Aspergillus nidulans - Aspergillus nidulans - Wikipedia

Aspergillus nidulans
Aspergillus nidulans wildtype.jpg
A. nidulans se zelenými spórami divokého typu, pěstovanými v laboratorních podmínkách.
Vědecká klasifikace Upravit
Království:Houby
Divize:Ascomycota
Třída:Eurotiomycetes
Objednat:Eurotiales
Rodina:Trichocomaceae
Rod:Aspergillus
Druh:
A. nidulans
Binomické jméno
Aspergillus nidulans
G Zima 1884
Synonyma

Emericella nidulans

Aspergillus nidulans (také zvaný Emericella nidulans když se odkazuje na jeho sexuální formu, nebo teleomorph ) je jedním z mnoha druhů vláknitých houby v kmeni Ascomycota. Byl to důležitý výzkumný organismus pro studium eukaryotický buněčná biologie[1]více než 50 let,[2]se používá ke studiu široké škály předmětů včetně rekombinace, Oprava DNA, mutace, buněčný cyklus řízení, tubulin, chromatin, nukleokineze, patogeneze, metabolismus,[3] a experimentální evoluce.[4]Je to jeden z mála druhů rod schopen vytvářet sexuální spory redukční dělení buněk, umožňující křížení kmenů v laboratoři. A. nidulans je homotalický houba, což znamená, že je schopna se sama oplodnit a formovat plodnice v nepřítomnosti partnera pro páření. Má přepážkové hyfy s vlněnou koloniální strukturou a bílou mycelií. Zelená barva kolonií divokého typu je způsobena pigmentací spor, zatímco mutace v pigmentační cestě mohou produkovat další barvy spor.

Genom

The A. nidulans genom byl sekvenován ve spolupráci mezi Monsanto a Široký institut.[5] Sekvence s 13násobným pokrytím byla veřejně vydána v březnu 2003;[5] analýza anotováno genom byl publikován v Příroda v prosinci 2005.[6] Je to 30 milionů základní páry o velikosti a předpokládá se, že bude obsahovat přibližně 9 500 protein -kódování geny v osm chromozomy.

V poslední době několik kaspáza - jako proteázy byly izolovány z A. nidulans vzorky, pod kterými programovaná buněčná smrt byla vyvolána. Nálezy, jako jsou tyto, hrají klíčovou roli při určování evoluční ochrany mitochondrie uvnitř eukaryotické buňky a její role jako starověké proteobakterium schopné vyvolat buněčnou smrt.[Citace je zapotřebí ]

Sexuální reprodukce

K sexuální reprodukci dochází dvěma zásadně odlišnými způsoby. To je tím křížení (heterotalický pohlaví), ve kterém dva odlišné jednotlivci přispívají jádry, nebo homotalický pohlaví nebo sebeoplodnění (selfing), při kterém jsou obě jádra odvozena od stejného jedince. Selfing in A. nidulans Zahrnuje aktivaci stejných cest páření charakteristických pro pohlaví u druhů, které procházejí křížením, tj. samooplodnění neobchází požadované cesty pro křížení pohlaví, ale místo toho vyžaduje aktivaci těchto cest u jediného jedince.[7] Fúze haploidní jádra se vyskytují v reprodukčních strukturách nazývaných kleistothecie, ve kterém je diploid zygota podléhá meiotickému dělení za vzniku haploidních askospor.

Použití ve farmaceutickém výzkumu

Anidulafungin[8] je polosyntetický lipopeptid antifungální lék z echinokandin Podtřída B odvozená z fermentačního produktu z A. nidulans var. echinulatus kmen A 32204, byl objeven v Německu v roce 1974;[9] echinokandiny destabilizují plísně buněčná stěna inhibicí syntézy integrální složky zvané glukan prostřednictvím nekompetitivní inhibice z enzym 1,3-β glukan syntáza.[10][11]

Reference

  1. ^ Osmani SA, Mirabito PM (2004). „Časný dopad genetiky na naše chápání regulace buněčného cyklu u Aspergillus nidulans“. Fungal Genet Biol. 41 (4): 401–10. doi:10.1016 / j.fgb.2003.11.009. PMID  14998523.
  2. ^ Martinelli, S. D .; J. R. Kinghorn (1994). Aspergillus: 50 let dále. Elsevier. ISBN  978-0-444-81762-4.
  3. ^ Nierman WC, květen G, Kim HS, Anderson MJ, Chen D, Denning DW (2005). "Co nám řekli genomy Aspergillus". Med Mycol. 43. Suppl 1 (s1): S3–5. doi:10.1080/13693780400029049. PMID  16110785.
  4. ^ Schoustra SE, Slakhorst, M, Debets, AJM, Hoekstra, RF (2005). "Porovnání umělého a přirozeného výběru v míře adaptace na genetický stres v EU." Aspergillus nidulans". J Evol Biol. 18 (4): 771–778. CiteSeerX  10.1.1.535.8579. doi:10.1111 / j.1420-9101.2005.00934.x. PMID  16033548.
  5. ^ A b „Aspergillus nidulans Project Information“. Široký institut. Citováno 2011-01-28.
  6. ^ Galagan JE; et al. (2005). "Sekvenování Aspergillus nidulans a srovnávací analýza s A. fumigatus a A. oryzae". Příroda. 438 (7071): 1105–15. doi:10.1038 / příroda04341. PMID  16372000.
  7. ^ Paoletti M, Seymour FA, Alcocer MJ, Kaur N, Calvo AM, Archer DB, Dyer PS (srpen 2007). „Typ páření a genetický základ vlastní plodnosti u modelové houby Aspergillus nidulans". Curr. Biol. 17 (16): 1384–9. doi:10.1016 / j.cub.2007.07.012. PMID  17669651.
  8. ^ „Anidulafungin EMA Europa“ (PDF).
  9. ^ Nyfeler R, Keller-Schierlein W (1974). "Metabolity mikroorganismů. 143. Echinokandin B, nové polypeptidové antibiotikum z Aspergillus nidulans var. Echinulatus: izolace a strukturní složky". Helv Chim Acta. 57 (8): 2459–2477. doi:10,1002 / hlca.19740570818. PMID  4613708.
  10. ^ Morris MI, Villmann M (září 2006). „Echinokandiny při léčbě invazivních plísňových infekcí, část 1“. Am J Health Syst Pharm. 63 (18): 1693–703. doi:10.2146 / ajhp050464.p1. PMID  16960253.
  11. ^ Morris MI, Villmann M (říjen 2006). „Echinokandiny při léčbě invazivních plísňových infekcí, část 2“. Am J Health Syst Pharm. 63 (19): 1813–20. doi:10.2146 / ajhp050464.p2. PMID  16990627.

externí odkazy