Nástin biochemie - Outline of biochemistry - Wikipedia

Část série na
Biochemie
Klíčové komponenty
Biomolekuly Metabolismus
Index Obrys
Dějiny biochemie
Dějiny
Biochemie Buněčná biologie Bioinformatika Enzymologie Genetika Imunologie Molekulární biologie Rostlinná biochemie Strukturní biologie
Odvětví biochemie
Seznam biochemiků
Glosáře
Glosář biologie Glosář chemie
Portály: Biochemie

Následující obrys je uveden jako přehled a aktuální průvodce biochemií:

Biochemie - studie chemikálie procesy v životě organismy, včetně živé hmoty. Biochemie řídí všechny živé organismy a živé procesy.

Aplikace biochemie

• Testování
  • Amesův test - bakterie salmonely jsou vystaveny dané chemické látce (například potravinářské přídatné látce) a jsou měřeny změny ve způsobu růstu bakterií. Tento test je užitečný pro skríning chemických látek, aby se zjistilo, zda mutují strukturu DNA, a dále identifikace jejich potenciálu způsobit rakovinu u lidí.
  • Těhotenský test - jeden používá vzorek moči a druhý vzorek krve. Oba detekují přítomnost lidského hormonu choriový gonadotropin (hCG). Tento hormon je produkován placentou krátce po implantaci embrya do děložních stěn a hromadí se.
  • Screening rakoviny prsu - identifikace rizika testováním mutací ve dvou genech - gen pro rakovinu prsu-1 (BRCA1) a gen pro rakovinu prsu-2 (BRCA2) - umožňují ženě naplánovat zvýšené screeningové testy častěji než v běžné populaci.
  • Prenatální genetické testování - testování plodu na možné genetické vady, k detekci chromozomálních abnormalit, jako je Downov syndrom nebo vrozené vady, jako je spina bifida.
  • PKU test - Fenylketonurie (PKU) je metabolická porucha, při které jednotlivci chybí enzym zvaný fenylalaninhydroxyláza. Absence tohoto enzymu umožňuje hromadění fenylalaninu, což může vést k mentální retardaci.
• Genetické inženýrství - odebrání genu z jednoho organismu a jeho umístění do jiného. Biochemici vložili gen pro lidský inzulín do bakterií. Bakterie prochází procesem translace a vytvářejí lidský inzulín.
• Klonování - Ovce Dolly byla prvním savcem, který byl kdy klonován z buněk dospělých zvířat. Klonovaná ovce byla samozřejmě geneticky identická s původní dospělou ovcí. Tento klon byl vytvořen odebráním buněk z vemene šestileté bahnice a jejich pěstováním v laboratoři.
• Genová terapie - do organismu je vložen modifikovaný nebo zdravý gen, který nahradí gen způsobující onemocnění. K dodání zdravého genu do cílových buněk pacienta se běžně používá virus, který byl změněn tak, aby přenášel lidskou DNA. Tento proces byl poprvé úspěšně použit v roce 1990 u 4letého pacienta, který postrádal imunitní systém kvůli vzácnému genetickému onemocnění zvanému těžká kombinovaná imunodeficience (SCID).

Odvětví biochemie

Hlavní větve

• Biochemie zvířat
• Rostlinná biochemie
• Molekulární biologie
• Buněčná biologie
• Metabolismus
• Imunologie
• Genetika
• Enzymologie

Ostatní pobočky

Biotechnologie,Bioluminiscence,Molekulární chemie,Enzymatická chemie,Genetické inženýrství,Léčiva,Endokrinologie,NeurochemieHematologie,Výživa,Fotosyntéza,Životní prostředí,Toxikologie

Dějiny biochemie

Dějiny biochemie

Koncepty obecné biochemie

• Hlavní kategorie biosloučenin:
  • Sacharidy  : cukr -- disacharid -- polysacharid -- škrob -- glykogen
  • Lipidy  : mastné kyseliny -- tuky -- éterické oleje -- oleje -- vosky -- cholesterol
  • Nukleové kyseliny  : DNA -- RNA -- mRNA -- tRNA -- rRNA -- kodon -- adenosin -- cytosin -- guanin -- tymin -- uracil
  • Proteiny  :
    • aminokyselina -- glycin -- arginin -- lysin
    • peptid -- primární struktura -- sekundární struktura -- terciární struktura -- konformace -- skládání bílkovin
• Chemické vlastnosti:
  • molekulární vazba -- kovalentní vazba -- iontová vazba -- vodíková vazba -- ester -- ethyl
  • molekulární náboj -- hydrofilní -- hydrofobní -- polární
  • pH -- kyselina -- zásaditý -- základna
  • oxidace -- snížení -- hydrolýza
• Strukturální sloučeniny:
  • V buňkách: bičík -- peptidoglykan -- myelin -- aktin -- myosin
  • U zvířat: chitin -- keratin -- kolagen -- hedvábí
  • V rostlinách: celulóza -- lignin -- buněčná stěna
• Enzymy a aktivita enzymu:
  • kinetika enzymů -- inhibice enzymů
  • proteolýza -- ubikvitin -- proteazom
  • kináza -- dehydrogenáza
• Membrány  : model tekuté mozaiky -- difúze -- osmóza
  • fosfolipidy -- glykolipid -- glykokalyx -- antigen -- isopren
  • iontový kanál -- protonová pumpa -- transport elektronů -- iontový gradient -- antiporter -- symporter -- chinon -- riboflavin
• Energetické dráhy:
  • pigmenty  : chlorofyl -- karotenoidy -- xantofyl -- cytochrom -- fykobilin -- bakteriorhodopsin -- hemoglobin -- myoglobin -- absorpční spektrum -- akční spektrum -- fluorescence
  • Fotosyntéza  : světelná reakce -- temná reakce
  • Kvašení  : Acetyl-CoA -- kyselina mléčná
  • Buněčné dýchání  : Adenosintrifosfát (ATP) -- NADH -- pyruvát -- šťavelan -- citrát
  • Chemosyntéza
• Nařízení
  • hormony  : auxin
  • signální transdukce -- růstový faktor -- transkripční faktor -- protein kináza -- SH3 doména
  • Poruchy: nádor -- onkogen -- gen potlačující nádor
  • Receptory  : Integrin -- transmembránový receptor -- iontový kanál
• Techniky  : elektroforéza -- chromatografie -- hmotnostní spektrometrie -- rentgenová difrakce -- Southern blot -- frakcionace -- Gramovo barvení -- Rezonance povrchového plazmonu -- Mikroskopická termoforéza

Biochemické techniky

Molekulární genetika

• Sekvenování DNA
• Polymerázová řetězová reakce
• Northern blot
• Southern blot
• Fúzní proteiny
• DNA microarray
• Bioinformatika
• Průtoková cytometrie

Čištění bílkovin

• Western blot
• Chromatografie
• ELISA

Strukturální stanovení

• Rentgenová krystalografie
• NMR
• Elektronová mikroskopie
• Molekulární dynamika
• Hmotnostní spektrometrie
• Izotopové značení

Interakce mezi biomolekulami

• Coimmunoprecipitace
• Test posunu elektroforetické mobility
• Jihozápadní blot

externí odkazy

• Biochemistry, 5. vydání. Plné znění Berga, Tymoczka a Stryera, s laskavým svolením NCBI.
• Biochemistry, 2. vyd. Plné znění Garretta a Grishama.