Molekel - Molekel
 | Téma tohoto článku nemusí splňovat požadavky Wikipedie pokyny k pozoruhodnosti produktů a služeb. (Duben 2012) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) |
 | tento článek příliš spoléhá na Reference na primární zdroje. (Duben 2012) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) |
Graf elektronové hustoty kationu norbornylu stanovený pomocí DFT s mapováním mullikenova elektrostatického potenciálu - B3LYP / 6-31G * v Gaussian03, obrázek nakreslený v molekilech pomocí souboru Gaussian cube; Kladný náboj je na tomto obrázku zbarven modře.
Molekel je svobodný software multiplatformní molekulární vizualizace program.[1] Původně byl vyvinut na University of Geneva Peter F. Flükiger v 90. letech pro Křemíková grafika Počítače. V roce 1998 převzal odpovědnost Stefan Portmann a vydal verzi 3.0. Verze 4.0 byla téměř nezávislá na platformě. Další vývoj vedl k verzi 4.3, než Stefan Portmann pokračoval a přestal vyvíjet kódy. V roce 2006 Švýcarské národní superpočítačové centrum (CSCS) restartoval projekt a verze 5.0 byla vydána 21. prosince 2006.[2]
Molekel používá VTK a Qwt a tedy také Qt.
Hlavní rysy
- Vizualizace zbytky (páska nebo schéma)
- Úplná kontrola nad generováním molekulárních povrchů (ohraničující rámeček a rozlišení )
- Vizualizace následujících povrchů:
- orbitaly
- Isosurface z elektronová hustota data
- Isosurface od Gaussian data krychlové mřížky
- Povrch přístupný rozpouštědlům (SAS)
- Povrch bez rozpouštědel (SES)
- Van der Waalsovy poloměry
- Animace molekulárních povrchů
- Exportovat do PostScript nebo TIFF
Viz také
- Gabedit
- Seznam systémů molekulární grafiky
- Molden
- Molekulární grafika
- Software pro modelování molekulární mechaniky
- SAMSON
- Seznam bezplatných a otevřených softwarových balíků
Reference
- ^ Noel O'Blog
- ^ Molekel About Archivováno 2009-08-27 na Wayback Machine
externí odkazy
 | Tento vědecký software článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |