Seznam modelových organismů - List of model organisms
Drosophila melanogaster, jeden z nejslavnějších předmětů experimentů
Toto je seznam modelové organismy používané ve vědeckém výzkumu.
Viry
- Fágová lambda
- Phi X 174 - své genom byl vůbec první, který byl sekvenován. Genom je kruh 11 geny, 5386 základní páry v délce.
- SV40
- F4 fág
- Virus mozaiky tabáku
- Virus herpes simplex
Prokaryotes
Sporulování Bacillus subtilis
- Escherichia coli (E-coli) - běžný Gramnegativní střevní bakterie široce používaná v molekulární genetika.
- Bacillus subtilis - an endospore tváření Grampozitivní bakterie.
- Caulobacter crescentus - bakterie, která se dělí na dvě odlišné buňky používané ke studiu buněčná diferenciace.
- Mycoplasma genitalium - minimální organismus.
- Aliivibrio fischeri - snímání kvora, bioluminiscence a zvířecí bakteriální symbióza s Havajský bobtail oliheň.
- Synechocystis, fotosyntetický sinice široce používán v fotosyntéza výzkum.
- Pseudomonas fluorescens, půdní bakterie, která se v laboratoři snadno diverzifikuje do různých kmenů.
- Azotobacter vinelandii, obligátní aerobe diazotrof použito v fixace dusíkem výzkum.
- Streptomyces coelicolor, vláknitá bakterie žijící v půdě používaná k výrobě mnoha klinicky užitečných antibiotika.[1]
Eukaryoty
Protisti
- Chlamydomonas reinhardtii - jednobuněčný zelená řasa zvyklý studovat fotosyntéza, bičíky a pohyblivost, regulace z metabolismus, rozpoznávání buňka-buňka a přilnavost, odpověď na deprivace živin a mnoho dalších témat. Chlamydomonas reinhardtii má dobře studovanou genetiku s mnoha známými a mapovanými mutanty a exprimovanými sekvenčními značkami a existují pokročilé metody genetické transformace a výběru genů.[2] Sekvenování Chlamydomonas reinhardtii genom byl hlášen v říjnu 2007.[3] A Chlamydomonas centrum genetické populace existuje na Duke University a mezinárodní Chlamydomonas pravidelně se schází zájmová skupina pro výzkum, aby diskutovali o výsledcích výzkumu. Chlamydomonas je snadné pěstovat za levnou cenu definované médium.
- Stentor coeruleus se používá v molekulární biologie (své genom bylo sekvenováno),[4] a je studován jako model regenerace jedné buňky.
- Dictyostelium discoideum se používá v molekulární biologie a genetika (své genom byl sekvenován) a je studován jako příklad buněčná komunikace, diferenciace, a programovaná buněčná smrt.
- Tetrahymena thermophila - volně žijící sladká voda ciliate prvoky.
- Emiliania huxleyi - jednobuněčný mořský coccolithophore řasa, rozsáhle studovaná jako model fytoplankton druh.
- Thalassiosira pseudonana - jednobuněčný mořský rozsivka řasa, rozsáhle studovaná jako modelová mořská rozsivka od jejího zveřejnění v roce 2004
- Naegleria gruberi je sladkovodní nepatogenní améboflagelát někdy se používá v experimentech biologie eukaryotických buněk
Houby
- Ashbya gossypii, patogen bavlny, předmět genetických studií (polarita, buněčný cyklus)
- Aspergillus nidulans, plíseň předmět genetických studií
- Coprinus cinereus, houba (genetické studie vývoje hub, genetické studie redukční dělení buněk )[5]
- Cryptococcus neoformans oportunistický lidský patogen
- Neurospora crassa - oranžový chléb plíseň (genetické studie redukční dělení buněk, metabolická regulace a cirkadiánní rytmus )[6]
- Saccharomyces cerevisiae, pekař droždí nebo nadějné droždí (používané při vaření a pečení)
- Komuna Schizophyllum - model pro houba formace.[7]
- Schizosaccharomyces pombe štěpné kvasinky (buněčný cyklus, polarita buněk, RNAi, struktura a funkce centromér, transkripce)
- Ustilago maydis, dimorfní kvasinky a rostlinný patogen z kukuřice (dimorfismus, rostlinný patogen, transkripce)
Rostliny
- Arabidopsis thaliana, v současné době nejpopulárnější modelový závod. Tento bylinný dvouděložný z rodiny Brassicaceae úzce souvisí s hořčice. Jeho malá postava a krátká generační čas usnadňuje rychlé genetické studie,[8] a bylo mapováno mnoho fenotypových a biochemických mutantů.[8] Arabidopsis byla první rostlinou, která ji měla genom seřazeno.[8] Jeho sekvence genomu, spolu s celou řadou informací týkajících se Arabidopsis, je udržován TAIR databáze.[8]
(Fyziologie rostlin, Vývojová biologie, Molekulární genetika, Populační genetika, Cytologie, Molekulární biologie ) - Rod Boechera kombinuje některé experimentální schopnosti a genetické nástroje vyvinuté pro jeho blízkého příbuzného Arabidopsis s převážně nerušenou přirozenou historií, což z něj dělá slibný modelový systém pro výzkum na křižovatce genetiky, genomiky, ekologie a evoluce. Rod zahrnuje druhy se vzácnou vlastností apomixis na diploidní úroveň.[9]
(Evoluční ekologie, Populační genetika, Molekulární ekologie, Evoluční biologie, Ekologická genetika ) - Selaginella moellendorffii je pozůstatkem starodávné linie cévnatých rostlin, která je klíčem k pochopení vývoje suchozemských rostlin. Má malou velikost genomu (~ 110 MB) a jeho sekvence byla vydána Společným institutem pro genom na začátku roku 2008. (Evoluční biologie, Molekulární biologie )
- Brachypodium distachyon je rozvíjející se experimentální modelová tráva, která má mnoho atributů, díky nimž je vynikajícím modelem pro obiloviny mírného pásma. (Agronomie, Molekulární biologie, Genetika )
- Setaria viridis je vznikající modelová tráva pro Fotosyntéza C4 a související bioenergetické trávy.[10][11]
- Lotus japonicus model lusk slouží ke studiu symbiózy odpovědné za fixace dusíkem. (Agronomie, Molekulární biologie )
- Lemna gibba je rychle rostoucí vodní jednoděložná rostlina, jedna z nejmenších kvetoucích rostlin. Pro hodnocení toxicity chemikálií pro rostliny se používají testy růstu Lemna ekotoxikologie. Protože v něm lze pěstovat čistá kultura lze mikrobiální akci vyloučit. Lemna se používá jako rekombinantní expresní systém pro ekonomickou výrobu komplexu biofarmaka. Používá se také ve vzdělávání k demonstraci křivky populačního růstu.
- Kukuřice (Zea mays L.) je obilné zrno. Jedná se o diploidní jednoděložnou s 10 velkými páry chromozomů, snadno studovatelnou mikroskopem. Jeho genetické rysy, včetně mnoha známých a zmapovaných fenotypových mutantů a velkého počtu potomků na křížení (typicky 100-200), usnadnily objev transpozice („skokové geny“). Bylo mapováno mnoho markerů DNA a genom byl sekvenován. (Genetika, Molekulární biologie, Agronomie )
- Medicago truncatula je vzorová luskovina, úzce spjatá s běžnou vojtěška. Jeho poměrně malý genom je v současné době sekvenován. Používá se ke studiu symbiózy odpovědné za fixaci dusíku. (Agronomie, Molekulární biologie )
- Mimulus guttatus je modelový organismus používaný ve studiích evolučních a funkčních genomů. Rod Mimulus obsahuje c. 120 druhů a je v rodině Phrymaceae. Pro studium tohoto rodu bylo navrženo několik genetických zdrojů a některé mají bezplatný přístup (http://www.mimulusevolution.org )
- Nicotiana benthamiana je často považován za modelový organismus pro studium rostlinných patogenů.[12]
- Buňky tabáku BY-2 je odpružení buněčná linie z tabák (Nicotiana tabacum), který je užitečný pro obecné fyziologické studie rostlin na buňka úroveň. Genom tohoto konkrétního kultivar nebude sekvenován v blízké budoucnosti, ale sekvence jeho divočiny druh Nicotiana tabacum právě probíhá. (Cytologie, Fyziologie rostlin, Biotechnologie )
- Rýže (Oryza sativa) se používá jako model pro obilovin biologie. Má jeden z nejmenších genomů jakéhokoli druhu obilovin a sekvenování jeho genomu je dokončeno.[13] (Agronomie, Molekulární biologie )
- Physcomitrella patens je mech stále více využívány pro studie o vývoji a molekulární evoluce rostlin.[14] Je to zatím jediný nevaskulární rostlina (a tak jediný "primitivní „rostlina“ s kompletně sekvenovaným genomem.[14] Kromě toho je v současné době jediným suchozemským závodem s účinností genové cílení který umožňuje genový knockout.[15] Výsledný knockout mechy jsou uloženy a distribuovány Mezinárodní centrum pro skladování mechu. (Fyziologie rostlin, Evoluční biologie, Molekulární genetika, Molekulární biologie )
- Marchantia polymorpha je jaterník který se také ukazuje jako model pro biologii a vývoj rostlin.
- Populus je rod používaný jako model v genetice lesů a studiích dřevin. Má malou velikost genomu, roste velmi rychle a snadno se transformuje. Sekvence genomu černého topolu (Populus trichocarpa ) je veřejně dostupný.[16]
- Viz také Chlamydomonas reinhardtii, výše pod Protisty.
Zvířata
Bezobratlí
- Amphimedon queenslandica, a demosponge z kmene Porifera používá se jako model pro evoluční vývojová biologie a komparativní genomika[17]
- Arbacia punctulata, fialově ostnatý mořský ježek, klasický předmět embryologických studií
- Aplysia, mořský slimák, jehož reakce na uvolnění inkoustu slouží jako model v neurobiologie a jehož růstové kužele sloužit jako model cytoskeletální přeskupení
- Branchiostoma floridae, druh běžně známý jako amphioxus nebo kopí z podčeledi Cephalochordata kmene Chordata používá se jako model pro pochopení vývoje nonchordate deuterostomes, chordates bezobratlých a obratlovců[18]
- Caenorhabditis elegans, a hlístice, obvykle volal C. elegans[19] - vynikající model pro pochopení genetické kontroly vývoje a fyziologie. C.elegans má stálý počet 1031 buněk. C. elegans byl první mnohobuněčný organismus, jehož genom byl kompletně sekvenován
- Caledia captiva (Orthoptera) ve východní Austrálii, zvyklý studovat sexuální výběr a sexuální konflikt
- Callosobruchus maculatus, bruchidský brouk, používaný ke studiu sexuálního výběru a sexuálního konfliktu
- Chorthippus parallelus, luční kobylka, zvyklá studovat sexuální výběr a sexuální konflikty
- Ciona intestinalis, mořská stříkačka
- Daphnia spp., malá planktonika korýši, vysoce citlivý na znečištění, slouží k hodnocení environmentální toxicity chemických látek na vodních bezobratlých.[20]
- Coelopidae - mušky z mořských řas, používané ke studiu sexuálního výběru a sexuálního konfliktu
- Diopsidae - mouchy se stopkami, používané ke studiu sexuálního výběru a sexuálního konfliktu
- Drosophila, obvykle druh Drosophila melanogaster - druh ovocný let, známý jako předmět genetických experimentů od Thomas Hunt Morgan a další. Snadno vyrůstající v laboratoři, rychlé generace, snadno vyvolané mutace, mnoho pozorovatelných mutací. Nedávno, Drosophila byl použit pro neurofarmakologický výzkum.[21] (Molekulární genetika, Populační genetika, Vývojová biologie ).
- Euprymna scolopes Havajská bobtail oliheň, model pro zvířecí bakterie symbióza, bioluminiscenční vibrace
- Galleria mellonella (můra větší), jejíž larvy jsou vynikajícím modelovým organismem pro toxikologii a testování patogenity in vivo, který nahrazuje použití malých savců v takových experimentech.
- Gryllus bimaculatus, polní kriket, používaný ke studiu sexuálního výběru a sexuálního konfliktu
- Hydra, a Cnidarian, je modelový organismus, který rozumí procesům regenerace a morfogeneze, jakož i vývoj bilaterálních tělesných plánů[22]
- Loligo pealei, chobotnice, předmět studia nervové funkce protože jeho obra axon (průměr téměř 1 mm, zhruba tisíckrát větší než typické axony savců)
- Lymnaea stagnalis (šnek velký), široce používaný model měkkýšů, ke studiu biomineralizace, neurobiologie, ekotoxikologie, sexuálního výběru a asymetrie těla[23]
- Macrostomum lignano volně žijící mořský plochý červ, modelový organismus pro studium kmenových buněk, regeneraci, stárnutí, funkci genů a vývoj pohlaví. Snadno zvednutý v laboratoři, krátká doba generování, neurčitý růst, komplexní chování[24]
- Mnemiopsis leidyi, z kmene Ctenophora (hřebenové želé) používané jako model pro evoluční vývojová biologie a komparativní genomika[25][26]
- Nematostella vectensis, a mořská sasanka z kmene Cnidaria používá se jako model pro evoluční vývojová biologie a komparativní genomika[27][28]
- Oikopleura dioica,[29] an appendicularian, volné plavání pláštěnka (nebo urochordát)
- Ormia ochracea, tachinidová moucha používaná ke studiu lokalizace zvuku.[30]
- Oscarella carmela A homoscleromorph houba (kmen Porifera ) použitý jako model v evoluční vývojová biologie[31]
- Parhyale hawaiensis korýš obojživelný, používaný v evolučním vývojovém (evo-devo ) studie s rozsáhlou sadou nástrojů pro genetickou manipulaci.
- Platynereis dumerilii mořský mnohoštětinatý annelid, který se vyvíjel velmi pomalu a proto si zachoval mnoho předků.[32]
- Podisma spp. v Alpách, který se používá ke studiu sexuálního výběru a sexuálního konfliktu
- Pristionchus pacificus, škrkavka používaná v evoluční vývojové biologii ve srovnávacích analýzách s C. elegans
- Scathophaga stercoraria, žlutá hnůj, zvyklá studovat sexuální výběr a sexuální konflikty
- Schmidtea mediterranea sladkovodní planar; model pro regeneraci a vývoj tkání, jako je mozek a zárodečná linie
- Stomatogastrický ganglion různých členovec druh; model pro generování motorických vzorů vidět ve všech opakujících se pohybech
- Strongylocentrotus purpuratus fialová mořský ježek, široce používaný ve vývojové biologii
- Symsagittifera roscoffensis, a plochý červ, předmět studií vývoje bilaterálního tělesného plánu
- Tribolium castaneum, moučný brouk - malý, snadno se udržuje potemní brouk používá se zejména v ekologie chování experimenty
- Trichoplax adhaerens, velmi jednoduché volně žijící zvíře z kmene Placozoa použit jako model v evoluční vývojová biologie a komparativní genomika[33]
- Tubifex tubifex, an oligochaeta používá se k hodnocení environmentální toxicity chemických látek pro vodní a suchozemské červy.[34]
Obratlovci
Laboratoř myši
- Axolotl (Ambystoma mexicanum), který se používá ke studiu regeneračních a vývojových procesů
- Bombina bombina a Bombina variegata, který se používá ke studiu sexuálního výběru a sexuálního konfliktu
- Carolina Anole (Anolis carolinensis), který se používá ke studiu plazomové genomiky
- Kočka (Felis sylvestris catus) - používá se v neurofyziologickém výzkumu.
- Kuře (Gallus gallus domesticus) - používá se pro vývojové studie, protože se jedná o amniote a vynikající pro mikromanipulaci (např. tkáňové štěpy) a nadměrnou expresi genových produktů.
- Bavlna krysa (Sigmodon hispidus ) - dříve používané při výzkumu obrny.
- Pes (Canis lupus familiaris) - důležitý respirační a kardiovaskulární model, také přispěl k objevu klasická klimatizace.
- Zlatý křeček (Mesocricetus auratus) - poprvé použito ke studiu kala-azaru (leishmanióza ).
- morče (Cavia porcellus) - používá Robert Koch a další časní bakteriologové jako hostitel bakteriálních infekcí, proto je to slovo „laboratorní zvíře“, i když dnes se používá méně běžně.
- Malý hnědý netopýr (Myotis lucifugus) - používá se k prokázání echolokace u netopýrů ve 30. letech a také se používá v experimentech předpovídajících chování mikrobatů, protože se jedná o spolehlivý druh, který má typické rysy mírného druhu netopýrů.
- Medaka (Oryzias latipes, nebo japonská rýžovka) - důležitý model ve vývojové biologii a má tu výhodu, že je mnohem odolnější než tradiční zebrafish.
- Myš (Mus musculus ) - klasický model obratlovce. Existuje mnoho inbredních kmenů, stejně jako linie vybrané pro určité rysy, často z etologické nebo lékařský zájem, např. velikost těla, obezita, svalnatost, dobrovolné běh kola chování.[35] (Kvantitativní genetika, Molekulární evoluce, Genomika )
- Nahý krysa, (Heterocephalus glaber), zkoumali jejich charakteristickou necitlivost na bolest, termoregulaci, odolnost vůči rakovině, eusocialitu a dlouhověkost.
- Nothobranchius furzeri je studován z důvodu jejich extrémně krátké životnosti ve výzkumu stárnutí, nemocí a evoluce.
- Holub (Columba livia domestica ), intenzivně studoval kognitivní vědu a inteligenci zvířat
- Poecilia reticulata, guppy, používaná ke studiu sexuálního výběru a sexuálního konfliktu
- Krysa (Rattus norvegicus ) - zvláště užitečné jako toxikologický model; také obzvláště užitečné jako neurologický model a zdroj primárních buněčných kultur, vzhledem k větší velikosti orgánů a suborganelárních struktur ve srovnání s myší. (Molekulární evoluce, Genomika )
- Makak rhesus (nebo opice rhesus) (Macaca mulatta) - používá se ke studiu na infekční nemoc a poznání.
- Mihule obecná (Petromyzon marinus) - výzkum míchy
- Takifugu (Takifugu rubripes, a pufferfish ) - má malý genom s malým zbytečná DNA.
- Tři-spined stickleback (Gasterosteus aculeatus), ryba používaná ke studiu etologie a ekologie chování.
- Xenopus tropicalis a Xenopus laevis (African clawed frog) - vejce a embrya z těchto žab se používají ve vývojové biologii, buněčné biologii, toxikologii a neurovědě[36][37]
- Zebra pěnkava (Taeniopygia guttata) - používá se při studiu systém písní z zpěvní ptáci a studium ne-savců sluchové systémy.
- Zebrafish (Danio rerio, sladkovodní ryba) - má během raného vývoje téměř průhledné tělo, které poskytuje jedinečný vizuální přístup k vnitřní anatomii zvířete. Zebrafish se používají ke studiu vývoje, toxikologie a toxikopatologie,[38] specifická genová funkce a role signálních drah.
Reference
- ^ "Streptomyces coelicolor". John Innes Center. Citováno 13. dubna 2018.
- ^ „Chlamydomonas reinhardtii resources at the Joint Genome Institute“. Archivovány od originál dne 23. 7. 2008. Citováno 2015-02-01.
- ^ Sekvenoval se genom Chlamydomonas publikováno v Science, 12. října 2007
- ^ Makronukleární genom Stentor coeruleus odhaluje drobné introny v obrovské buňce
- ^ Kües U (červen 2000). "Historie života a vývojové procesy v bazidiomycete Coprinus cinereus". Microbiol. Mol. Biol. Rev. 64 (2): 316–53. doi:10.1128 / MMBR.64.2.316-353.2000. PMC 98996. PMID 10839819.
- ^ Davis, Rowland H. (2000). Neurospora: příspěvky modelového organismu. Oxford [Oxfordshire]: Oxford University Press. ISBN 978-0-19-512236-7.
- ^ Ohm, R .; De Jong, J .; Lugones, L .; Aerts, A .; Kothe, E .; Stajich, J .; De Vries, R .; Record, E .; Levasseur, A .; Baker, S.E .; Bartholomew, K. A .; Coutinho, P. M .; Erdmann, S .; Fowler, T. J .; Gathman, A. C .; Lombard, V .; Henrissat, B .; Knabe, N .; Kües, U .; Lilly, W. W .; Lindquist, E .; Lucas, S .; Magnuson, J. K .; Piumi, F. O .; Raudaskoski, M .; Salamov, A .; Schmutz, J .; Schwarze, F. W. M. R .; Vankuyk, P. A .; Horton, J. S. (2010). „Sekvence genomu modelové houby Schizophyllum commune“. Přírodní biotechnologie. 28 (9): 957–963. doi:10.1038 / nbt.1643. PMID 20622885.
- ^ A b C d O společnosti Arabidopsis na stránce Informační zdroj Arabidopsis (TAIR )
- ^ Rushworth, C; et al. (2011). "Boechera, modelový systém pro ekologickou genomiku “. Molekulární ekologie. 20 (23): 4843–57. doi:10.1111 / j.1365-294X.2011.05340.x. PMC 3222738. PMID 22059452.
- ^ Brutnell, T; et al. (2010). „Setaria viridis: model pro fotosyntézu C4“. Rostlinná buňka. 22 (8): 2537–44. doi:10.1105 / tpc.110.075309. PMC 2947182. PMID 20693355.
- ^ Jiang, Hui; Barbier, Hugues; Brutnell, Thomas (2013). "Metody provádění křížů v systému Windows Setaria viridis, nový modelový systém pro trávy “. Žurnál vizualizovaných experimentů (80): 50527. doi:10.3791/50527. ISSN 1940-087X. PMC 3938206. PMID 24121645.
- ^ Goodin, Michael; David Zaitlin; Rayapati Naidu; Steven Lommel (srpen 2008). „Nicotiana benthamiana: její historie a budoucnost jako model interakcí rostlin a patogenů“. Molekulární interakce rostlin a mikrobů. 21 (8): 1015–1026. doi:10.1094 / MPMI-21-8-1015. PMID 18616398.
- ^ Zhou, S .; Bechner, M. C .; Place, M .; Churas, C. P .; Pape, L .; Leong, S. A .; Runnheim, R .; Forrest, D. K .; Goldstein, S .; Livny, M .; Schwartz, D. C. (2007). "Ověření sekvence genomu rýže optickým mapováním". BMC Genomics. 8: 278. doi:10.1186/1471-2164-8-278. PMC 2048515. PMID 17697381.
- ^ A b Rensing SA, Lang D, Zimmer AD a kol. (Leden 2008). „Genom Physcomitrella odhaluje evoluční pohledy na dobytí půdy rostlinami“. Věda. 319 (5859): 64–9. Bibcode:2008Sci ... 319 ... 64R. doi:10.1126 / science.1150646. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-3787-A. PMID 18079367.
- ^ Reski, Ralfe (1998). „Physcomitrella a Arabidopsis: David a Goliáš z reverzní genetiky“. Trendy ve vědě o rostlinách. 3 (6): 209–210. doi:10.1016 / S1360-1385 (98) 01257-6.
- ^ "Populus trichocarpa (Západní topol) ". Fytozom. Citováno 22. července 2013.
- ^ Srivastava, M .; Simakov, O .; Chapman, J .; Fahey, B .; Gauthier, M. E. A .; Mitros, T .; Richards, G. S .; Conaco, C .; Dacre, M .; Hellsten, U .; Larroux, C .; Putnam, N. H .; Stanke, M .; Adamska, M .; Darling, A .; Degnan, S. M .; Oakley, T. H .; Plachetzki, D. C .; Zhai, Y .; Adamski, M .; Calcino, A .; Cummins, S. F .; Goodstein, D. M .; Harris, C .; Jackson, D. J .; Leys, S. P .; Shu, S .; Woodcroft, B. J .; Vervoort, M .; Kosik, K. S. (2010). „The Amphimedon queenslandica genom a vývoj složitosti zvířat ". Příroda. 466 (7307): 720–726. Bibcode:2010Natur.466..720S. doi:10.1038 / nature09201. PMC 3130542. PMID 20686567.
- ^ Holland, L. Z .; Albalat, R .; Azumi, K .; Benito-Gutiérrez, E .; Blow, M. J .; Bronner-Fraser, M .; Brunet, F .; Butts, T .; Candiani, S .; Dishaw, L. J .; Ferrier, D. E. K .; Garcia-Fernàndez, J .; Gibson-Brown, J. J .; Gissi, C .; Godzik, A .; Hallböök, F .; Hirose, D .; Hosomichi, K .; Ikuta, T .; Inoko, H .; Kasahara, M .; Kasamatsu, J .; Kawashima, T .; Kimura, A .; Kobayashi, M .; Kozmik, Z .; Kubokawa, K .; Laudet, V .; Litman, G. W .; McHardy, A. C. (2008). „Genom amphioxus osvětluje původ obratlovců a biologii hlavonožců. Výzkum genomu. 18 (7): 1100–1111. doi:10.1101 / gr.073676.107. PMC 2493399. PMID 18562680.
- ^ Riddle, Donald L. (1997). C. elegans II. Plainview, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press. ISBN 978-0-87969-532-3.
- ^ Müller HG (1982). "Citlivost Daphnia magna straus na osm chemoterapeutických látek a dvě barviva". Býk. Environ. Contam. Toxicol. 28 (1): 1–2. doi:10.1007 / BF01608403. PMID 7066538.
- ^ Manev H, Dimitrijevic N, Dzitoyeva S (2003). "Techniky: ovocné mušky jako modely pro neurofarmakologický výzkum". Trends Pharmacol. Sci. 24 (1): 41–3. doi:10.1016 / S0165-6147 (02) 00004-4. PMID 12498730.
- ^ Chapman, J. A .; Kirkness, E. F .; Simakov, O .; Hampson, S.E .; Mitros, T .; Weinmaier, T .; Rattei, T .; Balasubramanian, P. G .; Borman, J .; Busam, D .; Disbennett, K .; Pfannkoch, C .; Sumin, N .; Sutton, G. G .; Viswanathan, L. D .; Walenz, B .; Goodstein, D. M .; Hellsten, U .; Kawashima, T .; Prochnik, S.E .; Putnam, N. H .; Shu, S .; Blumberg, B .; Dana, C.E .; Gee, L .; Kibler, D. F .; Law, L .; Lindgens, D .; Martinez, D. E.; et al. (2010). „Dynamický genom Hydry“. Příroda. 464 (7288): 592–596. Bibcode:2010Natur.464..592C. doi:10.1038 / nature08830. PMC 4479502. PMID 20228792.
- ^ Fodor, István; Hussein, Ahmed AA; Benjamin, Paul R; Koene, Joris M; Pirger, Zsolt (2020-06-16). King, Stuart RF; Rodgers, Peter; Irisarri, Iker; Voroněžská, Elena E; Coutellec, Marie-Agnes (eds.). „Neomezený potenciál šneka velkého, Lymnaea stagnalis“. eLife. 9: e56962. doi:10,7554 / eLife.56962. ISSN 2050-084X.
- ^ Ladurner, P; Schärer, L; Salvenmoser, W; Rieger, R (2005). „Nový modelový organismus mezi dolní bilaterií a využití digitální mikroskopie v taxonomii meiobentických platyhelmint: Macrostomum lignano, n. sp. (Rhabditophora, Macrostomorpha) ". Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. 43: 114–126. doi:10.1111 / j.1439-0469.2005.00299.x. Archivovány od originál dne 05.01.2013.
- ^ Pang, K .; Martindale, M. Q. (2008). „Ctenophores“. Aktuální biologie. 18 (24): R1119 – R1120. doi:10.1016 / j.cub.2008.10.004. PMID 19108762.
- ^ Ryan, J. F .; Pang, K .; Srovnávací sekvenční program; Mullikin, J. C .; Martindale, M. Q .; Baxevanis, A. D .; Program srovnávacího sekvenování NISC (2010). „Doplněk homeodomény ctenofora Mnemiopsis leidyi naznačuje, že Ctenophora a Porifera se před ParaHoxozoa rozcházely“. EvoDevo. 1 (1): 9. doi:10.1186/2041-9139-1-9. PMC 2959044. PMID 20920347.
- ^ Darling, J. A .; Reitzel, A. R .; Burton, P. M .; Mazza, M. E.; Ryan, J. F .; Sullivan, J. C .; Finnerty, J. R. (2005). „Rising starlet: the starlet sea anemone, Nematostella vectensis“. BioEssays. 27 (2): 211–221. doi:10.1002 / bies.20181. PMID 15666346.
- ^ Putnam, N. H .; Srivastava, M .; Hellsten, U .; Dirks, B .; Chapman, J .; Salamov, A .; Terry, A .; Shapiro, H .; Lindquist, E .; Kapitonov, V. V .; Jurka, J .; Genikhovich, G .; Grigorjev, I. V .; Lucas, S. M .; Steele, R.E .; Finnerty, J. R .; Technau, U .; Martindale, M. Q .; Rokhsar, D. S. (2007). „Genom mořských sasanek odhaluje rodový repertoár eumetazoanů a genomovou organizaci“. Věda. 317 (5834): 86–94. Bibcode:2007Sci ... 317 ... 86P. doi:10.1126 / science.1139158. PMID 17615350.
- ^ Zařízení Appendicularia na Sars International Center for Marine Molecular Biology
- ^ Cade, W. (1975-12-26). „Akusticky orientovaní parazitoidové: leťte fonotaxí na kriketovou píseň“. Věda. 190 (4221): 1312–1313. Bibcode:1975Sci ... 190.1312C. doi:10.1126 / science.190.4221.1312. ISSN 0036-8075.
- ^ Wang, X .; Lavrov, D. V. (2006). „Mitochondriální genom Homoscleromorph Oscarella carmela (Porifera, Demospongiae) odhaluje neočekávanou složitost společného předka hub a jiných zvířat“. Molekulární biologie a evoluce. 24 (2): 363–373. doi:10.1093 / molbev / msl167. PMID 17090697.
- ^ Tessmar-Raible, K .; Arendt, D. (2003). „Rozvíjející se systémy: mezi obratlovci a členovci, Lophotrochozoa“. Aktuální názor na genetiku a vývoj. 13 (4): 331–340. doi:10.1016 / s0959-437x (03) 00086-8. PMID 12888005.
- ^ Srivastava, M .; Begovic, E .; Chapman, J .; Putnam, N. H .; Hellsten, U .; Kawashima, T .; Kuo, A .; Mitros, T .; Salamov, A .; Carpenter, M. L .; Signorovitch, A. Y .; Moreno, M. A .; Kamm, K .; Grimwood, J .; Schmutz, J .; Shapiro, H .; Grigorjev, I. V .; Buss, L. W .; Schierwater, B .; Dellaporta, S.L .; Rokhsar, D. S. (2008). „Trichoplax genom a povaha placozoanů“ (PDF). Příroda. 454 (7207): 955–960. Bibcode:2008Natur.454..955S. doi:10.1038 / nature07191. PMID 18719581.
- ^ Reynoldson TB, Thompson SP, Bamsey JL (1991). "Biologická zkouška sedimentu s použitím tubificidního červa oligochaete Tubifex tubifex". Environ. Toxicol. Chem. 10 (8): 1061–72. doi:10.1002 / atd. 5620100811.
- ^ Kolb, E. M .; Rezende, E. L .; Holness, L .; Radtke, A .; Lee, S.K .; Obenaus, A .; Garland Jr, T (2013). „Myši selektivně chované pro vysoký dobrovolný běh kol mají větší střední mozky: podpora mozaikového modelu evoluce mozku“. Journal of Experimental Biology. 216: 515–523. doi:10.1242 / jeb.076000. PMID 23325861.
- ^ Wallingford, J .; Liu, K .; Zheng, Y. (2010). „Xenopus“. Aktuální biologie. 20: R263–4. doi:10.1016 / j.cub.2010.01.012. PMID 20334828.
- ^ Harland, R.M .; Grainger, R.M. (2011). „Výzkum Xenopus: proměněn genetikou a genomikou“. Trendy v genetice. 27: 507–15. doi:10.1016 / j.tig.2011.08.003. PMC 3601910. PMID 21963197.
- ^ Spitsbergen JM, Kent ML (2003). „Nejmodernější model zebrafish pro výzkum toxikologie a toxikologické patologie - výhody a současná omezení“. Toxicol Pathol. 31 (Suppl): 62–87. doi:10.1080/01926230390174959. PMC 1909756. PMID 12597434.