Bifidobacteriaceae - Bifidobacteriaceae

Bifidobacteriaceae
Bifidobacterium adolescentis
Bifidobacterium adolescentis
Vědecká klasifikace E
Doména:Bakterie
Kmen:Aktinobakterie
Třída:Aktinobakterie
Objednat:Bifidobacteriales
Rodina:Bifidobacteriaceae
Stackebrandt et al. 1997 vychází. Zhi a kol. 2009
Rody

The Bifidobacteriaceae jsou jediní rodina z bakterie,[1] v objednat z Bifidobacteriales. Podle 16S rRNA -na základě LTP vydání 106 vydané nakladatelstvím Projekt „All-Species Living Tree“, objednávka Bifidobacteriales je subtyp vnořený do podřádu Micrococcineae, také rod Bifidobacterium je paraphyletic k ostatním rodům v rodině, tj. ostatní rody jsou vnořeny uvnitř Bifidobacterium.

Fylogeneze

Aktuálně přijímaná taxonomie je založena na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN)[2] a Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI)[3] a fylogeneze je založena na 16S rRNA LTP uvolněte 106 o Projekt „All-Species Living Tree“.[4]

 
 

?B. actinocoloniiforme Killer a kol. 2011

 
 

?B. bohemicum Killer a kol. 2011

 
 

?B. bombi Killer a kol. 2009

 
 

?B. cuniculi Scardovi a kol. 1979

 
 

?B. kashiwanohense Morita a kol. 2011

 
 

?B. thermophilum Mitsuoka 1969

 
 

?B. coagulans ♠ Killer a kol. 2007

 
 

?B. crudilactis ♠ Delcenserie et al. 2007

 
 

?B. simiae ♠ Falsen a kol. 2001

 
 
 

B. mongoliense Watanabe a kol. 2009

 
 

B. psychraerophilum Simpson a kol. 2004

 
 
 
 

B. minimum Biavati a kol. 1982

 
 
 
 
 
 

B. catenulatum Scardovi a Crociani 1974

 
 

B. pseudocatenulatum Scardovi a kol. 1979

 
 
 
 

B. angulatum Scardovi a Crociani 1974

 
 

B. merycicum Biavati a Mattarelli 1991

 
 
 
 
 

B. dentium Scardovi a Crociani 1974

 
 
 

B. ruminantium Biavati a Mattarelli 1991

 
 
 

B. adolescentis Reuter 1963

 
 

B. stercoris Kim a kol. 2010

 
 
 
 
 
 
 

B. scardovii Hoyles a kol. 2002

 
 
 

B. bifidum (Tissier 1900) Orla-Jensen 1924

 
 
 
 

B. subtilní Biavati a kol. 1982

 
 

Gardnerella vaginalis (Gardner a Dukes 1955) Greenwood a Pickett 1980

 
 
 
 
 

B. breve Reuter 1963

 
 B. longum
 

B. l. infantis (Reuter 1963) Mattarelli a kol. 2008

 
 
 

B. l. longum (Reuter 1963) Mattarelli a kol. 2008

 
 

B. l. suis (Matteuzzi et al. 1971) Mattarelli et al. 2008

 
 
 
 
 
 
 

B. pullorum Trovatelli a kol. 1974

 
 
 

B. gallinarum Watabe a kol. 1983

 
 

B. saeculare Biavati a kol. 1992

 
 
 
 
 
 

B. galicum Lauer 1990

 
 
 

B. magnum Scardovi a Zani 1974

 
 
 B. pseudolongum
 

B. str. globosum (Biavati et al. 1982) Yaeshima et al. 1992

 
 

B. str. pseudolongum (Mitsuoka 1969) Yaeshima et al. 1992

 
 
 
 

B. choerinum Scardovi a kol. 1979

 
 B. animalis
 

B. a. animalis (Mitsuoka 1969) Masco a kol. 2004

 
 

B. a. lactis (Meile et al. 1997) Masco et al. 2004

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

B. boum Scardovi a kol. 1979

 
 B. thermacidophilum
 

B. t. porcinum Zhu a kol. 2003

 
 

B. t. thermacidophilum (Dong et al. 2000) Zhu et al. 2003

 
 
 
 
 

B. asteroidy Scardovi a Trovatelli 1969

 
 
 

B. coryneforme (ex Scardovi a Trovatelli 1969) Biavati et al. 1982

 
 

B. indicum Scardovi a Trovatelli 1969

 
 
 
 
 
 

B. tsurumiense Okamoto a kol. 2008

 
 
 

Aeriscardovia aeriphila Simpson a kol. 2004

 
 
 
 

Alloscardovia omnicolens Huys a kol. 2007

 
 

Metascardovia criceti Okamoto a kol. 2007

 
 
 
 

Parascardovia denticolens (Crociani et al. 1996) Jian a Dong 2002

 
 Scardovia
 

S. inopinata (Crociani et al. 1996) Jian a Dong 2002 vznikají. Downes a kol. 2011

 
 

S. wiggsiae Downes a kol. 2011

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Poznámky:
♠ Kmeny nalezené na Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI), ale není uveden v seznamu Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN)

Reference

  1. ^ Mantzourani M, Fenlon M, Beighton D (únor 2009). "Souvislost mezi Bifidobacteriaceae a klinickou závažností lézí kořenového kazu". Perorální mikrobiol. Immunol. 24 (1): 32–7. doi:10.1111 / j.1399-302X.2008.00470.x. PMID  19121067.
  2. ^ J.P.Euzéby. "Bifidobacteriaceae". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Archivovány od originál dne 27.01.2013. Citováno 2011-11-17.
  3. ^ Sayers; et al. "Bifidobacteriaceae". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2011-06-05.
  4. ^ Projekt „All-Species Living Tree“.„Vydání LTP založené na 16S rRNA 106 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 2011-11-17.

externí odkazy