GAMESS (USA) - GAMESS (US)
![]() | |
Vývojáři | Iowská státní univerzita Skupina kvantové chemie |
---|---|
První vydání | 1. října 1977 |
Stabilní uvolnění | 20. dubna 2017 / 20. dubna 2017 |
Napsáno | FORTRAN 77, C |
Operační systém | Okna; Unix, Unixový: Linux, FreeBSD, Mac OS X |
K dispozici v | Angličtina |
Typ | Výpočetní chemie |
Licence | Proprietární freeware |
webová stránka | www |
Obecný atomový a molekulární elektronový strukturní systém (GAMESS (USA)) je počítač software pro výpočetní chemie program.[1][2][3][4][5] Původní kód začal 1. října 1977 jako projekt National Resources for Computations in Chemistry.[6] V roce 1981 se kódová základna rozpadla na GAMESS (USA) a GAMESS (UK) varianty, které se nyní výrazně liší. GAMESS (USA) je udržován členy Gordon Research Group na adrese Iowská státní univerzita.[7] Zdrojový kód GAMESS (USA) je k dispozici jako dostupný zdroj freeware, ale není open-source software, kvůli licenčním omezením.
Schopnosti
SCFTYP = | RHF | ROHF | UHF | GVB | MCSCF |
---|---|---|---|---|---|
Energie | CDpF | CDpF | CDpF | CDp | CDpF |
Analytický gradient | CDpF | CDpF | CDpF | CDp | CDpF |
Numerický hesián | CDpF | CDp | CDp | CDp | CDp |
Analytický hesián | CDpF | CDpF | CDpF | CDp | Dp |
Energie MP2 | CDpF | CDpF | CDp | Ne | CDp |
MP2 gradient | CDpF | Dp | CDp | Ne | Ne |
Energie CI | CDpF | CDp | Ne | CDp | CDp |
CI gradient | CD | Ne | Ne | Ne | Ne |
CC energie | CDpF | CDF | Ne | Ne | Ne |
EOM energie | CD | CD | Ne | Ne | Ne |
DFT energie | CDpF | CDp | CDpF | Ne | Ne |
DFT gradient | CDpF | CDp | CDpF | Ne | Ne |
TD-DFT energie | CDpF | Ne | CDpF | Ne | Ne |
TDDFT gradient | CDpF | Ne | Ne | Ne | Ne |
MOPAC energie | Ano | Ano | Ano | Ano | Ne |
MOPAC gradient | Ano | Ano | Ano | Ne | Ne |
GAMESS (USA) může provádět několik obecných výpočetní chemie výpočty, včetně Hartree – Fockova metoda, hustota funkční teorie (DFT), zobecněná valenční vazba (GVB) a vícekonfigurační samo-konzistentní pole (MCSCF). Korelační opravy po těchto výpočtech SCF lze odhadnout pomocí interakce konfigurace (CI), druhého řádu Møller – Plessetova teorie rušení (MP2) a spojený klastr (CC) teorie. Solventní efekt lze zvážit pomocí kvantové mechaniky a molekulární mechaniky prostřednictvím diskrétních efektivních fragmentových potenciálů nebo modelů kontinua (například PCM). Lze vypočítat relativistické opravy, včetně skalárních termínů Douglas-Krolla třetího řádu.
I když program neprovádí přímo molekulární mechanika, může provádět smíšené výpočty kvantové mechaniky a molekulární mechaniky prostřednictvím efektivních fragmentových potenciálů nebo prostřednictvím rozhraní s Dráteník kód. The fragment molekulární okružní lze použít k léčbě velkých systémů jejich rozdělením na fragmenty.
Lze jej také propojit s valenční vazba Programy VB2000 a XMVB a Natural Bond Orbital (NBO) program analýzy populace.
Vstupní soubory používají schéma založené na klíčových slovech. Například $ CONTRL SCFTYP = ROHF MAXIT = 30 $ END, což určuje, že SCF část kódu by měla dělat omezený open-shell Hartree – Fock (ROHF) a ukončete, pokud se výsledek nespojí ve 30 iteracích. Výstup je v textovém souboru v anglickém jazyce.[8]
Viz také
Reference
- ^ Young, David C. (2001). „Dodatek A. A.2.3 GAMESS“. Výpočtová chemie: Praktický průvodce aplikací technik na problémy reálného světa. Wiley-Interscience. str. 335. doi:10.1002/0471220655. ISBN 978-0-471-33368-5.
- ^ Schmidt, Michael W .; Baldridge, Kim K .; Boatz, Jerry A .; Elbert, Steven T .; Gordon, Mark S .; Jensen, Jan H .; Koseki, Shiro; Matsunaga, Nikita; Nguyen, Kiet A .; Su, Shujun; Windus, Theresa L .; Dupuis, Michel; Montgomery, John A. (1993). "Obecný systém atomové a molekulární elektronické struktury". Journal of Computational Chemistry. 14 (11): 1347–1363. doi:10.1002 / jcc.540141112. Toto je jeden z nejcitovanějších článků o chemii Archivováno 04.11.2011 na Wayback Machine
- ^ Gordon, Mark S .; Schmidt, Michael W. (2005). „Pokroky v teorii elektronické struktury: GAMESS o deset let později“ (PDF). V Dykstra, C.E .; Frenking, G .; Lim, K. S .; Scusaria, G. E. (eds.). Teorie a aplikace výpočetní chemie, prvních 40 let. Amsterdam: Elsevier. str. 1167–1189. doi:10.1016 / B978-044451719-7 / 50084-6. ISBN 978-0-444-51719-7.
- ^ Schmidt, Michael W .; Baldridge, Kim K .; Boatz, Jerry A .; Jensen, Jan H .; Koseki, Shiro; Gordon, Mark S .; Nguyen, Kiet A .; Windus, Theresa L .; Elbert, Stephen T. (1990). "Obecný atomový a molekulární elektronový strukturní systém (GAMESS)". Bulletin QCPE. 10: 52–54. ISSN 0889-7514. OCLC 7963600.
- ^ Od prosince 2014 uvádí kód GAMESS své přispěvatele jako: Michael W. Schmidt Kimberly K.Baldridge, Jerry A. Boatz, Stephen T. Elbert, Mark S. Gordon, Jan H. Jensen, Shiro Koseki, Nikita Matsunaga, Kiet A. Nguyen, Shujun J. Su, Theresa L. Windus, Michel Dupuis, John A. Montgomery, Ivana Adamovic, Christine Aikens, Jurij Alexejev Pooja Arora, Andrey Asadchev, Rob Bell, Pradipta Bandyopadhyay, Jonathan Bentz, Brett Bode Kurt Brorsen, Caleb Carlin, Galina Chaban, Wei Chen, Cheol Ho Choi, Paul Day, Albert Defusco, Nuwan Desilva, Tim Dudley, Dmitri Fedorov, Graham Fletcher, Mark Freitag, Kurt Glaesemann, Dan Kemp, Grant Merrill, Noriyuki Minezawa, Jonathan Mullin, Takeshi Nagata, Sean Nedd, Heather Netzloff, Bosiljka Njegic, Ryan Olson,Michael Pak, Spencer Pruitt, Luke Roskop, Jim Shoemaker, Lyudmila Slipchenko, Tony Smith, Sarom Sok, Jie Song, Tetsuya Taketsugu, Simon Webb, Peng Xu, Soohaeng Yoo, Federico Zahariev, Joe Ivanic, Aaron West, Laimutis Bytautas, Klaus Ruedenberg, Kimihiko Hirao, Takahito Nakajima, Takao Tsuneda, Muneaki Kamiya, Susumu Yanagisawa, Kiyoshi Yagi, Mahito Chiba, Seiken Tokura, Naoaki Kawakami, Frank Jensen, Visvaldas Kairys, Hui Li, Walt Stevens, David Garmer, Benedetta Mennucci, Jacopo Prakashan Korambath, Toby Zeng, Mariusz Klobukowski, Mark Spackman, Hiroaki Umeda, Kazuo Kitaura, Karol Kowalski, Marta Wloch, Jeffrey Gour, Jesse Lutz, Wei Li, Piotr Piecuch, Monika Musial, Stanislaw Kucharski, Olivier Quinet, Benoit Champagne, Bernard Kirtman, Kazuya Ishimura, Michio Katouda, Shigeru Nagase, Anna Pomogaeva, Dan Chipman, Haruyuki Nakano, Feng Long Gu, Jacek Korchowiec, Marcin Makowski, Yuriko Aoki, Hirotoshi Mori Eisaku Miyoshi, Tzvetelin Iordanov, Chet Swalina, Jonathan Skone, Sharon Hammes-Schiffer, Masato Kobayashi, Tomoko Akama, Tsuguki Touma, Takeshi Yoshikawam Yasuhiro Ikabata, Hiromi Nakai, Shuhua Li, Peifeng Su, Dejun Si, Nandun Thege Li, Roberto Peverati, Kim Baldridge, Maria Barysz, Casper Steinmann, Hiroya Nakata, Yoshio Nishimoto, Stephan Irle.
- ^ Gordon Research Group. „Manuál GAMESS (úvod)“ (PDF).
- ^ „Gordon Group / GAMESS Homepage“. www.msg.chem.iastate.edu.
- ^ Gordon Research Group. „GAMESS Manual (Input)“ (PDF).