Armatimonas rosea - Armatimonas rosea
 | Tento článek obsahuje seznam obecných Reference, ale zůstává z velké části neověřený, protože postrádá dostatečné odpovídající vložené citace. (Leden 2013) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) |
| Armatimonas rosea | |
|---|---|
| Vědecká klasifikace | |
| Doména: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | |
| Druh: | A. rosea |
| Binomické jméno | |
| Armatimonas rosea Tamaki a kol. 2011 | |
Armatimonas rosea je gramnegativní bakterie a také první druh charakterizovaný v kmeni Armatimonadetes. Armatimonadetes byly dříve známé jako kandidátský kmen OP10. OP10 byl složen pouze z environmentálních 16S rRNA genových klonových sekvencí před A. rosea objev.
Objev
A. rosea byl původně izolován z rhizoplane vodní rostliny Phragmites australis obývající sladkovodní jezero v Prefektura Jamanaši v Japonsku. Kultivace a izolace byly dokončeny v médiu s nízkým obsahem živin, DTS.
Příbuzní
Environmentální 16S rRNA genové sekvence patřící do kmene Armatimonadetes jsou aktuálně řazeny do šesti skupin. Skupiny 2, 5 a 6 se skládají pouze ze sekvencí. Skupina 1 obsahuje Armatimonadetes rosea, Skupina 3 obsahuje Chthonomonadetes calidiroseaa skupina 4 obsahuje Fimbriimonas ginsengisoli.
| ||||||||||
Chthonomonas calidirosea kmen T49T, an aerobní, sacharolytická, obligátně termofilní, pohyblivá, nespórotvorná bakterie, byla izolována z geotermálně zahřáté půdy v Hell's Gate, Tikitere na Novém Zélandu. Je to první zástupce nové třídy v kmeni Armatimonadetes. Představuje prvního kultivovaného zástupce společnosti Chthonomonadetes, což odpovídá skupině 3 kmene Armatimonadetes.[Citace je zapotřebí ]
Fimbriimonas ginsengisolibyla ze vzorku půdy ženšenu izolována aerobní, nepohyblivá, mezofilní bakterie ve tvaru tyčinky. Představuje prvního kultivovaného zástupce společnosti Fimbriimonadia třída, což odpovídá skupině 4 kmeneArmatimonadetes.
Vlastnosti
Při pěstování na médiu s relativně nízkým obsahem živin, R2A, byly kolonie po jednom týdnu inkubace při 30 ° C růžově pigmentované, kruhové, hladké, výrazně tvrdé, relativně malé (1–2 mm). A.rosea má optimální teplotu 30–35 ° C s rozsahem 20–40 ° C. Optimální pH pro růst bylo 6,5 s rozsahem 5,5–8,5. Je schopen tolerovat koncentrace NaCl až do 0,5%.
Při vyšetřování fázový kontrast Bylo pozorováno, že buňky transmisní elektronové mikroskopie jsou nepohyblivé, vejčité až tyčinkovité, s velikostí od 1,4 do 1,8 um na šířku a 2,4–3,2 um na délku. Spory ani bičíky nebyly pozorovány.
Při zkoumání v médiích R2A, kulturách A. rosea bylo pozorováno, že jsou aerobní a chemoheterotrofní bez důkazu růstu za anaerobních podmínek. To je negativní pro následující testy: nitrátové dýchání, fermentační růst, kataláza a cytochromoxidáza.
Reference
- Tamaki, Hideyuki; et al. (2011). "Armatimonas rosea gen. nov., sp. listopadu nového bakteriálního kmene Armatimonadetes phyl. nov., formálně nazývaný kandidátský kmen OP10 ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (6): 1442–1447. doi:10.1099 / ijs.0.025643-0. PMID 20622056.
- Lee, Kevin C-Y .; et al. (2011). "Chthonomonas calidirosea gen. nov., sp. nov., aerobní, pigmentovaný, termofilní mikroorganismus nové bakteriální třídy, Chthonomonadetes classis nov., z nově popsaného kmene Armatimonadetes původně označeného jako kandidátská divize OP10 ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (10): 2482–2490. doi:10.1099 / ijs.0.027235-0. PMID 21097641.[trvalý mrtvý odkaz ]
- Im, Wan-Taek; et al. (2012). "Popis Fimbriimonas ginsengisoli gen. nov., sp. listopad. v rámci Fimbriimonadia třída nov., z kmene Armatimonadetes ". Antonie van Leeuwenhoek. 102 (2): 1–11. doi:10.1007 / s10482-012-9739-6. PMID 22527625.
