Chthonomonas calidirosea - Chthonomonas calidirosea
| Chthonomonas calidirosea | |
|---|---|
| Vědecká klasifikace | |
| Doména: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | |
| Druh: | C. calidirosea |
| Binomické jméno | |
| Chthonomonas calidirosea Lee a kol. 2011[1] | |
Chthonomonas calidirosea je Gramnegativní bakterie a také první zástupce nové třídy Chthonomonadetes v kmeni Armatimonadetes. Armatimonadetes byly dříve známé jako kandidátský kmen OP10. OP10 byl složen pouze z environmentálních 16S rRNA genových klonových sekvencí před C. calidirosea relativní, Armatimonas rosea's objev. Nyní je známo, že bakteriální společenství z geotermálního prostředí obvykle tvoří alespoň 5–10% bakterií patřících do Armatimonadetes.
Objev
Chthonomonas calidirosea byl původně izolován z geotermálně zahřáté půdy v Hell's Gate, Tikitere na Novém Zélandu. Půda byla asepticky odebrány vzorky v přibližné hloubce 15 cm pod povrchem. Vzorek půdy měl pH 4,3 a an in situ teplota 55 ° C.
Příbuzní
Environmentální genové sekvence 16S rRNA patřící do kmene Armatimonadetes jsou aktuálně řazeny do šesti skupin. Skupiny 2, 5 a 6 se skládají pouze ze sekvencí. Skupina 1 obsahuje Armatimonadetes rosea, Skupina 3 obsahuje Chthonomonadetes calidiroseaa skupina 4 obsahuje Fimbriimonas ginsengisoli.
| |||||||||||||
Armatimonas rosea, an aerobní „Gramnegativní, růžově pigmentovaná, nemotilní, vejčitá / tyčinkovitá bakterie, byla izolována z oddenku vodní rostliny Phragmites australis v Japonsku. Je prvním zástupcem kmene Armatimonadetes.
Fimbriimonas ginsengisolibyla ze vzorku půdy ženšenu izolována aerobní, nepohyblivá, mezofilní bakterie ve tvaru tyčinky. Představuje prvního kultivovaného zástupce třídy Fimbriimonadia, což odpovídá skupině 4 kmene Armatimonadetes.
Vlastnosti
Při pěstování na pevném médiu AOM1 byly kolonie po jednom týdnu inkubace při 60 ° C světle růžově pigmentované, kruhové, konvexní, relativně malé (2–4 mm). Chthonomonas calidirosea má optimální teplotu 68 ° C s rozsahem 50–73 ° C. Optimální pH pro růst bylo 5,3 s rozsahem 4,5–5,8. Optimální růst byl pozorován v médiu bez NaCI, ačkoli byl pozorován růst v NaCI upraveném médiu FSV1 až do 2% NaCI.
Při vyšetřování fázový kontrast a transmisní elektronovou mikroskopií bylo pozorováno, že omezený počet buněk vykazuje omílací pohyblivost, která vysoce závisí na růstové fázi, středním pH a substrátu. Důsledně byla pozorována nepravidelná zvlněná vnější membrána. Buňky měly tyčový tvar o velikostech v rozmezí od 0,5–0,7 µm do průměru a 2,5–3,0 µm do délky. Spory ani bičíky nebyly pozorovány.
Kultury C. calidirosea byly pozorovány jako aerobní, sacharolytické, obligátně teplomilné, pohyblivá, nespórotvorná bakterie bez známek růstu za anaerobních podmínek.
Reference
- Tamaki, Hideyuki; et al. (Červen 2011). „Armatimonas rosea gen. Nov., Sp. Nov., Nového bakteriálního kmene, Armatimonadetes phyl. Nov., Formálně nazývaného kandidátský kmen OP10“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (Pt 6): 1442–1447. doi:10.1099 / ijs.0.025643-0. PMID 20622056.
- Lee, Kevin C-Y .; et al. (2011). „Chthonomonas calidirosea gen. Nov., Sp. Nov., Aerobní, pigmentovaný, termofilní mikroorganismus nové bakteriální třídy, Chthonomonadetes classis nov., Z nově popsaného kmene Armatimonadetes původně označeného jako kandidátská divize OP10“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (Pt 10): 2482–2490. doi:10.1099 / ijs.0.027235-0. PMID 21097641. Archivovány od originál dne 2013-01-13.
- Im, Wan-Taek; et al. (2012). „Popis Fimbriimonas ginsengisoli gen. Nov., Sp. Nov. V rámci třídy Fimbriimonadia z listopadu, kmene Armatimonadetes“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 102 (2): 307–317. doi:10.1007 / s10482-012-9739-6. PMID 22527625.
- Portillo, M. C .; Gonzalez, J. M. (2009). „Členové kandidátské divize OP10 jsou rozšířeni v různých prostředích“. World Journal of Microbiology and Biotechnology. 25 (2): 347–353. doi:10.1007 / s11274-008-9895-z.
