Bakteriovorax - Bacteriovorax

Bakteriovorax
Vědecká klasifikace Upravit
Doména:Bakterie
Kmen:Proteobakterie
Třída:Oligoflexie
Objednat:Bdellovibrionales
Rodina:Bacteriovoracaceae
Rod:Bakteriovorax
Druh:
B. stolpii
Binomické jméno
Bacteriovorax stolpii
(Seidler a kol. 1972) Baer a kol. 2000[1]
Synonyma
  • Bdellovibrio stolpii Seidler a kol.
  • Bacteriolyticum stolpii Piñeiro a kol. 2008

Bakteriovorax je rod obsahující jediný druh bakterie v rodině Bacteriovoracaceae, Bacteriovorax stolpii. Je to dravec, který se živí většími Gramnegativní bakterie.[2] Tyto bakterie kořisti mají tendenci žít střevní prostředí a mají podobné lipopolysacharid struktur.[3] Bacteriovorax stolpii rozpoznává svou kořist proteinem vnější membrány receptory, což vysvětluje proč Grampozitivní bakterie, kterým chybí vnější membrány, neslouží jako kořist.[3] Živí se bakteriemi tím, že napadají interperiplazmatický prostor, kde se živí, rostou a množí se.[3] Bacteriovorax stolpii býval klasifikovaný v rodu Bdellovibrio kvůli podobnému morfologie a charakteristikami životního stylu, nicméně byly poznávány jako nový rod fylogenetické analýza.[4]

Vlastnosti

Rody Bakteriovorax a Bdellovibrio sdílejí četné morfologické a životní charakteristiky.[3] Bakteriovorax a podobné rody jsou rozpoznávány podle jejich přítomnosti sfingolipidů, které nejsou v prokaryotech široce distribuovány.[2] Bacteriovorax stolpii je známý pro přítomnost sfingofosfonolipidů ve svých membránách.[2] Velikost genomu rodu Bakteriovorax bylo zaznamenáno od 2,0–2,6 Mb.[3] Bakteriovorax je pouze dravá vůči gramnegativním bakteriím, i když byly nalezeny ve střevech lidí.[3] Bakteriovorax a Bdellovibrio jsou přibližně 0,2-0,4 x 0,5-1,4 μm, jsou aerobní, s kyslíkem jako terminálním akceptorem elektronů a jsou mezofilní.[3] Vykazují typickou gramnegativní morfologii a jsou pohyblivé jediným, polárním, opláštěným bičíkem.[3]

Dějiny

Popis Bacteriovorax stolpii je založen na původním popisu Seidler et al.[5] Kmen Uki2T je jediný izolát popsaný v tomto okamžiku a je typovým kmenem Bacteriovorax stolpii.[4] Tento izolát má obsah GC 41 ± 8% mol.[5] Optimální teplotní rozsah pro růst tohoto organismu je 15–35 ° C. Hlavní buněčné mastné kyseliny jsou 5: 1 co8c13: 0 a 13: 0iso.[6] Uki2T je citlivý na většinu testovaných antibiotik (penicilin, streptomycin, neomycin, kanamycin, gentamicin, methicilin, kyselina nalidixová, pteridin 0/129 a vankomycin).[6]

Životní cyklus

Členové Bakteriovorax vykazují stejné obecné morfologické znaky a rysy životního cyklu, jaké byly popsány pro tento rod Bdellovibrio.[3] Kromě toho členové tohoto rodu vykazují dvoufázový životní cyklus s potenciálem zobrazování aktivně predátorské formy a také PI (predátorská nezávislá), saprofytická forma schopná růstu na živném médiu. Kmeny závislé na kořisti (divokého typu) jsou tyčinky ve tvaru čárky o délce 0 ± 5–1 ± 4 µm, které prokazují predátorský životní styl v přítomnosti náchylných bakterií kořisti. Kmeny divokého typu jsou pohyblivé jediným polárním bičíkem. Buňky PI (mutanti) jsou pleomorfní, což dokazuje řadu buněčných tvarů od jednoduchých prutů po dlouhé, pevně spirálovité buňky.[4]

Reklasifikace

Většina bakterií, které se živí gramnegativními bakteriemi, byla v rodu spojena dohromady Bdellovibrio.[4] To bylo provedeno bez ohledu na jejich izolaci z různých stanovišť a neprozkoumanou fylogenetickou příbuznost.[4] Dříve široký rod zahrnoval rozdíly v toleranci chloridu sodného a% obsahu G + C.[3] Bacteriovorax stolpii a Bacteriovorax starrii byly srovnávány s Bdellovibrio bakteriovorus, modelová bakterie pro svůj rod, za použití 16S rDNA sekvencí a analýz.[4] Mezi nimi byla pouze 81,7% podobnost 16S rDNA sekvence Bdellovibrio bakteriovorus a Bacteriovorax stolpii.[3] Hybridizace DNA-DNA také poskytla mezi druhy pouze <4% hybridizaci.[4] Na základě těchto nálezů rod Bakteriovorax byl vytvořen a Bacteriovorax stolpii a Bacteriovorax starrii přestěhoval se do toho.[4] V roce 2015 Bacteriovorax marinus a Bacteriovorax litoralis byly překlasifikovány na Halobacteriovorax odchází B. stolpii jako jediný druh rodu.[7]

Reference

  1. ^ Parte, A.C. "Bacteriovorax". LPSN.
  2. ^ A b C Jayasimhulu, K .; Hunt, S.M .; Kaneshiro, E.S .; Watanabe, Y .; Giner, J.L. (2007). "Detekce a identifikace Bacteriovorax stolpii UKi2 Sphingophosphonolipid Molecular Species ". Journal of the American Society for Mass Spectrometry. 18 (3): 394–403. doi:10.1016 / j.jasms.2006.10.014. PMID  17123828.
  3. ^ A b C d E F G h i j k Bergey, D.H .; Brenner, D.J .; Krieg, N.R .; Staley, J.T. (2005). Bergeyho příručka systematické bakteriologie. Svazek 2. Proteobakterie. Část C. Alfa-, Beta-, Delta- a Epsilonproteobakterie. New York, NY: Springer. str. 1053–7.
  4. ^ A b C d E F G h Baer, ​​Marcie L .; Jacques Ravel a Jongsik Chun (2000). „Návrh na reklasifikaci Bdellovibrio Stolpii a Bdellovibrio Starrii do nového rodu, Bacteriovorax Gen. Nov. jako Bacteriovorax Stolpii Comb. Nov. a Bacteriovorax Starrii Comb. Nov.. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50 (1): 219–24. doi:10.1099/00207713-50-1-219. PMID  10826807.
  5. ^ A b Althauser, M .; Samsonoff, W. A .; Anderson, C. & Conti, S. F. (1972). "Izolace a předběžná charakterizace bakteriofágů pro Bdellovibrio bakteriovorus". J Virol. 10 (3): 516–23. doi:10.1128 / JVI.10.3.516-523.1972. PMC  356493. PMID  4116140.
  6. ^ A b Guether, D. L., Osterhout, G. J., Dick, J. D. & Williams, H. N. (1993). Analýza složení mastných kyselin izolátů Bdellovibrio. Abstrakt Q-243 představený na 93. valné hromadě Americké společnosti pro mikrobiologii, Atlanta, Georgia, USA.
  7. ^ Koval, S. F .; Williams, H. N .; Stine, O. C. (2015). "Reklasifikace Bacteriovorax marinus as Halobacteriovorax marinus gen. nov., hřeben. Listopad A Bacteriovorax litoralis jako Halobacteriovorax litoralis comb. Listopad.; popis Halobacteriovoraceae fam. Listopad Ve třídě Deltaproteobacteria ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 65 (Pt 2): 593–597. doi:10.1099 / ijs.0.070201-0. PMC  4811658. PMID  25406234.

externí odkazy