Lidský koronavirus OC43 - Human coronavirus OC43 - Wikipedia

Lidský koronavirus OC43
TEM koronaviru OC43.jpg
Transmisní elektronový mikrofotografie lidského koronaviru OC43
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Pisuviricota
Třída:Pisoniviricetes
Objednat:Nidovirales
Rodina:Coronaviridae
Rod:Betacoronavirus
Druh:
Betacoronavirus 1
Kmen:
Lidský koronavirus OC43

Lidský koronavirus OC43[1] (HCoV-OC43) je členem druhu Betacoronavirus 1, který infikuje lidi a dobytek.[2][3] Infikování koronavirus je obaleno, pozitivní smysl, jednovláknové RNA virus který vstupuje do své hostitelské buňky vazbou na Receptor kyseliny N-acetyl-9-0-acetylneuraminové.[4] OC43 je jedním z sedm známých koronavirů infikovat lidi. Je to jeden z virů odpovědných za nachlazení.[5][6] Má, stejně jako jiné koronaviry z rodu Betacoronavirus, podrod Embekovirus, další kratší spike protein volala hemaglutininesteráza (ON).[7][2]

Virologie

Čtyři HCoV-OC43 genotypy (A až D) byly identifikovány, přičemž genotyp D s největší pravděpodobností pochází z genetická rekombinace. The kompletní sekvenování genomu analýza dvou kmenů genotypu C a D a bootcan ukazuje události rekombinace mezi genotypy B a C při generování genotypu D. Ze 29 identifikovaných kmenů žádný z nich nepatří k starodávnějšímu genotypu A. Molekulární hodiny analýza pomocí špice a nukleokapsid geny data poslední společný předek všech genotypů do 50. let. Genotyp B a C se datuje do 80. let. Genotyp B do 90. let a genotyp C do konce 90. let do začátku 2000. Kmeny rekombinantního genotypu D byly detekovány již v roce 2004.[5]

Srovnání HCoV-OC43 s nejvíce příbuzným kmenem druhu Betacoronavirus 1, bovinní koronavirus BCoV naznačila, že mají nejběžnějšího předka z konce 19. století, přičemž několik metod přináší nejpravděpodobnější data kolem roku 1890, což vede autory ke spekulacím, že úvod původního kmene pro lidskou populaci mohlo způsobit 1889–1890 pandemie obvykle se připisuje chřipce.[8] Epidemie Covid-19 v roce 2020 přinesla další důkazy o souvislosti. Pandemie z roku 1890 vyvolala příznaky blíže těm, s nimiž je spojeno SARS-CoV-2 než na chřipku.[9]

Původ HCoV-OC43 je nejistý, ale předpokládá se, že mohl pocházet z hlodavců a poté prošel skotem jako mezihostitelé.[10] Mohlo dojít k deleci z BCoV na HCoV-OC43 pro událost přenosu mezi druhy ze skotu na člověka.[8]

HCoV-OC43 je jedním z sedm známých koronavirů je známo, že infikuje lidi. Dalších šest je:[11]

Patogeneze

Spolu s HCoV-229E, druh rodu Alfacoronavirus, HCoV-OC43 patří mezi známé viry, které způsobují nachlazení. Oba viry mohou být závažné infekce dolních dýchacích cest, počítaje v to zápal plic u kojenců, starších osob a imunokompromitovaný jednotlivci jako ti, kteří podstupují chemoterapie a ti s HIV / AIDS.[12][13][14]

Epidemiologie

Koronaviry mají celosvětovou distribuci, což způsobuje 10–15% případů běžného nachlazení (virus, který se nejčastěji podílí na běžném nachlazení, je rhinovirus, zjištěno ve 30–50% případů).[15] Infekce vykazují sezónní vzorec, přičemž většina případů se vyskytuje v zimních měsících.[16][15][17]

Viz také

Reference

  1. ^ Lee, Paul. Molekulární epidemiologie lidského koronaviru OC43 v Hongkongu (Teze). University of Hong Kong Libraries. doi:10,5353 / th_b4501128. hdl:10722/131538.
  2. ^ A b „Prohlížeč taxonomie (Betacoronavirus 1)“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2020-02-29.
  3. ^ Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P .; Liu, Ding Xiang (2016-07-25). „Lidské koronaviry: přehled interakcí mezi viry a hostiteli“. Nemoci. 4 (3): 26. doi:10,3390 / nemoci4030026. PMC  5456285. PMID  28933406. Viz tabulka 1.
  4. ^ Li, Fang (2016-09-29). "Struktura, funkce a vývoj proteinů Spike Coronavirus". Roční přehled virologie. 3 (1): 237–261. doi:10.1146 / annurev-virology-110615-042301. PMC  5457962. PMID  27578435. BCoV S1-NTD nerozpozná galaktózu jako galektiny. Místo toho rozpoznává kyselinu 5-N-acetyl-9-0-acetylneuraminovou (Neu5,9Ac2) (30, 43). Stejný cukerný receptor je také rozpoznáván lidským koronavirem OC43 (43, 99). OC43 a BCoV jsou si geneticky blízce příbuzné a OC43 mohl být výsledkem zoonotického přelévání BCoV (100, 101).
  5. ^ A b Lau, Susanna K. P .; Lee, Paul; Tsang, Alan K. L .; Yip, Cyril C. Y .; Tse, Herman; Lee, Rodney A .; Takže, Lok-Yee; Lau, Y.-L .; Chan, Kwok-Hung; Woo, Patrick C. Y .; Yuen, Kwok-Yung (2011). „Molekulární epidemiologie lidského koronaviru OC43 odhaluje v průběhu času vývoj různých genotypů a nedávný výskyt nového genotypu v důsledku přirozené rekombinace“. Journal of Virology. 85 (21): 11325–37. doi:10.1128 / JVI.05512-11. PMC  3194943. PMID  21849456.
  6. ^ Gaunt, E.R .; Hardie, A .; Claas, E.C.J .; Simmonds, P .; Templeton, K.E. (2010). „Epidemiologie a klinické prezentace čtyř lidských koronavirů 229E, HKU1, NL63 a OC43 detekovaných po dobu 3 let pomocí nové multiplexní metody PCR v reálném čase“. J Clin Microbiol. 48 (8): 2940–7. doi:10.1128 / JCM.00636-10. PMC  2916580. PMID  20554810.
  7. ^ Woo, Patrick C. Y .; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P .; Yuen, Kwok-Yung (2010-08-24). „Koronavirová genomika a bioinformatická analýza“. Viry. 2 (8): 1804–20. doi:10,3390 / v2081803. PMC  3185738. PMID  21994708. Ve všech členech podskupiny A Betacoronavirus je gen pro hemaglutininesterázu (HE), který kóduje glykoprotein s aktivitou neuraminátové O-acetylesterázy a aktivním místem FGDS, přítomný po směru od ORF1ab a proti směru od genu S (obrázek 1).
  8. ^ A b Vijgen, Leen; Keyaerts, Els; Moës, Elien; Thoelen, Inge; Wollants, Elke; Lemey, Philippe; Vandamme, Anne-Mieke; Van Ranst, Marc (2005). „Kompletní genomová sekvence lidského koronaviru OC43: Analýza molekulárních hodin naznačuje relativně nedávnou událost přenosu zoonotického koronaviru“. Journal of Virology. 79 (3): 1595–1604. doi:10.1128 / JVI.79.3.1595-1604.2005. PMC  544107. PMID  15650185.
  9. ^ Knudsen, Jeppe Kyhne (13. srpna 2020). "Overraskende opdagelse: Coronavirus har tidligere lagt verden ned" [Překvapivý objev: Koronavirus dříve zničil svět]. DR (v dánštině). Citováno 13. srpna 2020. Dánský výzkum ukazuje, že předpokládaná chřipková pandemie v roce 1889 byla ve skutečnosti způsobena koronavirem.
  10. ^ Forni, Diego; Cagliani, Rachele; Clerici, Mario; Sironi, Manuela (2017). "Molekulární vývoj lidských koronavirových genů". Trendy v mikrobiologii. 25 (1): 35, 37. doi:10.1016 / j.tim.2016.09.001. ISSN  0966-842X.
  11. ^ Leung, Daniel. „Koronaviry (včetně SARS)“. Poradce pro infekční nemoci. Podpora rozhodování v medicíně, LLC. Citováno 1. srpna 2020.
  12. ^ Wevers, Brigitte A .; Van Der Hoek, Lia (2009). „Nedávno objevené lidské koronaviry“. Kliniky laboratorní medicíny. 29 (4): 715–724. doi:10.1016 / j.cll.2009.07.007. PMC  7131583. PMID  19892230.
  13. ^ Mahony, James B. (2007). "Koronaviry". V Murray, Patrick R .; Baron, Ellen Jo; Jorgensen, James H .; Landry, Marie Louise; Pfaller, Michael A. (eds.). Manuál klinické mikrobiologie (9. vydání). Washington D.C .: ASM Press. 1414–23. ISBN  978-1-55581-371-0.
  14. ^ Pyrc, K .; Berkhout, B .; Van Der Hoek, L. (2007). „Antivirové strategie proti lidským koronavirům“. Cíle na infekční poruchy. 7 (1): 59–66. doi:10.2174/187152607780090757. PMID  17346212.
  15. ^ A b Wat, Dennis (2004). „Nachlazení: Přehled literatury“. European Journal of Internal Medicine. 15 (2): 79–88. doi:10.1016 / j.ejim.2004.01.006. PMC  7125703. PMID  15172021.
  16. ^ Van Der Hoek, L (2007). „Lidské koronaviry: Co způsobují?“. Antivirová terapie. 12 (4 Pt B): 651–8. PMID  17944272.
  17. ^ Kissler, Stephen M. (14. dubna 2020). „Promítání přenosové dynamiky SARS-CoV-2 během postpandemického období“. Věda: eabb5793. doi:10.1126 / science.abb5793. PMC  7164482. PMID  32291278.CS1 maint: datum a rok (odkaz)

externí odkazy