Lidský koronavirus NL63 - Human coronavirus NL63

Lidský koronavirus NL63
12985 2013 2210 MOESM6 ESM E.tif
Transmisní elektronový mikrofotografie HCoV-NL63
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Pisuviricota
Třída:Pisoniviricetes
Objednat:Nidovirales
Rodina:Coronaviridae
Rod:Alfacoronavirus
Podrod:Setracovirus
Druh:
Lidský koronavirus NL63

Lidský koronavirus NL63 (HCoV-NL63) je druh koronavirus, konkrétně a Setracovirus z řad Alfacoronavirus rod. Bylo zjištěno na konci roku 2004 u sedmiměsíčního dítěte s bronchiolitida V Nizozemsku.[1] Virus je obaleno, pozitivní smysl, jednovláknové RNA virus který vstupuje do své hostitelské buňky vazbou na ACE2.[2][3] Infekce virem byla potvrzena po celém světě a má souvislost s mnoha běžnými příznaky a chorobami. Přidružená onemocnění zahrnují mírné až středně závažné onemocnění infekce horních cest dýchacích, těžké infekce dolních dýchacích cest, záď a bronchiolitida.[1]

Virus se vyskytuje především u malých dětí, starších lidí a imunokompromitovaný pacienti s akutním respiračním onemocněním. Má také sezónní sdružení v mírné podnebí. Studie provedená v Amsterdamu odhadovala přítomnost HCoV-NL63 u přibližně 4,7% běžných respiračních onemocnění.[4] Virus pochází z infikovaných palmové cibety a netopýři.[5] Odhady jeho odchylky od jiného koronaviru (HCoV-229E) jsou zhruba před 1000 lety: pravděpodobně cirkuluje u lidí po celá staletí.[6]

Zdá se, že vývoj HCoV-NL63 zahrnoval rekombinace mezi předky NL63 jako virus cirkulující dovnitř African Triaenops afer netopýrů a a CoV 229E jako virus cirkulující dovnitř Hipposideros netopýři.[7] Rekombinantní viry mohou vzniknout, když jsou dva virové genomy jsou přítomny ve stejné hostitelské buňce.

Příznaky

První případy infekce HCoV-NL63 byly zjištěny u malých dětí s těžkými infekcemi dolních dýchacích cest přijatými do nemocnic. I když klinický obraz viru může být závažný, byl nalezen také v mírných případech infekce dýchacích cest. The komorbidita HCoV-NL63 s jinými respiračními infekcemi znesnadnilo přesné určení konkrétních příznaků viru. Studie klinických příznaků u pacientů s HCoV-NL63 bez sekundární infekce hlášeny nejčastější příznaky jako horečka, kašel, rýma, bolest v krku, chrapot, bronchitida, bronchiolitida, zápal plic, a záď. Raná studie zkoumající děti s onemocněním dolních dýchacích cest zjistila, že HCoV-NL63 se častěji vyskytoval u ambulantních pacientů než u hospitalizovaných pacientů, což naznačuje, že se jedná o běžný vir nachlazení podobný HCoV-229E a HCoV-OC43, které obecně způsobují méně závažné příznaky.[8] Vysoká frekvence však záď je specifická pro infekci HCoV-NL63.

Způsobit

Sezónní distribuce HCoV-NL63 ukazuje preferenční detekci v období od listopadu do března

Předpokládá se, že cestou šíření HCoV-NL63 je přímý přenos z jednoho člověka na druhého ve vysoce obydlených oblastech. Virus může přežít až týden mimo tělo vodní roztoky při pokojové teplotě a tři hodiny na suchém povrchu.[9] Většina lidí bude během svého života infikována koronavirem, ale některé populace jsou náchylnější k HCoV-NL63. Mezi tyto populace patří děti do 5 let, starší lidé a imunokompromitovaný Jednotlivci. Zdá se, že virus má sezónní výskyt, který se nejčastěji vyskytuje v zimních měsících v roce mírné podnebí. V extrémnějších a tropické podnebí virus nemá žádnou preferenci vůči konkrétní sezóně. Mnoho studií uvádí společný výskyt HCoV-NL63 s jinými lidský koronavirus, Virus chřipky A., Lidský ortopneumovirus (RSV), virus parainfluenzy, a Lidský metapneumovirus (hMPV).[1]

Mechanismus

Přenos HCoV-NL63 je pravděpodobný prostřednictvím vylučování kapiček z dýchací trakt, které mohou být přenášeny vzduchem nebo šířeny blízkým osobním kontaktem. Virus je schopen přežít až sedm dní v respiračním sekretu a zůstává infekční při pokojové teplotě.[10] Jakmile virus vstoupí do hostitele, ke kterému se váže buněčné receptory použitím spike proteiny, podobné těm, které najdete v HIV-1. Virus je schopen použít Enzym převádějící angiotensin 2 (ACE2) jako vstupní receptor, který se váže na cílové buňky a vstupuje do nich.[10] Nebylo dokončeno stanovení specifického vstupu viru do hostitelské buňky. Proto je vstup do buňky buď přímý buněčná fúze s plazmatická membrána nebo endocytóza následuje fúze s membránou. Kvůli nedostatku a cDNA klon HCoV-NL63, výzkum replikačního cyklu je omezený. Protože je to pozitivní jednovláknový RNA virus, procesy replikace prostřednictvím transkripce a překlad lze provádět v cytoplazma infikované buňky.

Diagnóza

Je obtížné rozlišit mezi příznaky způsobenými infekcí virem HCoV-NL63 a příznaky způsobenými jinými běžnými lidskými viry, což činí diagnostiku a detekci složitou. Reverzní transkripční polymerázová řetězová reakce vzorků odebraných prostřednictvím výtěr z nosohltanu je nejčastěji používanou metodou detekce viru.[1] Virová kultura nebo krevní sérum testování pro protilátky lze také použít k potvrzení infekce.

Prevence

Spojené státy Centra pro kontrolu a prevenci nemocí (CDC) doporučuje několik opatření k prevenci infekce HCoV-NL63, včetně: častého mytí rukou mýdlem a vodou, vyhýbání se blízkému kontaktu s nemocnými jedinci a nedotýkání se očí, úst nebo nosu.[11]

Léčba a prognóza

Léčba viru HCoV-NL63 závisí na závažnosti přidruženého symptomologie. Většina mírných až středně závažných infekcí sama odezní. Příznaky lze zmírnit užíváním léků proti bolesti nebo horečce, horkou sprchou nebo použitím a zvlhčovač. Antivirové léčba může být nezbytná pro infikované pacienty, kteří skončí v jednotka intenzivní péče (JIP) kvůli akutní respirační infekce. Intravenózní imunoglobulin je FDA schválený inhibitor HCoV-NL63, který se také používá k léčbě primární imunitní nedostatečnost, RSV, a Kawasakiho choroba.[4]

Virologie

HCoV-NL63 je jedním ze sedmi známých koronavirů infikujících člověka. Dalších šest je:[12]

Nedávný výzkum

Nedávno[když? ] údaje naznačují asociaci HCoV-NL63 infekce Kawasakiho choroba, systémový vaskulitida v dětství, které mohou mít za následek aneuryzma z Koronární tepny. V rozvinutém světě je Kawasakiho choroba nejčastější příčinou získaných srdeční choroba u dětí.[13] Další analýza HCoV-NL63 patogenita se zdá oprávněná, zejména kvůli nedávným důkazům, že tento virus používá stejné buněčný receptor tak jako SARS-CoV (ACE2 ).[10] HCoV-NL63 byl také nalezen v střevní trakt infikovaných jedinců a související s gastroenteritida.[14] Tento typ infekce je přímým důsledkem virové invaze slizniční podšívka střev. Role HCoV-NL63 v gastroenteritida je nejasný kvůli typické koinfekce s jinými viry v tomto stavu. HCoV-NL63 je pravděpodobně nedostatečně detekován kvůli své roli v mnoha mírných až středně závažných respiračních infekcích a komorbiditě s jinými nemocemi. Vědci navrhli, že ke stanovení účinků tohoto viru na systémy mimo dýchací cesty jsou nezbytné komplexnější populační studie.

Reference

  1. ^ A b C d Abdul-Rasool S, Fielding BC (květen 2010). „Porozumění lidskému koronaviru HCoV-NL63“. The Open Virology Journal. 4: 76–84. doi:10.2174/1874357901004010076. PMC  2918871. PMID  20700397.
  2. ^ „ACE2 angiotenzin I konvertující enzym 2 - gen“. NCBI. 2020-02-28. Citováno 2020-03-21. Protein kódovaný tímto genem patří do rodiny enzymů konvertujících angiotensin dipeptidylkarboxydipeptidáz a má značnou homologii s lidským enzymem konvertujícím angiotensin 1. Tento vylučovaný protein katalyzuje štěpení angiotensinu I na angiotensin 1-9 a angiotensinu II na vazodilatátor angiotensin 1-7. Organicky a buněčně specifická exprese tohoto genu naznačuje, že může hrát roli při regulaci kardiovaskulárních a renálních funkcí i plodnosti. Kromě toho je kódovaný protein funkčním receptorem pro špičatý glykoprotein lidského koronaviru HCoV-NL63 a lidského koronaviru pro těžký akutní respirační syndrom, SARS-CoV a SARS-CoV-2 (virus COVID-19).
  3. ^ Fehr AR, Perlman S (2015). Maier HJ, Bickerton E, Britton P (eds.). „Koronaviry: přehled jejich replikace a patogeneze“. Metody v molekulární biologii. Springer. 1282: 1–23. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN  978-1-4939-2438-7. PMC  4369385. PMID  25720466.
  4. ^ A b van der Hoek L, Pyrc K, Berkhout B (září 2006). „Lidský koronavirus NL63, nový respirační virus“. Recenze mikrobiologie FEMS. 30 (5): 760–73. doi:10.1111 / j.1574-6976.2006.00032.x. PMID  16911043.
  5. ^ Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P .; Liu, Ding Xiang (2016-07-25). „Lidské koronaviry: přehled interakcí mezi viry a hostiteli“. Nemoci. 4 (3): 26. doi:10,3390 / nemoci4030026. ISSN  2079-9721. PMC  5456285. PMID  28933406. Viz tabulka 1.
  6. ^ Pyrc, K (2006). „Mozaiková struktura lidského koronaviru NL63, tisíc let evoluce“. J. Mol. Biol. 364: 964–973. ISSN  0022-2836.
  7. ^ Tao Y, Shi M, Chommanard C, královna K, Zhang J, Markotter W, Kuzmin IV, Holmes EC, Tong S. Sledování netopýří koronavirů v Keni identifikuje příbuzné lidských koronavirů NL63 a 229E a jejich historii rekombinací. J Virol. 14. února 2017; 91 (5): e01953-16. doi: 10.1128 / JVI.01953-16. Tisk 2017 1. března PMID: 28077633
  8. ^ van der Hoek L, Berkhout B (červenec 2005). „Otázky týkající se koronaviru New Haven“. The Journal of Infectious Diseases. 192 (2): 350–1, odpověď autora 353–4. doi:10.1086/430795. PMID  15962232.
  9. ^ "Lidský koronavirus". Kanadská agentura pro veřejné zdraví. 2011-08-19. Citováno 22. července 2015.
  10. ^ A b C Hofmann H, Pyrc K, van der Hoek L, Geier M, Berkhout B, Pöhlmann S (květen 2005). „Lidský koronavirus NL63 využívá pro vstup buněk receptor koronaviru pro těžký akutní respirační syndrom“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (22): 7988–93. Bibcode:2005PNAS..102,7988H. doi:10.1073 / pnas.0409465102. PMC  1142358. PMID  15897467.
  11. ^ "O koronaviru". Centrum pro kontrolu nemocí. Citováno 22. července 2015.
  12. ^ Leung, Daniel. „Koronaviry (včetně SARS)“. Poradce pro infekční nemoci. Podpora rozhodování v medicíně, LLC. Citováno 1. srpna 2020.
  13. ^ "Kawasakiho choroba". Klinika Mayo. Citováno 22. července 2015.
  14. ^ Fielding BC (únor 2011). „Lidský koronavirus NL63: klinicky důležitý virus?“. Budoucí mikrobiologie. 6 (2): 153–9. doi:10,2217 / fmb.10.166. PMID  21366416.

externí odkazy