Alantoikáza - Allantoicase
| alantoikáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 3.5.3.4 | ||||||||
| Číslo CAS | 9025-21-2 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Alantoikáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 struktura alantoikázy | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Alantoikáza | ||||||||
| Pfam | PF03561 | ||||||||
| Pfam klan | CL0202 | ||||||||
| InterPro | IPR015908 | ||||||||
| SCOP2 | 1sg3 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Alantoikáza je enzym (ES 3.5.3.4 ), který je u lidí kódován ALLC gen. Alantoikáza katalyzuje the chemická reakce
- alantoát + H2Ó (S) -ureidoglykolát + močovina
Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou alantoát a H2Ó, zatímco jeho dva produkty jsou (S) -ureidoglykolát a močovina.
Tento enzym patří do rodiny hydrolázy, ty, které působí na vazby uhlík-dusík jiné než peptidové vazby, konkrétně v lineárních amidinách. The systematické jméno této třídy enzymů je alantoát amidinohydroláza. Tento enzym se účastní metabolismus purinů usnadněním využití puriny jako sekundární dusík zdroje za podmínek omezujících dusík. Zatímco degradace purinu konverguje k kyselina močová celkově obratlovců, jeho další degradace se u jednotlivých druhů liší. Kyselina močová je vylučována ptáky, plazy a některými savci které nemají funkční gen urikázy, zatímco jiné savci produkují alantoin. Obojživelníci a mikroorganismy produkují amoniak a oxid uhličitý pomocí urikolytické cesty. Allantoikáza provádí druhý krok v této cestě katalyzující přeměna alantoátu na ureidoglykolát a močovinu.
Strukturální studie
Ke konci roku 2007 dva struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1O59 a 1SG3.
The struktura alantoikázy je nejlépe popsat jako složený ze dvou opakování (alantoikáza se opakuje: AR1 a AR2), které jsou spojeny flexibilním linkerem. Krystalová struktura, rozlišená při rozlišení 2,4 A, ukazuje, že AR1 má velmi podobné složit na AR2, obě repetice jsou motivy želé, složené ze čtyřvláknových a pětvláknových antiparalelní beta-listy.[1] Každý motiv želé má dvě konzervované povrchové skvrny, které pravděpodobně tvoří Aktivní stránky.[2]
Reference
- ^ Xu Q, Schwarzenbacher R, Page R, Sims E, Abdubek P, Ambing E, Biorac T, Brinen LS, Cambell J, Canaves JM, Chiu HJ, Dai X, Deacon AM, DiDonato M, Elsliger MA, Floyd R, Godzik A , Grittini C, Grzechnik SK, Hampton E, Jaroszewski L, Karlak C, Klock HE, Koesema E, Kovarik JS, Kreusch A, Kuhn P, Lesley SA, Levin I, McMullan D, McPhillips TM, Miller MD, Morse A, Moy K, Ouyang J, Quijano K, Reyes R, Rezezadeh F, Robb A, Spraggon G, Stevens RC, van den Bedem H, Velasquez J, Vincent J, von Delft F, Wang X, West B, Wolf G, Hodgson KO, Wooley J, Wilson IA (srpen 2004). "Krystalová struktura alantoikázy (YIR029W) ze Saccharomyces cerevisiae v rozlišení 2,4 A". Proteiny. 56 (3): 619–24. doi:10.1002 / prot.20164. PMID 15229895. S2CID 5688375.
- ^ Leulliot N, Quevillon-Cheruel S, Sorel I, Graille M, Meyer P, Liger D, Blondeau K, Janin J, van Tilbeurgh H (květen 2004). „Krystalová struktura kvasinkové alantoikázy odhaluje opakovaný motiv želé rolky“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (22): 23447–52. doi:10,1074 / jbc.M401336200. PMID 15020593.
Další čtení
- Florin M, Duchateau-Bosson G (1940). „Microdosage photometrique de l'allantoine en solutions pures et dans l'urine“. Enzymologia. 9: 5–9.
- Trijbels F, Vogels GD (květen 1966). "Allantoicase a ureidoglycolase u druhů Pseudomonas a Penicillium". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Enzymologie a biologická oxidace. 118 (2): 387–95. doi:10.1016 / S0926-6593 (66) 80047-4. PMID 4960174.
- Hildebrand F, van Griensven M, Giannoudis P, Schreiber T, Frink M, Probst C, Grotz M, Krettek C, Pape HC (2005). "Dopad hypotermie na imunologickou odpověď po traumatu a plánované operaci". Surgical Technology International. 14: 41–50. PMID 16525953.
- Gravenmade EJ, Vogels GD, Van der Drift C (březen 1970). "Hydrolýza, racemizace a absolutní konfigurace ureidoglykolátu, substrátu alantoikázy". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Enzymologie. 198 (3): 569–82. doi:10.1016/0005-2744(70)90134-8. PMID 4314237.
