Těžký akutní respirační syndrom koronavirus - Severe acute respiratory syndrome coronavirus
Těžký akutní respirační syndrom koronavirus | |
---|---|
Obraz elektronového mikroskopu SARS virion | |
Klasifikace virů | |
(bez hodnocení): | Virus |
Oblast: | Riboviria |
Království: | Orthornavirae |
Kmen: | Pisuviricota |
Třída: | Pisoniviricetes |
Objednat: | Nidovirales |
Rodina: | Coronaviridae |
Rod: | Betacoronavirus |
Podrod: | Sarbecovirus |
Druh: | |
Kmen: | Těžký akutní respirační syndrom koronavirus |
Synonyma | |
|
Těžký akutní respirační syndrom koronavirus (SARS-CoV nebo SARS-CoV-1)[2] je kmen z virus to způsobuje vážný akutní syndrom dýchací soustavy (SARS).[3] Je to obaleno, pozitivní smysl, jednovláknové RNA virus který infikuje epitelové buňky v plicích.[4] Virus vstupuje do hostitelské buňky vazbou na enzym konvertující angiotensin 2.[5] Infikuje lidé, netopýři, a palmové cibety.[6][7]
Dne 16. dubna 2003 následující vypuknutí SARS v Asie a sekundární případy kdekoli na světě, Světová zdravotnická organizace (WHO) vydala tiskovou zprávu, že koronavirus identifikovaná řadou laboratoří byla oficiální příčinou SARS. The Centra pro kontrolu a prevenci nemocí (CDC) ve Spojených státech a Národní mikrobiologická laboratoř (NML) v Kanadě identifikoval SARS-CoV-1 genom v dubnu 2003.[8][9] Vědci na Erasmus University v Rotterdam Nizozemsko prokázalo, že koronavirus SARS splnil Kochovy postuláty čímž se potvrzuje jako původce. V experimentech makaků infikovaných virem se vyvinuly stejné příznaky jako u lidských obětí SARS.[10]
Podobný virus byl objeven v prosinci 2019. Tento virus, pojmenovaný Těžký akutní respirační syndrom koronavirus 2 (SARS-CoV-2) je původcem probíhajícího onemocnění Pandemie covid-19.[11]
SARS
Vážný akutní syndrom dýchací soustavy (SARS) je onemocnění způsobené SARS-CoV-1. Způsobuje často těžké onemocnění a je zpočátku poznamenán systémovými příznaky bolest svalů, bolest hlavy, a horečka následovaný nástupem respiračních příznaků za 2–14 dní,[12] hlavně kašel, dušnost, a zápal plic. Dalším častým nálezem u pacientů se SARS je pokles počtu lymfocytů cirkulujících v krvi.[13]
V epidemii SARS v roce 2003 zemřelo přibližně 9% pacientů s potvrzenou infekcí SARS-CoV-1.[14] Úmrtnost byla mnohem vyšší u osob starších 60 let, přičemž u této podskupiny pacientů se úmrtnost blížila k 50%.[14]
Dějiny
Dne 17. března 2003 WHO vytvořila globální síť předních laboratoří pro spolupráci při identifikaci původce SARS. Laboratoře v síti zpočátku zúžily vyhledávání na členy paramyxovirus a rodiny koronavirů. První nálezy sdílené laboratořemi poukazovaly na koronaviry s rostoucí konzistencí. Dne 21. Března vědci z University of Hong Kong oznámila izolaci nového viru, u kterého bylo silně podezření, že je původcem SARS.[15]
Dne 12. Dubna vědci pracující v Centru genomových věd Michaela Smitha v Vancouver dokončeno mapování genetická sekvence koronaviru, o kterém se předpokládá, že je spojen se SARS. Tým vedl Marco Marra a pracoval ve spolupráci s Britská Kolumbie Centrum pro kontrolu nemocí a Národní mikrobiologická laboratoř v Winnipeg, Manitoba, pomocí vzorků od infikovaných pacientů v Toronto. Mapa, kterou WHO vítá jako důležitý krok vpřed v boji proti SARS, je sdílena s vědci po celém světě prostřednictvím webové stránky GSC (viz níže). Donald Low z Nemocnice Mount Sinai v Torontu popsal objev jako provedený „bezprecedentní rychlostí“.[16] Sekvence koronaviru SARS byla od té doby potvrzena jinými nezávislými skupinami.
Molekulární epidemiologie Výzkum prokázal, že se virus v jižní Číně vypukl v letech 2002–2003 a virus izolovaný ve stejné oblasti na konci roku 2003 a počátkem roku 2004 se ohniska liší, což naznačuje samostatné případy křížení druhů.[17] Fylogeneze kmenů ohniska nákazy ukazuje, že jihozápadní provincie včetně Yunnan, Guizhou a Guangxi jsou v porovnání s lidskými SARS-CoV-1 lepší než v ostatních provinciích, ale vývoj virů je výsledkem interakce a zvláštnosti hostitele.[18]
Na konci května 2003 byly provedeny studie vzorků divokých zvířat prodávaných jako potraviny na místním trhu v roce 2005 Guangdong V Číně zjistili, že lze izolovat kmen koronaviru SARS maskované palmové cibety (Paguma sp.), ale zvířata ne vždy vykazovala klinické příznaky. Předběžným závěrem bylo, že virus SARS překročil hranici xenografické bariéra od palmového cibetku k lidem a v provincii Kuang-tung bylo zabito více než 10 000 maskovaných palmových cibet. Virus byl také později nalezen v mývalí psi (Nyctereuteus sp.), fretčí jezevci (Melogale spp.) a domácí kočky. V roce 2005 dvě studie identifikovaly řadu koronavirů podobných SARS v čínštině netopýři.[19][20] Ačkoli se netopýr SARS virus nereplikoval v buněčné kultuře, v roce 2008 američtí vědci[21] změnil genetickou strukturu viru netopýra SARS s člověkem doména vázající receptor jak u netopýřího viru, tak u myší, které prokázaly, jak zoonóza může dojít v evoluci.[22]Fylogenetická analýza těchto virů ukázala vysokou pravděpodobnost, že koronavirus SARS vznikl u netopýrů a rozšířil se na člověka buď přímo, nebo prostřednictvím zvířat chovaných na čínských trzích. Netopýři nevykazovali žádné viditelné známky nemoci, ale jsou pravděpodobnými přirozenými rezervoáry koronavirů podobných SARS. Na konci roku 2006 vědci z Čínského střediska pro kontrolu a prevenci nemocí University of Hong Kong a Guangzhou Centrum pro kontrolu a prevenci nemocí vytvořilo genetickou souvislost mezi koronavirem SARS, který se objevuje u cibetek a lidí, a potvrzuje tvrzení, že virus přeskočil přes druhy.[23]
Virologie
SARS-CoV-1 se řídí strategií replikace typickou pro koronavirus podčeleď. Primárním lidským receptorem viru je enzym konvertující angiotensin 2 (ACE2) a hemaglutinin (HE),[24] poprvé identifikován v roce 2003.[25][26]
Zdá se, že lidská SARS-CoV-1 měla složitou historii rekombinace mezi předky koronaviry kteří byli hostováni v několika různých skupinách zvířat.[27][28] Aby k rekombinaci došlo alespoň se dvěma SARS-CoV-1 genomy musí být přítomen ve stejné hostitelské buňce. Rekombinace může nastat během replikace genomu, když RNA polymeráza přepíná z jedné šablony na druhou (kopírování volby rekombinace).[28]
SARS-CoV-1 je jedním ze sedmi známých koronavirů infikujících člověka. Dalších šest je:[29]
- Lidský koronavirus 229E (HCoV-229E)
- Lidský koronavirus NL63 (HCoV-NL63)
- Lidský koronavirus OC43 (HCoV-OC43)
- Lidský koronavirus HKU1 (HCoV-HKU1)
- Koronavirus související s respiračním syndromem na Středním východě (MERS-CoV)
- Těžký akutní respirační syndrom koronavirus 2 (SARS-CoV-2)
Ošetření
V současné době výzkum pokračuje.
Mezi příklady slibných terapií patří glycyrrhizin (lékořice ),[30][31][32][33] favipiravir atd.
Viz také
Poznámky
- ^ „Historie taxonomie ICTV: Koronavirus související s těžkým akutním respiračním syndromem". Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Citováno 2019-01-27.
- ^ Neeltje van Doremalen; Trenton Bushmaker; Dylan H. Morris; Myndi G. Holbrook; Amandine Gamble; Brandi N. Williamson; Azaibi Tamin; Jennifer L. Harcourt; Natalie J. Thornburg; Susan I. Gerber; James O. Lloyd-Smith; Emmie de Wit; Vincent J. Munster (2020-03-17). „Aerosol a povrchová stabilita SARS-CoV-2 ve srovnání s SARS-CoV-1“. The New England Journal of Medicine. 382 (16): 1564–1567. doi:10.1056 / NEJMc2004973. PMC 7121658. PMID 32182409.
- ^ Thiel, V., ed. (2007). Koronaviry: Molekulární a buněčná biologie (1. vyd.). Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-16-5.
- ^ Fehr, Anthony R .; Perlman, Stanley (2015). „Koronaviry: Přehled jejich replikace a patogeneze“. Koronaviry. Metody v molekulární biologii. 1282. Clifton, New Jersey, USA. s. 1–23. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN 978-1-4939-2437-0. ISSN 1064-3745. PMC 4369385. PMID 25720466.
SARS-CoV primárně infikuje epiteliální buňky v plicích. Virus je schopen proniknout do makrofágů a dendritických buněk, ale vede pouze k neúspěšné infekci [87,88].
- ^ Xing-Yi Ge; Jia-Lu Li; Xing-Lou Yang; et al. (2013). „Izolace a charakterizace netopýra podobného koronaviru podobnému SARS, který využívá receptor ACE2“. Příroda. 503 (7477): 535–538. Bibcode:2013Natur.503..535G. doi:10.1038 / příroda12711. PMC 5389864. PMID 24172901.
- ^ Wong, Antonio C. P .; Li, Xin; Lau, Susanna K. P .; Woo, Patrick C. Y. (2019-02-20). „Globální epidemiologie netopýrových koronavirů“. Viry. 11 (2): 174. doi:10,3390 / v11020174. ISSN 1999-4915. PMC 6409556. PMID 30791586.
Nejvýznamnější bylo zjištění, že netopýři podkováři byli rezervoárem CoV podobných SARS, zatímco kočky palmových cibet se považují za zprostředkujícího hostitele pro SARS-CoV [43,44,45].
- ^ Li, Fang (říjen 2013). "Rozpoznávání receptorů a mezidruhové infekce SARS koronaviru". Antivirový výzkum. 100 (1): 246–254. doi:10.1016 / j.antiviral.2013.08.014. ISSN 0166-3542. PMC 3840050. PMID 23994189.
Viz obrázek 6.
- ^ „Remembering SARS: A Deadly Puzzle and the Snacks to Solve It“. Centra pro kontrolu a prevenci nemocí. 11.04.2013. Archivováno od originálu 2013-08-01. Citováno 2013-08-03.
- ^ „Koronavirus, který u lidí dosud nebyl pozorován, je příčinou SARS“. Světová zdravotnická organizace OSN. 16. 04. 2006. Archivováno od původního dne 2004-08-12. Citováno 2006-07-05.
- ^ Fouchier, R. A .; Kuiken, T .; Schutten, M .; et al. (2003). "Etiologie: Kochovy postuláty splněny pro virus SARS". Příroda. 423 (6937): 240. Bibcode:2003 Natur.423..240F. doi:10.1038 / 423240a. PMC 7095368. PMID 12748632.
- ^ Lau, Susanna K. P .; Luk, Hayes K. H .; Wong, Antonio C. P .; Li, Kenneth S. M .; Zhu, Longchao; On, Zirong; Fung, Joshua; Chan, Tony T. Y .; Fung, Kitty S. C .; Woo, Patrick C. Y. (2020). „Možný původ netopýra se závažným akutním respiračním syndromem koronaviru 2 - svazek 26, číslo 7 - červenec 2020 - časopis Emerging Infection Diseases - CDC“. Emerg Infect Dis. 26 (7): 1542–1547. doi:10,3201 / eid2607.200092. PMC 7323513. PMID 32315281.
- ^ Chan-Yeung, M .; Xu, R. H. (listopad 2003). „SARS: epidemiologie“. Respirologie. Carlton, Victoria, USA. 8 (Suppl): S9 – S14. doi:10.1046 / j.1440-1843.2003.00518.x. PMC 7169193. PMID 15018127.
- ^ Yang, M .; Li, C. K .; Li, K .; Hon, K.L .; Ng, M. H .; Chan, P. K.; Fok, T. F. (srpen 2004). „Hematologické nálezy u pacientů se SARS a možné mechanismy“. International Journal of Molecular Medicine (Posouzení). 14 (2): 311–315. doi:10,3892 / ijmm.14.2.311. PMID 15254784. Archivováno od původního dne 2015-09-24.
- ^ A b Sørensen, M. D .; Sørensen, B .; Gonzalez-Dosal, R .; Melchjorsen, C. J .; Weibel, J .; Wang, J .; Jun, C. W .; Huanming, Y .; Kristensen, P. (květen 2006). „Těžký akutní respirační syndrom (SARS): vývoj diagnostiky a antivirotik“. Annals of the New York Academy of Sciences. 1067 (1): 500–505. Bibcode:2006NYASA1067..500S. doi:10.1196 / annals.1354.072. PMC 7167626. PMID 16804033.
- ^ „Těžký akutní respirační syndrom (SARS) - epidemie v několika zemích - aktualizace 12“. SZO. 2003-03-27.
- ^ „Laboratoř B.C. prolomila podezření na kód SARS. Kanada: CBC News. Dubna 2003. Archivováno z původního dne 26. 11. 2007.
- ^ Wang, Lin-Fa a kol. "Recenze netopýrů a SARS." Vznikající infekční nemoci sv. 12,12 (2006): 1834–40. Web National Library of Medicine doi: 10,3201 / eid1212.060401
- ^ Yu, Ping a kol. "Geografická struktura koronavirů souvisejících s netopýry SARS." Infekce, genetika a evoluce: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases sv. 69 (2019): 224–229. Web National Library of Medicine doi: 10.1016 / j.meegid.2019.02.001
- ^ Li, W .; Shi, Z .; Mňam.; et al. (2005). „Netopýři jsou přirozené nádrže koronavirů podobných SARS“. Věda. 310 (5748): 676–679. Bibcode:2005Sci ... 310..676L. doi:10.1126 / science.1118391. PMID 16195424. S2CID 2971923.
- ^ Lau, S.K .; Woo, P. C .; Li, K. S .; et al. (2005). „Těžký akutní respirační syndrom vir podobný koronaviru u netopýrů čínských“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (39): 14040–14045. Bibcode:2005PNAS..10214040L. doi:10.1073 / pnas.0506735102. PMC 1236580. PMID 16169905.
- ^ Becker, Michelle M a kol. "Syntetický rekombinantní bat koronavirus podobný SARS je infekční v kultivovaných buňkách a v myších." Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických sv. 105,50 (2008): 19944-9. doi: 10,1073 / pnas.0808116105. Web National Library of Medicine Vyvolány 13 April 2020.
- ^ Národní akademie věd, inženýrství a medicíny, Oddělení pro studium Země a života, Rada pro biologické vědy, Rada pro chemické vědy a technologie, Výbor pro strategie pro identifikaci a řešení potenciálních zranitelných míst biologické obrany způsobených syntetickou biologií. (5. prosince 2018). Biodefense ve věku syntetické biologie. Washington, DC: National Academies Press. str. 44–45. ISBN 978-0-309-46518-2 DOI 10.17226 / 24890. Knihy Google. Vyvolány 13 April 2020.
- ^ "Vědci dokazují spojení civetové kočky SARS". Čína denně. 2006-11-23. Archivováno od originálu na 2011-06-14.
- ^ Mesecar, Andrew D .; Ratia, Kiira (2008-06-23). „Virová destrukce buněčných povrchových receptorů: obr. 1“ (PDF). Sborník Národní akademie věd. 105 (26): 8807–8808. doi:10.1073 / pnas.0804355105. PMC 2449321. PMID 18574141. Archivováno (PDF) od původního dne 2020-12-07.
- ^ Li, Wenhui; Moore, Michael J .; Vasilieva, Natalya; Sui, Jianhua; Wong, Swee Kee; Berne, Michael A .; Somasundaran, Mohan; Sullivan, John L .; Luzuriaga, Katherine; Greenough, Thomas C .; Choe, Hyeryun (listopad 2003). „Angiotensin-konvertující enzym 2 je funkční receptor pro SARS koronavirus“. Příroda. 426 (6965): 450–454. Bibcode:2003 Natur.426..450L. doi:10.1038 / nature02145. ISSN 0028-0836. PMC 7095016. PMID 14647384.
- ^ „Adaptace betacoronaviru na člověka zahrnovala progresivní ztrátu aktivity hemaglutinin-esterázy lektinu“. Mobilní hostitel a mikrob. 21 (3): 356–366. 2017-03-08. doi:10.1016 / j.chom.2017.02.008. ISSN 1931-3128.
- ^ Stanhope MJ, Brown JR, Amrine-Madsen H. Důkazy z evoluční analýzy nukleotidových sekvencí pro rekombinantní historii SARS-CoV. Infect Genet Evol. 2004 březen; 4 (1): 15-9. PMID 15019585
- ^ A b Zhang XW, Yap YL, Danchin A. Testování hypotézy o rekombinantním původu koronaviru spojeného se SARS. Arch Virol. Leden 2005; 150 (1): 1–20. EPUB 2004 10. října. PMID 15480857
- ^ Cinatl, J .; Morgenstern, B .; Bauer, G .; Chandra, P .; Rabenau, H .; Doerr, H. W. (2003-06-14). „Glycyrrhizin, aktivní složka kořenů lékořice, a replikace koronaviru spojeného se SARS“. Lanceta. 361 (9374): 2045–2046. doi:10.1016 / s0140-6736 (03) 13615-x. ISSN 1474-547X. PMC 7112442. PMID 12814717.
- ^ „Glycyrrhizin: Alternativní lék k léčbě infekce COVID-19 a souvisejícího respiračního syndromu?“. Farmakologie a terapeutika. 214: 107618. 2020-10-01. doi:10.1016 / j.pharmthera.2020.107618. ISSN 0163-7258.
- ^ Pilcher, HelenR. (2003-06-13). „Lékořice může bojovat proti SARS“. Příroda: novinky030609–16. doi:10.1038 / novinky030609-16.
- ^ Hoever, Gerold; Baltina, Lidia; Kondratenko, Rimma; Baltina, Lia; Tolstikov, Genrich A .; Doerr, Hans W .; Cinatl, Jindrich Jr. (19. 1. 2005). "Antivirová aktivita derivátů kyseliny glycyrrhizové proti SARS-koronaviru". Journal of Medicinal Chemistry. 48 (4): 1256–1259. doi:10.1021 / jm0493008. PMID 15715493 - přes ResearchGate.
Reference
- Peiris, J. S .; Lai, S. T .; Poon, L. L .; et al. (Duben 2003). „Koronavirus jako možná příčina těžkého akutního respiračního syndromu“. Lancet. 361 (9366): 1319–1325. doi:10.1016 / s0140-6736 (03) 13077-2. PMC 7112372. PMID 12711465.
- Rota, P. A .; Oberste, M. S .; Monroe, S. S .; et al. (2003-05-30). „Charakterizace nového koronaviru spojeného s těžkým akutním respiračním syndromem“. Věda. 300 (5624): 1394–1399. Bibcode:2003Sci ... 300.1394R. doi:10.1126 / science.1085952. PMID 12730500. S2CID 14522804.
- Marra, Marco A .; et al. (2003-05-30). „Sekvence genomu koronaviru souvisejícího se SARS“. Věda. 300 (5624): 1399–1404. Bibcode:2003Sci ... 300,1399M. doi:10.1126 / science.1085953. PMID 12730501.
- Snijder, E. J .; et al. (2003-08-29). „Jedinečné a konzervované rysy genomu a proteomu SARS-koronaviru, časného odštěpení od linie 2 skupiny koronavirů“. Journal of Molecular Biology. 331 (5): 991–1004. CiteSeerX 10.1.1.319.7007. doi:10.1016 / S0022-2836 (03) 00865-9. PMC 7159028. PMID 12927536.
- Yount, B .; et al. (2006-08-15). „Přepojení transkripčního obvodu pro těžký akutní respirační syndrom koronaviru (SARS-CoV): vytvoření genomu rezistentního vůči rekombinaci“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (33): 12546–12551. Bibcode:2006PNAS..10312546Y. doi:10.1073 / pnas.0605438103. PMC 1531645. PMID 16891412.
- Thiel, V., ed. (2007). Koronaviry: Molekulární a buněčná biologie (1. vyd.). Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-16-5.
- Enjuanes, L .; et al. (2008). "Koronavirová replikace a interakce s hostitelem". Živočišné viry: Molekulární biologie. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6.
externí odkazy
- Tisková zpráva WHO, která identifikuje a pojmenuje virus SARS
- Genetická mapa viru SARS
- Věda speciální na virus SARS (bezplatný obsah: není nutná registrace)
- Zdroje McGill University SARS na Wayback Machine (archivovány 1. března 2005)
- Domovská stránka Centra USA pro kontrolu a prevenci nemocí (CDC) SARS
- Světová zdravotnická organizace v pohotovosti