Molden - Molden
 | Téma tohoto článku nemusí splňovat požadavky Wikipedie pokyny k pozoruhodnosti produktů a služeb. (Duben 2012) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) |
 | tento článek příliš spoléhá na Reference na primární zdroje. (Duben 2012) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) |
 | |
| Původní autoři | Gijs Schaftenaar |
|---|---|
| První vydání | 10. listopadu 1993[1] |
| Stabilní uvolnění | 5.9.2 / 20. prosince 2018[1] |
| Operační systém | Okna OS X Linux[2] |
| Licence | Proprietární |
| webová stránka | www |
Molden je obecný program pro zpracování molekulárních a elektronických struktur.
Hlavní rysy
- Přečte výstup z balíčků ab initio GAMESS (USA), Gaussian, MOLPRO, PySCF a ze semi-empirických balíčků, jako je MOPAC a podporuje řadu dalších formátů.
- Displeje molekulární orbitaly nebo elektronová hustota jako obrysové grafy nebo 3D grafy mřížky a výstup do řady grafických formátů.
- Animuje reakční cesty a molekulární vibrace.
- A Z-matice editor.
Program Molden byl testován na různých platformách, jmenovitě Linux, Windows NT, Windows95, Windows2000, WindowsXP, MacOSX, Silicon Graphics IRIX, Sun SunOS a Solaris.
Ambfor, hlavní modul silového pole v Moldávii, je externí program, který lze inicializovat z Moldenu. Ambfor připouští proteinové silové pole Amber a GAFF (General Amber Force Field). Použití Ambforu je automatické, když je protein studován pomocí Molden. Silové pole GAFF se používá pouze u malých molekul. Amber i GAFF jsou založeny na atomových nábojích. Rozdíly jsou z velké části ve výpočetních nákladech, přičemž GAFF je velmi drahý.
Molden umí číst několik formátů souborů s informacemi o krystalu.
Viz také
Reference
- ^ A b "DĚJINY". Citováno 2013-05-02.
- ^ „Aktuálně testované platformy“. Citováno 2013-05-03.
 | Tento vědecký software článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |