MTHFD1 - MTHFD1

MTHFD1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1A4I, 1DIA, 1DIB, 1DIG
Identifikátory
Aliasy	MTHFD1, MTHFC, MTHFD, C1-THF-syntáza, methylenetetrahydrofolát dehydrogenáza, cyklohydroláza a formyltetrahydrofolát syntetáza 1, CIMAH
Externí ID	OMIM: 172460 MGI: 1342005 HomoloGene: 55940 Genové karty: MTHFD1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	64,463,457 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	76,319,803 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • aktivita methylenetetrahydrofolát dehydrogenázy (NADP +); • aktivita methylenetetrahydrofolát dehydrogenázy (NAD +); • ligázová aktivita; • methylenetetrahydrofolát dehydrogenáza [NAD (P) + aktivita]; • katalytická aktivita; • aktivita oxidoreduktázy; • ATP vazba; • aktivita hydrolázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita formiát-tetrahydrofolát ligázy; • aktivita methenyltetrahydrofolátcyklohydrolázy;
Buněčná složka	• membrána; • mitochondrie; • extracelulární exosom; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• proces biosyntézy purinového nukleotidu; • transsulfurace; • homeostáza neutrofilů; • metabolický proces s jedním uhlíkem; • metabolický proces rodiny aminokyselin serinu; • embryonální neurokranium morfogeneze; • interkonverze tetrahydrofolátu; • proces biosyntézy histidinu; • proces biosyntézy buněčných aminokyselin; • vývoj somitů; • proces biosyntézy aminokyselin rodiny serinů; • biosyntetický proces methioninu; • vývoj srdce; • metabolický proces methioninu; • uzavření neurální trubice; • metabolický proces kyseliny listové; • embryonální morfogeneze viscerokranu; • metabolismus; • oxidačně-redukční proces; • proces biosyntézy purinové nukleobáze; • Proces biosyntézy 10-formyltetrahydrofolátu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4522
	108156
	ENSG00000100714
	ENSMUSG00000021048
	P11586
	Q922D8
	NM_005956; NM_001364837
	NM_138745
	NP_005947; NP_001351766
	NP_620084
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

MTHFD1 je gen lokalizovaný u lidí na chromozomu 14, který kóduje protein se třemi odlišnými enzymatickými aktivitami. C-1-tetrahydrofolát syntáza, cytoplazmatická také známá jako C1-THF syntáza, je enzym že u lidí je kódován MTHFD1 (methylenetetrahydroFolat dehydrogenáza 1) gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje protein, který má tři odlišné enzymatické aktivity, methylenetetrahydrofolát dehydrogenáza (1.5.1.5), methenyltetrahydrofolátcyklohydroláza (3.5.4.9) a mravenčan – tetrahydrofolát ligáza (6.3.4.3). Každá z těchto aktivit katalyzuje jednu ze tří následných reakcí při interkonverzi 1-uhlíkových derivátů tetrahydrofolát, což jsou substráty pro methionin, thymidylát a de novo purin syntézy. Trifunkční enzymatické aktivity jsou udělovány dvěma hlavními doménami, aminoterminální částí obsahující aktivity dehydrogenázy a cyklohydrolázy a větší doménou syntetázy.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100714 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021048 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hum DW, Bell AW, Rozen R, MacKenzie RE (prosinec 1988). "Primární struktura lidského trifunkčního enzymu. Izolace cDNA kódující methylenetetrahydrofolát dehydrogenázu-methenyltetrahydrofolát cyklohydrolázu-formyltetrahydrofolát syntetázu". J Biol Chem. 263 (31): 15946–50. PMID 3053686.
^ Rozen R, Barton D, Du J, Hum DW, MacKenzie RE, Francke U (červen 1989). „Chromozomální lokalizace genu pro lidský trifunkční enzym, methylenetetrahydrofolát dehydrogenáza-methenyltetrahydrofolát cyklohydroláza-formyltetrahydrofolát syntetáza“. Jsem J Hum Genet. 44 (6): 781–6. PMC 1715669. PMID 2786332.
^ ^A ^b „Entrez Gene: MTHFD1 methylenetetrahydrofolát dehydrogenáza (závislá na NADP +) 1, methenyltetrahydrofolát cyklohydroláza, formyltetrahydrofolát syntetáza“.
^ Watkins D, Schwartzentruber JA, Ganesh J, Orange JS, Kaplan BS, Nunez LD, Majewski J, Rosenblatt DS (září 2011). „Nová vrozená chyba metabolismu folátu: identifikace zachycením exomu a sekvenování mutací v genu MTHFD1 v jediném probandu“. J. Med. Genet. 48 (9): 590–2. doi:10.1136 / jmedgenet-2011-100286. PMID 21813566.

Další čtení

Schild D, Brake AJ, Kiefer MC a kol. (1990). "Klonování tří lidských multifunkčních de novo purinových biosyntetických genů funkční komplementací kvasinkových mutací". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (8): 2916–20. doi:10.1073 / pnas.87.8.2916. PMC 53804. PMID 2183217.
Peri KG, Belanger C, Mackenzie RE (1989). "Nukleotidová sekvence lidské NAD-závislé methylen tetrahydrofolát dehydrogenázy-cyklohydrolázy". Nucleic Acids Res. 17 (21): 8853. doi:10.1093 / nar / 17.21.8853. PMC 335047. PMID 2587219.
MacKenzie RE, Mejia N, Yang XM (1989). „Methylenetetrahydrofolát dehydrogenázy v normálních a transformovaných savčích buňkách“. Adv. Enzyme Regul. 27: 31–9. doi:10.1016/0065-2571(88)90007-6. PMID 3074630.
Shannon KW, Rabinowitz JC (1986). „Čištění a charakterizace mitochondriálního isozymu C1-tetrahydrofolát syntázy ze Saccharomyces cerevisiae“. J. Biol. Chem. 261 (26): 12266–71. PMID 3528153.
Mejia NR, MacKenzie RE (1985). „NAD-dependentní methylenetetrahydrofolát dehydrogenáza je exprimována nesmrtelnými buňkami“. J. Biol. Chem. 260 (27): 14616–20. PMID 3877056.
Allaire M, Li Y, MacKenzie RE, Cygler M (1998). „3-D struktura bifunkčního enzymu dehydrogenázy / cyklohydrolázy závislého na folátu při rozlišení 1,5 A“. Struktura. 6 (2): 173–82. doi:10.1016 / S0969-2126 (98) 00019-7. PMID 9519408.
Hol FA, van der Put NM, Geurds MP a kol. (1998). „Molekulárně genetická analýza genu kódujícího trifunkční enzym MTHFD (methylenetetrahydrofolát-dehydrogenáza, methenyltetrahydrofolát-cyklohydroláza, formyltetrahydrofolát-syntetáza) u pacientů s defekty neurální trubice“. Clin. Genet. 53 (2): 119–25. doi:10.1111 / j.1399-0004.1998.tb02658.x. PMID 9611072.
Schmidt A, Wu H, MacKenzie RE a kol. (2000). „Struktury tří komplexů inhibitorů poskytují přehled o mechanismu reakce lidské methylenetetrahydrofolátdehydrogenázy / cyklohydrolázy.“ Biochemie. 39 (21): 6325–35. doi:10.1021 / bi992734y. PMID 10828945.
Brody LC, Conley M, Cox C a kol. (2003). „Polymorfismus, R653Q, v trifunkčním enzymu methylenetetrahydrofolát dehydrogenáza / methenyltetrahydrofolát cyklohydroláza / formyltetrahydrofolát syntetáza je mateřským genetickým rizikovým faktorem pro poruchy neurální trubice: zpráva výzkumné skupiny vrozených vad“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 71 (5): 1207–15. doi:10.1086/344213. PMC 385099. PMID 12384833.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Parle-McDermott A, Mills JL, Kirke PN a kol. (2005). „Polymorfismus MTHFD1 R653Q je genetickým rizikovým faktorem matky pro závažnou abrupci placenty“. Dopoledne. J. Med. Genet. A. 132 (4): 365–8. doi:10,1002 / ajmg.a. 30354. PMID 15633187.
Parle-McDermott A, Pangilinan F, Mills JL, et al. (2005). „Polymorfismus v genu MTHFD1 zvyšuje riziko, že matka bude mít nevysvětlenou ztrátu těhotenství ve druhém trimestru,“. Mol. Hučení. Reprod. 11 (7): 477–80. doi:10,1093 / mol / gah204. PMID 16123074.
Kohlmeier M, da Costa KA, Fischer LM, Zeisel SH (2005). „Genetická variace folátem zprostředkované cesty přenosu jednoho uhlíku předpovídá u lidí náchylnost k nedostatku cholinu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (44): 16025–30. doi:10.1073 / pnas.0504285102. PMC 1276051. PMID 16236726.
De Marco P, Merello E, Calevo MG a kol. (2006). "Hodnocení methylenetetrahydrofolát-dehydrogenázy 1958G> Polymorfismus pro riziko poškození neurální trubice". J. Hum. Genet. 51 (2): 98–103. doi:10.1007 / s10038-005-0329-6. PMID 16315005.
Sun J, Xu Y, Zhu Y, Lu H (2007). „Polymorfismus genu pro methylenetetrahydrofolát reduktázu, homocystein a riziko makroangiopatie u diabetes mellitus 2. typu“. J. Endocrinol. Investovat. 29 (9): 814–20. doi:10.1007 / bf03347376. PMID 17114913.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P11586 (C-l-tetrahydrofolát syntáza, cytoplazmatická) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100714 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021048 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid3053686-5] Hum DW, Bell AW, Rozen R, MacKenzie RE (prosinec 1988). "Primární struktura lidského trifunkčního enzymu. Izolace cDNA kódující methylenetetrahydrofolát dehydrogenázu-methenyltetrahydrofolát cyklohydrolázu-formyltetrahydrofolát syntetázu". J Biol Chem. 263 (31): 15946–50. PMID 3053686.

[pmid2786332-6] Rozen R, Barton D, Du J, Hum DW, MacKenzie RE, Francke U (červen 1989). „Chromozomální lokalizace genu pro lidský trifunkční enzym, methylenetetrahydrofolát dehydrogenáza-methenyltetrahydrofolát cyklohydroláza-formyltetrahydrofolát syntetáza“. Jsem J Hum Genet. 44 (6): 781–6. PMC 1715669. PMID 2786332.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: MTHFD1 methylenetetrahydrofolát dehydrogenáza (závislá na NADP +) 1, methenyltetrahydrofolát cyklohydroláza, formyltetrahydrofolát syntetáza“.

[pmid21813566-8] Watkins D, Schwartzentruber JA, Ganesh J, Orange JS, Kaplan BS, Nunez LD, Majewski J, Rosenblatt DS (září 2011). „Nová vrozená chyba metabolismu folátu: identifikace zachycením exomu a sekvenování mutací v genu MTHFD1 v jediném probandu“. J. Med. Genet. 48 (9): 590–2. doi:10.1136 / jmedgenet-2011-100286. PMID 21813566.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Enzymy: CO CS a CN ligázy (ES 6.1-6.3)
6.1: Uhlík-kyslík	Aminoacyl tRNA syntetáza Alanin Arginin Asparagin Aspartát Cystein D-alanin - poly (fosforibitol) ligáza Glutamát Glutamin Glycin Histidin Isoleucin Leucin Lysin Methionin Fenylalanin Prolin Serine Threonin Tryptofan Tyrosin Valine
6.2: Uhlík-síra	Sukcinyl koenzym syntetáza Acetyl-CoA syntetáza Mastná kyselina s dlouhým řetězcem - CoA ligáza
6.3: Uhlík-dusík	Glutamin syntetáza Ubikvitin ligáza Cullin Von Hippel – Lindau nádorový supresor UBE3A Mdm2 Komplex podporující anafázu UBR1 Glutathion syntetáza CTP syntetáza Adenylosukcinát syntáza Argininosukcinát syntáza Holokarboxyláza syntetáza GMP syntáza Asparagin syntetáza Karbamoylfosfát syntetáza Já II Glutamát-cysteinová ligáza

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )