. S2CID 36363774.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Lidský chromozom 7: sekvence DNA a biologie“. Věda. 300 (5620): 767–72. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
- Sanui T, Inayoshi A, Noda M a kol. (2003). "DOCK2 reguluje aktivaci Rac a cytoskeletální reorganizaci prostřednictvím interakce s ELMO1". Krev. 102 (8): 2948–50. doi:10.1182 / krev-2003-01-0173. PMID 12829596.
- Katoh H, Negishi M (2003). „RhoG aktivuje Rac1 přímou interakcí s proteinem vázajícím na Dock180 Elmo.“ Příroda. 424 (6947): 461–4. doi:10.1038 / nature01817. PMID 12879077. S2CID 4411133.
- Grimsley CM, Kinchen JM, Tosello-Trampont AC a kol. (2004). „Proteiny Dock180 a ELMO1 spolupracují na podpoře evolučně konzervované migrace buněk závislé na Rac“. J. Biol. Chem. 279 (7): 6087–97. doi:10,1074 / jbc.M307087200. PMID 14638695.
- Wang X, Wu YC, Fadok VA a kol. (2003). „Zachycení buněčné mrtvoly zprostředkované receptorem fosfatidylserinu C. elegans prostřednictvím CED-5 a CED-12“. Věda. 302 (5650): 1563–6. doi:10.1126 / science.1087641. PMID 14645848. S2CID 25672278.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Janardhan A, Swigut T, Hill B a kol. (2006). „HIV-1 Nef váže komplex DOCK2-ELMO1 k aktivaci rac a inhibici chemotaxe lymfocytů“. PLOS Biol. 2 (1): E6. doi:10.1371 / journal.pbio.0020006. PMC 314466. PMID 14737186.
- Lu M, Kinchen JM, Rossman KL a kol. (2004). "PH doména ELMO funguje v trans k regulaci aktivace Rac přes Dock180". Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (8): 756–62. doi:10.1038 / nsmb800. PMID 15247908. S2CID 125990.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- deBakker CD, Haney LB, Kinchen JM a kol. (2005). „Fagocytóza apoptotických buněk je regulována signalizačním modulem UNC-73 / TRIO-MIG-2 / RhoG a pásovcovými repeticemi CED-12 / ELMO.“ Curr. Biol. 14 (24): 2208–16. doi:10.1016 / j.cub.2004.12.029. PMID 15620647. S2CID 1269946.
- Akakura S, Kar B, Singh S a kol. (2005). "C-koncová SH3 doména CrkII reguluje sestavení a funkci DOCK180 / ELMO Rac-GEF". J. Cell. Physiol. 204 (1): 344–51. doi:10.1002 / jcp.20288. PMID 15700267. S2CID 29767556.
- Lu M, Kinchen JM, Rossman KL a kol. (2005). „Sterický inhibiční model pro regulaci nukleotidové výměny prostřednictvím rodiny GEF Dock180“. Curr. Biol. 15 (4): 371–7. doi:10.1016 / j.cub.2005.01.050. PMID 15723800. S2CID 14267018.
- Shimazaki A, Kawamura Y, Kanazawa A a kol. (2005). „Genetické variace v genu kódujícím ELMO1 jsou spojeny s náchylností k diabetické nefropatii“. Cukrovka. 54 (4): 1171–8. doi:10 2337 / cukrovka. 54.4.1171. PMID 15793258.
- Yokoyama N, deBakker CD, Zappacosta F a kol. (2005). "Identifikace tyrosinových zbytků na ELMO1, které jsou fosforylovány kinázou rodiny Src Hck". Biochemie. 44 (24): 8841–9. doi:10.1021 / bi0500832. PMC 2441568. PMID 15952790.
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |