RBMS1 - RBMS1

RBMS1
Protein RBMS1 PDB 1x4e.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyRBMS1, C2orf12, HCC-4, MSSP, MSSP-1, MSSP-2, MSSP-3, SCR2, YC1, RNA vazebný motiv jednovláknový interagující protein 1
Externí IDOMIM: 602310 MGI: 1861774 HomoloGene: 9640 Genové karty: RBMS1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 2 (lidský)
Chr.Chromozom 2 (lidský)[1]
Chromozom 2 (lidský)
Genomické umístění pro RBMS1
Genomické umístění pro RBMS1
Kapela2q24.2Start160,272,151 bp[1]
Konec160,493,807 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE RBMS1 203748 x na fs.png

PBB GE RBMS1 207266 x at fs.png

PBB GE RBMS1 215127 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

5937

56878

Ensembl

ENSG00000153250

ENSMUSG00000026970

UniProt

P29558

Q91W59

RefSeq (mRNA)

NM_002897
NM_016836
NM_016839

NM_001141931
NM_001141932
NM_020296

RefSeq (protein)

NP_002888
NP_058520

NP_001135403
NP_001135404
NP_064692

Místo (UCSC)Chr 2: 160,27 - 160,49 MbChr 2: 60,75 - 60,96 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Motiv vázající RNA, jednovláknový interagující protein 1 je protein že u lidí je kódován RBMS1 gen.[5][6][7][8]

Funkce

Tento gen kóduje člena malé rodiny proteinů, které se vážou na jednořetězcovou DNA / RNA. Tyto proteiny jsou charakterizovány přítomností dvou sad konsensuální sekvence ribonukleoproteinů (RNP-CS), které obsahují konzervované motivy, RNP1 a RNP2, původně popsané v proteinech vázajících RNA a potřebné pro vazbu DNA. Tyto proteiny se podílejí na tak rozmanitých funkcích, jako je replikace DNA, transkripce genů, progrese buněčného cyklu a apoptóza. Bylo popsáno několik variant transkriptu, které jsou výsledkem alternativního sestřihu a kódování různých izoforem. Některé z nich byly izolovány na základě jejich vazby buď na řetězec upstream prvku c-myc (MSSP), nebo fenotypovou komplementací mutantů cdc2 a cdc13 kvasinek (scr2) nebo jako potenciální lidský represor HIV-1. a transkripce promotoru ILR-2 alfa (YC1). Pseudogen pro toto místo se nachází na chromozomu 12.[8]

Interakce

RBMS1 bylo prokázáno komunikovat s Polymeráza (řízená DNA), alfa 1.[9]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000153250 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026970 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Kanaoka Y, Nojima H (srpen 1994). „SCR: nové lidské supresory mutantů cdc2 / cdc13 Schizosaccharomyces pombe obsahují motivy pro proteiny vázající RNA“. Nucleic Acids Res. 22 (13): 2687–93. doi:10.1093 / nar / 22.13.2687. PMC  308228. PMID  8041632.
  6. ^ Negishi Y, Nishita Y, Saëgusa Y, Kakizaki I, Galli I, Kihara F, Tamai K, Miyajima N, Iguchi-Ariga SM, Ariga H (duben 1994). „Identifikace a klonování cDNA jednovláknových proteinů vázajících DNA, které interagují s oblastí před lidským genem c-myc“. Onkogen. 9 (4): 1133–43. PMID  8134115.
  7. ^ Takai T, Nishita Y, Iguchi-Ariga SM, Ariga H (1994). „Molekulární klonování MSSP-2, jednořetězcového vazebného proteinu genu c-myc: charakterizace vazebné specificity a aktivity replikace DNA“. Nucleic Acids Res. 22 (25): 5576–81. doi:10.1093 / nar / 22.25.5576. PMC  310119. PMID  7838710.
  8. ^ A b "Entrez Gene: RBMS1 RNA vazebný motiv, jednovláknový interagující protein 1".
  9. ^ Niki T, Galli I, Ariga H, Iguchi-Ariga SM (červen 2000). „MSSP, protein vázající se na počátek replikace v genu c-myc, interaguje s katalytickou podjednotkou DNA polymerázy alfa a stimuluje její polymerázovou aktivitu“. FEBS Lett. 475 (3): 209–12. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01679-3. PMID  10869558. S2CID  31594271.

Další čtení