APOBEC3F - APOBEC3F
DNA dC-> dU-editující enzym APOBEC-3F je protein že u lidí je kódován APOBEC3F gen.[3][4][5]
Tento gen je členem cytidindeamináza genová rodina. Je to jeden ze sedmi příbuzných genů nebo pseudogeny nalezen v a shluk, myslel, že bude výsledkem genová duplikace, na chromozom 22. Členové klastru kódují proteiny, které jsou strukturálně a funkčně příbuzné C až U RNA - úprava cytidindeaminázy APOBEC1. Předpokládá se, že proteiny mohou být editovány RNA enzymy a mít role v růstu nebo řízení buněčného cyklu. Alternativně sestříhané přepis varianty kódování různé izoformy byl identifikován.[5]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128394 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Jarmuz A, Chester A, Bayliss J, Gisbourne J, Dunham I, Scott J, Navaratnam N (únor 2002). „Antropoidně specifický lokus sirotků C až U RNA-editujících enzymů na chromozomu 22“. Genomika. 79 (3): 285–96. doi:10.1006 / geno.2002.6718. PMID 11863358.
- ^ Holmes RK, Koning FA, Bishop KN, Malim MH (leden 2007). "APOBEC3F může inhibovat akumulaci produktů reverzní transkripce HIV-1 při absenci hypermutace. Srovnání s APOBEC3G". J Biol Chem. 282 (4): 2587–95. doi:10,1074 / jbc.M607298200. PMID 17121840.
- ^ A b "Entrez Gene: APOBEC3F apolipoprotein B mRNA editační enzym, katalytický polypeptid podobný 3F".
externí odkazy
- Člověk APOBEC3F umístění genomu a APOBEC3F stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Další čtení
- Wedekind JE, Dance GS, MP Sowden, Smith HC (2003). „Editace Messenger RNA u savců: noví členové rodiny APOBEC, kteří hledají role v rodinném podniku“. Trendy Genet. 19 (4): 207–16. doi:10.1016 / S0168-9525 (03) 00054-4. PMID 12683974.
- Franca R, Spadari S, Maga G (2006). „APOBEC deaminázy jako buněčné antivirové faktory: nový přirozený obranný mechanismus hostitele“. Med. Sci. Monit. 12 (5): RA92–8. PMID 16641889.
- Prashar Y, Weissman SM (1996). "Analýza diferenciální genové exprese zobrazením 3 'koncových restrikčních fragmentů cDNA". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (2): 659–63. Bibcode:1996PNAS ... 93..659P. doi:10.1073 / pnas.93.2.659. PMC 40108. PMID 8570611.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Dunham I, Shimizu N, Roe BA a kol. (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999 Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Zheng YH, Irwin D, Kurosu T a kol. (2004). „Lidský APOBEC3F je dalším hostitelským faktorem, který blokuje replikaci viru lidské imunodeficience typu 1“. J. Virol. 78 (11): 6073–6. doi:10.1128 / JVI.78.11.6073-6076.2004. PMC 415831. PMID 15141007.
- Wiegand HL, Doehle BP, Bogerd HP, Cullen BR (2004). „Druhý lidský antiretrovirový faktor, APOBEC3F, je potlačen proteiny Vif HIV-1 a HIV-2“. EMBO J.. 23 (12): 2451–8. doi:10.1038 / sj.emboj.7600246. PMC 423288. PMID 15152192.
- Liddament MT, Brown WL, Schumacher AJ, Harris RS (2004). "Vlastnosti APOBEC3F a preference hypermutace naznačují aktivitu proti HIV-1 in vivo". Curr. Biol. 14 (15): 1385–91. doi:10.1016 / j.cub.2004.06.050. PMID 15296757.
- Collins JE, Wright CL, Edwards CA a kol. (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Haché G, Liddament MT, Harris RS (2005). „Retrovirová hypermutační specificita APOBEC3F a APOBEC3G je řízena C-koncovou doménou DNA cytosindeaminázy“. J. Biol. Chem. 280 (12): 10920–4. doi:10,1074 / jbc.M500382200. PMID 15647250.
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- Zennou V, Bieniasz PD (2006). "Srovnávací analýza antiretrovirové aktivity APOBEC3G a APOBEC3F od primátů". Virologie. 349 (1): 31–40. doi:10.1016 / j.virol.2005.12.035. PMID 16460778.
- Tian C, Yu X, Zhang W a kol. (2006). „Diferenciální požadavek na konzervované tryptofany ve viru lidské imunodeficience typu 1 Vif pro selektivní potlačení APOBEC3G a APOBEC3F“. J. Virol. 80 (6): 3112–5. doi:10.1128 / JVI.80.6.3112-3115.2006. PMC 1395459. PMID 16501124.
- Stenglein MD, Harris RS (2006). „APOBEC3B a APOBEC3F inhibují retrotranspozici L1 mechanismem nezávislým na deaminaci DNA“. J. Biol. Chem. 281 (25): 16837–41. doi:10,1074 / jbc.M602367200. PMID 16648136.
- Wichroski MJ, Robb GB, Rana TM (2006). "Lidské retrovirové hostitelské restrikční faktory APOBEC3G a APOBEC3F se lokalizují do těl zpracovávajících mRNA". PLoS Pathog. 2 (5): e41. doi:10.1371 / journal.ppat.0020041. PMC 1458959. PMID 16699599.
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |