D-Ala-D-Ala dipeptidáza - D-Ala-D-Ala dipeptidase - Wikipedia

D-Ala-D-Ala dipeptidáza
Identifikátory
EC číslo3.4.13.22
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum

D-Ala-D-Ala dipeptidáza (ES 3.4.13.22, D-alanyl-D-alanin dipeptidáza, vanX D-Ala-D-Ala dipeptidáza, VanX) je enzym.[1][2][3][4][5][6] Tento enzym katalýzy následující chemická reakce

D-Ala-D-Ala + H20 2 D-Ala

Tento enzym je Zn2+-závislý.

Reference

  1. ^ Reynolds PE, Depardieu F, Dutka-Malen S, Arthur M, Courvalin P (září 1994). „Glykopeptidová rezistence zprostředkovaná enterokokovým transpozonem Tn1546 vyžaduje produkci VanX pro hydrolýzu D-alanyl-D-alaninu“. Molekulární mikrobiologie. 13 (6): 1065–70. doi:10.1111 / j.1365-2958.1994.tb00497.x. PMID  7854121.
  2. ^ Wu Z, Wright GD, Walsh CT (únor 1995). „Nadměrná exprese, čištění a charakterizace VanX, D-, D-dipeptidázy, která je nezbytná pro rezistenci na vankomycin u Enterococcus faecium BM4147“. Biochemie. 34 (8): 2455–63. doi:10.1021 / bi00008a008. PMID  7873524.
  3. ^ McCafferty DG, Lessard IA, Walsh CT (srpen 1997). „Mutační analýza potenciálních zbytků vázajících zinek v aktivním místě enterokokové D-Ala-D-Ala dipeptidázy VanX“. Biochemie. 36 (34): 10498–505. doi:10.1021 / bi970543u. PMID  9265630.
  4. ^ Bussiere DE, Pratt SD, Katz L, Severin JM, Holzman T, Park CH (červenec 1998). „Struktura VanX odhaluje novou amino-dipeptidázu zapojenou do zprostředkování rezistence na vankomycin na bázi transposonu“. Molekulární buňka. 2 (1): 75–84. doi:10.1016 / s1097-2765 (00) 80115-x. PMID  9702193.
  5. ^ Tan AL, Loke P, Sim TS (2002). "Molekulární klonování a funkční charakterizace VanX, D-alanyl-D-alanin dipeptidázy ze Streptomyces coelicolor A3 (2)". Výzkum v mikrobiologii. 153 (1): 27–32. doi:10.1016 / s0923-2508 (01) 01282-7. PMID  11881895.
  6. ^ Matthews ML, Periyannan G, Hajdin C, Sidgel TK, Bennett B, Crowder MW (říjen 2006). „Zkoumání reakčního mechanismu D-ala-D-ala dipeptidázy, VanX, pomocí kinetických studií zastaveného toku a rychlého zmrazení EPR na enzymu substituovaném Co (II)“. Journal of the American Chemical Society. 128 (40): 13050–1. doi:10.1021 / ja0627343. PMC  2547881. PMID  17017774.

externí odkazy