Thermoanaerobacterales - Thermoanaerobacterales

Thermoanaerobacterales
Vědecká klasifikace
Království:	Bakterie
Divize:	Firmicutes
Třída:	Clostridia Rainey 2010
Objednat:	Thermoanaerobacterales Wiegel 2010
Rodiny a rody
	Thermoanaerobacteraceae Wiegel 2010 Ammonifex Vychází Huber a Stetter 1996. Miroshnichenko a kol. 2008; Brockia Perevalova a kol. 2013; Caldanaerobacter Fardeau a kol. 2004; Caldanaerobius Lee a kol. 2008; Calderihabitans Yoneda a kol. 2013; Caloribacterium Slobodkina a kol. 2012; Carboxydothermus Svetlichny a kol. 1991 vydáno. Novikov a kol. 2011; Desulfothermobacter Frolov a kol. 2018; Desulfovirgula Kaksonen a kol. 2007; Fervidicola Ogg a Patel 2009; Gelria Plugge a kol. 2002; Moorella Collins a kol. 1994; Tepidanaerobacter Sekiguchi a kol. 2006; Thermacetogenium Hattori a kol. 2000; Thermanaeromonas Mori a kol. 2002; Thermoanaerobacter Vychází Wiegel a Ljungdahl 1982. Lee a kol. 2007; Thermodesulfitimonas Slobodkina a kol. 2017; ; Thermodesulfobiaceae Mori a kol. 2004 Thermodesulfobium Mori a kol. 2004; ; Thermoanaerobacterales Rodina III. Incertae Sedis Caldanaerovirga Wagner a kol. 2009; Caldicellulosiruptor Rainey a kol. 1995 vydáno. Onyenwoke a kol. 2006; Syntrophaceticus Westerholm et al. 2011; Thermoanaerobacterium Lee a kol. 1993 vydáno. Cann a kol. 2001; Thermosediminibacter Lee a kol. 2006; Thermovenabulum Zavarzina a kol. 2002; Termovorax Mäkinen a kol. 2012; ; Thermoanaerobacterales Rodina IV. Incertae Sedis Mahella Bonilla Salinas a kol. 2004; ;

The Thermoanaerobacterales je polyfyletický objednat z bakterie umístěny uvnitř polyfyletický třída Clostridia a zahrnující čtyři rodiny: Thermoanaerobacteraceae, Thermodesulfobiaceae, Thermoanaerobacterales Rodina III. Incertae Sedis a Thermoanaerobacterales Rodina IV. Incertae Sedis a různé neumístěné rody.^[1]

Tento řád je známý schopnostmi druhu přežít extrémní prostředí bez kyslíku a relativně zvýšené teploty pro živou bytost (až 80-90 ° C). Příkladem organismu v tomto pořadí je Thermoanaerobacter ethanolicus.^[2]

Fylogeneze

Aktuálně přijímaná taxonomie je založena na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN)^[3] a Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI)^[1]a fylogeneze je založena na 16S rRNA na bázi LTP uvolňování 111 o Projekt All-Species Living Tree.^[4]

Thermoanaerobacterales, jak již bylo zmíněno, je polyfyletický, a skládá se z více než šesti morfologicky a fyziologicky podobných subtypů:

Clostridium thermoamylolyticum ♠ Katkocin a kol. 1985
Gelria
Caldicellulosiruptor
Desulfovirgula thermocuniculi Kaksonen a kol. 2007
Thermanaeromonas toyohensis Mori a kol. 2002
Thermodesulfobiaceae
Thermoanaerobacteraceae
Thermoanaerobacterales Nepojmenovaný clade I [vč. Fervidicola ]

Tepidanaerobacter

	?T. acetatoxydans ♠ Westerholm et al. 2011

	T. syntrophicus Sekiguchi a kol. 2006 (typ sp.)

Thermovenabulum

	T. gondwanense Ogg a kol. 2010

	T. ferriorganovorum Zavarzina a kol. 2002 (typ sp.)

Thermosediminibacter

	T. litoriperuensis Lee a kol. 2006

	T. oceani Lee a kol. 2006 (typ sp.)

Fervidicola ferrireducens Ogg a Patel 2009

	Caldanaerovirga acetigignens Wagner a kol. 2009

	Thermovorax subterraneus Mäkinen a kol. 2012

Thermoanaerobacterales Nepojmenovaný clade II

Moorella

?M. perchloratireducens ♠ Balk a kol. 2008

	M. thermoacetica (Fontaine et al. 1942) Collins et al. 1994 (typ sp.)

	M. thermoautotrophica (Wiegel et al. 1982) Collins et al. 1994

M. humiferrea Nepomnyashchaya et al. 2012

	M. glycerini Slobodkin a kol. 1997

	M. mulderi Balk a kol. 2005

	Syntrophaceticus schinkii Westerholm et al. 2011

	Thermacetogenium phaeum Hattori a kol. 2000

Carboxydothermus

C. pertinax Yoneda a kol. 2012

C. islandicus Novikov a kol. 2011

C. siderophilus Slepova et al. 2009

	C. ferrireducens (Slobodkin et al. 1997) Slobodkin et al. 2006

	C. hydrogenoformans Svetlichny a kol. 1991 (typ sp.)

Thermoanaerobacterales Nejmenovaný clade III [vč. Thermohydrogenium ]

Mahella australiensis Bonilla Salinas a kol. 2004

Caldanaerobius

C. fijiensis Lee a kol. 2008 (typ sp.)

	C. polysaccharolyticus (Cann et al. 2001) Lee et al. 2008

	C. zeae (Cann et al. 2001) Lee et al. 2008

Caloribacterium cisternae Slobodkina a kol. 2012

Thermoanaerobacterium

?T. bryantii ♠ Stroot a kol. 2002

?T. islandicum ♠ Orlygsson & Baldursson 2006

	T. aotearoense Liu a kol. 1996

	T. thermostercoris Romano a kol. 2011

	T. thermosaccharolyticum (McClung 1935) Collins et al. 1994

	Thermohydrogenium kirishiense Zacharova a kol. 1996

T. aciditolerans Kublanov a kol. 2007

T. saccharolyticum Lee a kol. 1993

	T. thermosulfurigenes (Schink a Zeikus 1983) Lee a kol. 1993 (typ sp.)

	T. xylanolyticum Lee a kol. 1993

Poznámky:
♣ International Journal of Systematic Bacteriology nebo International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB / IJSEM) zveřejnil druhy, které jsou v tisku.
♠ Kmeny nalezené na Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI), ale není uveden v seznamu Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN).

Reference

^ ^A ^b Sayers; et al. "Thermoanaerobacterales". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2. března 2019.
^ C. Michael Hogan. 2010. Extremophile. eds. E. Monosson & C. Cleveland, Encyclopedia of Earth. Národní rada pro vědu a životní prostředí, Washington DC.
^ J.P.Euzéby. "Thermoanaerobacterales". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Citováno 2. března 2019.
^ Projekt All-Species Living Tree.„Vydání LTP založené na 16S rRNA 111 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 20. března 2013.

[ncbi-1] A ^b Sayers; et al. "Thermoanaerobacterales". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2. března 2019.

[2] C. Michael Hogan. 2010. Extremophile. eds. E. Monosson & C. Cleveland, Encyclopedia of Earth. Národní rada pro vědu a životní prostředí, Washington DC.

[3] J.P.Euzéby. "Thermoanaerobacterales". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Citováno 2. března 2019.

[4] Projekt All-Species Living Tree.„Vydání LTP založené na 16S rRNA 111 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 20. března 2013.

[1]

[2]

[3]

[4]