Thermoanaerobacter - Thermoanaerobacter - Wikipedia
| Thermoanaerobacter | |
|---|---|
| Vědecká klasifikace | |
| Doména: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | Thermoanaerobacter |
| Zadejte druh | |
| T. ethanolicus | |
Thermoanaerobacter je rod v kmeni Firmicutes (Bakterie ).[1] Členy tohoto rodu jsou termofilní a anaerobní, několik z nich bylo dříve popsáno jako Clostridium druhy a příslušníci dnes již zastaralých rodů Acetogenium a Thermobacteroides[2][3]
Etymologie
Název Thermoanaerobacter pochází z:
řecký přídavné jméno termoska (θερμός)horké; řecký předpona an (ἄν), ne; řecký podstatné jméno aer, eros (ἀήρ, ἀέρος)vzduch; Nová latina mužský rod podstatné jméno, bakterie, nominálně znamená "tyč", ale ve skutečnosti znamená bakterii, tyč; Nová latina mužský rod podstatné jméno Thermoanaerobacter, tyč, která roste v nepřítomnosti vzduchu při zvýšených teplotách.[4]
Druh
Rod obsahuje 15 druhů, jmenovitě[4]
- T. acetoethylicus ((Ben-Bassat a Zeikus 1983) Rainey a Stackebrandt 1993,; latinský podstatné jméno acetumocet; Nová latina přídavné jméno ethylicus, týkající se ethylalkoholu; Nová latina mužský rod přídavné jméno acetoethylicusTo znamená výrobu kyseliny octové a ethanolu.) Tento druh, dříve známý jako Thermobacteroides acetoethylicus, býval typovým druhem Thermobacteroides, ale byl přenesen do rodu Thermoanaerobacter, zatímco druhý člen rodu Thermobacteroides, Thermobacteroides proteolyticus byl překlasifikován jako Coprothermobacter proteolyticus[3]
- T. brockii ((Zeikus et al. 1983) Lee et al. 1993, ; Nová latina genitivní případ podstatné jméno brockii, Brocka, pojmenovaného pro Thomas Dale Brock , který byl průkopníkem studií fyziologie a ekologie termofily.) tento druh byl dříve znám jako Thermoanaerobium brockii[5][6]
- T. ethanolicus (Wiegel a Ljungdahl 1982, (Typové druhy rodu) .; Nová latina podstatné jméno ethanolethanol; latinský mužský rod dost. -icus, přípona použitá ve smyslu vztahující se k; Nová latina mužský rod přídavné jméno ethanolicus, označující produkci ethanolu.)[7]
- T. italicus (Kozianowski et al. 1998, ; latinský mužský rod přídavné jméno italicus, vztahující se k Itálii, kde byl organismus izolován.)[8]
- T. kivui ((Leigh a Wolfe 1983) Collins et al. 1994, ; Nová latina genitivní případ podstatné jméno kivui, vztahující se k Kivu, pojmenovaný pro jeho zdroj, Lake Kivu.) Tento druh byl známý jako Acetogenium kivui (jediný člen bývalého rodu) před převodem do tohoto rodu [9]
- T. mathranii (Larsen et al. 1998, ;: Nová latina genitivní případ podstatné jméno mathranii, Mathrani, na počest zesnulého Indry M. Mathraniho, který během své krátké kariéry přispěl k porozumění termofilních anaerobů z horkých pramenů.)[10][11]
- T. pentosaceus (Tomás et al. 2013 )[12]
- T. pseudethanolicus (Onyenwoke et al. 2007, ; řecký přídavné jméno pseudēs, Nepravdivé; Nová latina přídavné jméno ethanolicusepiteton specifický pro bakterie; Nová latina mužský rod přídavné jméno pseudethanolicus, nepravda (Thermoanaerobacter) ethanolicus.)[13]
- T. siderophilus (Slobodkin et al. 1999, ; řecký podstatné jméno sideros, žehlička; Nová latina přídavné jméno philus z řecký přídavné jméno philos (φίλος) což znamená přítel, milující; Nová latina mužský rod přídavné jméno siderophilus, milující železo.)[14]
- T. sulfurigignens (Lee et al. 2007, ; latinský podstatné jméno sírasíra; latinský přídavné jméno přídavné jméno gignens, produkující; Nová latina přídavné jméno přídavné jméno sirné ligandy, produkující síru.)[15]
- T. sulphophilus (Bonch-Osmolovskaya 1998,; latinský podstatné jméno sírasíra; Nová latina přídavné jméno philus z řecký přídavné jméno philos (φίλος) což znamená přítel, milující; Nová latina mužský rod přídavné jméno sulphophilus, líbí se mu elementární síra.)[16]
- T. thermocopriae ((Jin et al. 1988) Collins et al. 1994, ; řecký podstatné jméno thermē (θέρμη), teplo; řecký podstatné jméno kopria, hnoje; Nová latina genitivní případ podstatné jméno thermocopriae, tepelného kompostu.) Tento druh byl dříve znám jako Clostridium thermocopriae[9]
- T. thermohydrosulfuricus ((Klaushofer a Parkkinen 1965) Lee et al. 1993, ; řecký přídavné jméno termoska (θερμός)horké; Nová latina mužský rod přídavné jméno hydrosulfuricus, týkající se sirovodíku; Nová latina mužský rod přídavné jméno thermohydrosulfuricus, což naznačuje, že organismus roste při vysokých teplotách a redukuje siřičitany na H2S.), tento druh také býval Clostridium thermohydrosulfuricum[6]
- T. uzonensis (Wagner et al. 2008, ; Nová latina mužský rod přídavné jméno uzonensis, týkající se uzonské kaldery, Kamčatky, Dálného východu Ruska.)[17]
- T. wiegelii ( Kuchař et al. 1996, ; Nová latina genitivní případ podstatné jméno wiegelii, Juergena Wiegela, jako uznání jeho příspěvků ke studiu termofilních anaerobů.)[18]
Tři bývalí členové tohoto rodu, T. subterraneus, T. tengcongensis a T. yonseiensis, byly překlasifikovány jako poddruhy Caldanaerobacter subterraneus[19]
Viz také
Reference
- ^ Klasifikace vstupu rodu Thermoanaerobacter v LPSN; Euzéby, J.P. (1997). „Seznam bakteriálních jmen se stálým názvoslovím: složka dostupná na internetu“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 47 (2): 590–2. doi:10.1099/00207713-47-2-590. PMID 9103655.
- ^ Collins, MD; Lawson, PA; Willems, A; et al. (1994). „Fylogeneze rodu Clostridium: návrh pěti nových rodů a jedenáct nových kombinací druhů“. Int. J. Syst. Bacteriol. 44 (4): 812–26. doi:10.1099/00207713-44-4-812. PMID 7981107.
- ^ A b Rainey, F.A.; Stackebrandt, E. (1993). "Převod typového druhu rodu Thermobacteroides do rodu Thermoanaerobacter jako Thermoanaerobacter acetoethylicus (Ben-Bassat a Zeikus 1981) comb. Nov., Popis Coprothermobacter gen. Nov. A reklasifikace Thermobacteroides proteolyticus jako Coprothermobacter proteolyticus (Ollivier) et al. 1985) hřeben. listopad". Int. J. Syst. Bacteriol. 43 (4): 857–859. doi:10.1099/00207713-43-4-857.
- ^ A b Vstup termoanobakterů v LPSN; Euzéby, J.P. (1997). „Seznam bakteriálních jmen se stálým názvoslovím: složka dostupná na internetu“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 47 (2): 590–2. doi:10.1099/00207713-47-2-590. PMID 9103655.
- ^ Zeikus, J.G .; Hegge, P.W .; Anderson, M.A. (1979). „Thermoanaerobium brockii gen. Nov. A sp. Nov., Nová chemoorganotrofní, kaldoaktivní, anaerobní bakterie“. Archiv mikrobiologie. 122 (1): 41–48. doi:10.1007 / BF00408044.
- ^ A b Lee, Y.E .; Jain, M.K .; Lee, C .; Lowe, S.E .; Zeikus, J.G. (1993). „Taxonomické rozlišení sacharolytických termofilních anaerobů: popis Thermoanaerobacterium xylanolyticum gen. Nov., Sp. Nov. A Thermoanaerobacterium saccharolyticum gen. Nov., Sp. Nov .; reklasifikace Thermoanaerobium brockii, Clostridium thermosulfurogenes a Clostridium aso Thermoanaerobacter brockii comb. Nov., Thermoanaerobacterium thermosulfurigenes comb. Nov. A Thermoanaerobacter thermohydrosulfuricus comb. Nov.; A přenos Clostridium thermohydrosulfuricum 39E do Thermoanaerobacter ethanolicus ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 43 (1): 41–51. doi:10.1099/00207713-43-1-41.
- ^ Wiegel, J. R .; Ljungdahl, L. G. (1981). „Thermoanaerobacter ethanolicus gen. Nov., spec. Nov., nová extrémní termofilní, anaerobní bakterie“. Archiv mikrobiologie. 128 (4): 343–348. doi:10.1007 / BF00405910.
- ^ Kozianowski, G .; Canganella, F .; Rainey, F. A .; Hippe, H .; Antranikian, G. (1997). „Čištění a charakterizace termostabilních pektát-lyáz z nově izolované termofilní bakterie, Thermoanaerobacter italicus sp. Listopad“. Extremophiles. 1 (4): 171–182. doi:10.1007 / s007920050031. PMID 9680298.
- ^ A b Collins, M. D .; Lawson, P. A .; Willems, A .; Cordoba, J. J .; Fernandez-Garayzabal, J .; Garcia, P .; Cai, J .; Hippe, H .; Farrow, J. A. E. (1994). „Fylogeneze rodu Clostridium: návrh pěti nových rodů a jedenáct nových kombinací druhů“. International Journal of Systematic Bacteriology. 44 (4): 812–826. doi:10.1099/00207713-44-4-812. ISSN 0020-7713. PMID 7981107.
- ^ Larsen, L .; Nielsen, P .; Ahring, B. K. (1997). „Thermoanaerobacter mathranii sp. Nov., Extrémně termofilní anaerobní bakterie produkující ethanol z horkého pramene na Islandu“. Archiv mikrobiologie. 168 (2): 114–119. doi:10,1007 / s002030050476. PMID 9238102.
- ^ "Seznam nových jmen a nových kombinací dříve publikovaných účinně, ale neplatně,". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 57 (Pt 1): 1. 2007. doi:10.1099 / ijs.0.64923-0. PMID 17220429.
- ^ Tomás, A.F .; Karakashev, D .; Angelidaki, I. (2013). „Thermoanaerobacter pentosaceus sp. Nov., Anaerobní, extrémně termofilní, vysoce ethanolová bakterie izolovaná z domácího odpadu“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 63 (7): 2396–2404. doi:10.1099 / ijs.0.045211-0. PMID 23178727.
- ^ Onyenwoke, R. U .; Kevbrin, V. V .; Lysenko, A. M .; Wiegel, J. (2007). „Thermoanaerobacter pseudethanolicus sp. Nov., Termofilní heterotrofní anaerob z Yellowstonského národního parku“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 57 (10): 2191–2193. doi:10.1099 / ijs.0.65051-0. PMID 17911280.
- ^ Slobodkin, A.I .; Tourova, T.P .; Kuznetsov, B.B .; Kostrikina, N.A .; Chernyh, NA; Bonch-Osmolovskaya, E.A. (1999). „Thermoanaerobacter siderophilus sp. Nov., Nová disimilační Fe (III) snižující, anaerobní, termofilní bakterie“. International Journal of Systematic Bacteriology. 49 (4): 1471–1478. doi:10.1099/00207713-49-4-1471. PMID 10555328.
- ^ Lee, Y. -J .; Dashti, M .; Prange, A .; Rainey, F. A .; Rohde, M .; Whitman, W. B .; Wiegel, J. (2007). „Thermoanaerobacter sulfurigignens sp. Nov., Anaerobní termofilní bakterie, která redukuje 1 M thiosíran na elementární síru a toleruje 90 mM siřičitanu“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 57 (7): 1429–1434. doi:10.1099 / ijs.0.64748-0. PMID 17625170.
- ^ Bonch-Osmolovskaya, E.A .; Miroshnichenko, M.L .; Chernykh, NA; Kostrikina, N.A .; Pikuta, E.V .; Rainey, F.A. (1997). „Redukce elementární síry středně teplomilnými organotrofními bakteriemi a popis Thermoanaerobacter sulphophilus sp. Nov“. Mikrobiologie. 66: 483–489.
- ^ Wagner, I.D .; Zhao, W .; Zhang, C. L .; Romanek, C. S .; Rohde, M .; Wiegel, J. (2008). "Thermoanaerobacter uzonensis sp. Nov., Anaerobní termofilní bakterie izolovaná z horkého pramene v uzonské kaldere, Kamčatce, na Dálném východě". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 58 (11): 2565–2573. doi:10.1099 / ijs.0.65343-0. PMID 18984694.
- ^ Cook, G. M.; Rainey, F.A.; Patel, B.K.C .; Morgan, H.W. (1996). „Charakterizace nového obligátně anaerobního termofila, Thermoanaerobacter wiegelii sp. Nov“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 46 (1): 123–127. doi:10.1099/00207713-46-1-123. PMID 8573487.
- ^ Fardeau, M .; Salinas, M .; L'Haridon, S .; Jeanthon, C .; Verhé, F .; Cayol, J .; Patel, B .; Garcia, J .; Ollivier, B. (2004). „Izolace nových termofilních anaerobů fylogeneticky příbuzných Thermoanaerobacter subterraneus z ropných nádrží: přeřazení T. subterraneus, Thermoanaerobacter yonseiensis, Thermoanaerobacter tengcongensis a Carboxydibrachium pacificum do rodu Caldanaerobacter subterraneus. ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 54 (2): 467–474. doi:10.1099 / ijs.0.02711-0. PMID 15023962.