Medicago truncatula - Medicago truncatula

Medicago truncatula
Pobočka Medicago truncatula A17.JPG
Vědecká klasifikace
Království:
Plantae
(bez hodnocení):
Krytosemenné rostliny
(bez hodnocení):
Eudicots
(bez hodnocení):
Rosidy
Objednat:
Fabales
Rodina:
Fabaceae
Podčeleď:
Faboideae
Kmen:
Trifolieae
Rod:
Medicago
Druh:
M. truncatula
Binomické jméno
Medicago truncatula
Synonyma

Medicago tribuloides Desr.
Medicago tribuloides var. breviaculeata Moris
Medicago truncatula var. breviaculeata (Moris) Urb.
Medicago truncatula var. longiaculeata Urb.
Medicago truncatula var. tribuloidy (Desr.) Burnat
Medicago truncatula F. tricycla Nègre
Medicago truncatula var. tricycla (Nègre) Heyn

Medicago truncatula, barelclover,[2] silně zatočený medik,[3] barel zdravotníknebo barel medick, je malý roční lusk původem z Středomoří oblast, která se používá v genomický výzkum. Je to málo rostoucí, jetel -jako rostlina 10–60 centimetrů (3,9–23,6 palce) vysoká s trojčetem listy. Každý leták je zaoblený, dlouhý 1–2 centimetry (0,39–0,79 palce), často s tmavou skvrnou uprostřed. The květiny jsou žluté, vyráběné jednotlivě nebo v malém květenství od dvou do pěti dohromady; the ovoce je malý, ostnatý pod.

Tento druh je studován jako a modelový organismus pro biologii luštěnin, protože má malou diploidní genom, je samoplodná, má rychlou generační dobu a plodnou produkci semen, je přístupná geneticky proměna a jeho genom byl sekvenován.[4]

Tvoří se symbiózy s fixace dusíkem rhizobia (Sinorhizobium meliloti a Sinorhizobium medicae ) a arbuskulární mykorhizní houby včetně Rhizophagus nepravidelný (dříve známé jako Glomus intraradices ). Modelový závod Arabidopsis thaliana netvoří ani symbiózu, takže M. truncatula důležitý nástroj pro studium těchto procesů.

Je to také důležité píce druhy plodin v Austrálie.

Sekvenování genomu

Návrh sekvence genomu M. truncatula kultivar A17 byl publikován v časopise Příroda v roce 2011.[4]

The sekvenování bylo provedeno mezinárodním partnerstvím výzkumných laboratoří zahrnujících výzkumníky z EU University of Oklahoma (NÁS), Institut J. Craiga Ventera (NÁS), Genoskop (Francie) a Sanger Center (SPOJENÉ KRÁLOVSTVÍ). Partnerské instituce zahrnovaly University of Minnesota (NÁS), University of California-Davis (USA), Národní centrum pro genomické zdroje (USA), John Innes Center (UK), Institut National de Recherche Agronomique (Francie), Mnichovské informační centrum pro sekvence proteinů (Německo), Wageningenská univerzita (Nizozemsko) a Gentská univerzita (Belgie). The Medicago truncatula Konsorcium pro sekvenování začalo v roce 2001 grantem na osivo od Noble Foundation Samuela Robertsa. V roce 2003 Národní vědecká nadace a šestý rámcový program Evropské unie začal poskytovat většinu finančních prostředků. Do roku 2009 bylo dokončeno 84% shromáždění genomu.[5]

Sestavení sekvence genomu v M. truncatula bylo založeno na bakteriální umělé chromozomy (BAC). Jedná se o stejný přístup, jaký se používá k sekvenování genomů lidí, ovocných mušek, Drosophila melanogaster a modelový závod, Arabidopsis thaliana. V červenci 2013 byla vydána verze 4.0 genomu.[6] Tato verze kombinovala sekvence získané z sekvenování brokovnice se sestavami sekvencí založených na BAC, což pomohlo vyplnit mezery v dříve mapovaných sekvencích.

Souběžná skupina známá jako mezinárodní Medicago Skupina genových anotací (IMGAG ) je zodpovědný za identifikaci a popis domnělých genových sekvencí v genomové sekvenci.

Symbiózy s půdními mikroorganismy

Použil výzkumník Toby Kiers z VU University Amsterdam a spolupracovníci M. truncatula studovat symbiózy mezi rostlinami a houbami - a zjistit, zda mohou partneři ve vztahu rozlišovat mezi dobrými a špatnými obchodníky / dodavateli. Použitím značeného uhlíku ke sledování zdroje živin protékajících arbuskulárním mykorhizním systémem vědci prokázali, že rostliny skutečně poskytly více uhlíku štědrým druhům hub. Omezením množství uhlíku, které rostliny daly houbě, vědci také prokázali, že houby předávaly více svého fosforu štědrým rostlinám.[7]

Viz také

Reference

  1. ^ Rhodes, L. (2016). "Medicago truncatula". Červený seznam ohrožených druhů IUCN. IUCN. 2016: e.T176489A19401776. doi:10.2305 / IUCN.UK.2016-3.RLTS.T176489A19401776.en.
  2. ^ "Medicago truncatula". Služba zachování přírodních zdrojů Databáze rostlin. USDA. Citováno 28. ledna 2016.
  3. ^ „Seznam BSBI 2007“. Botanická společnost Británie a Irska. Archivovány od originál (xls) dne 2014-10-23. Citováno 2014-10-17.
  4. ^ A b Young, Nevin D .; Debellé, Frédéric; Oldroyd, Giles E. D .; Geurts, Rene; Cannon, Steven B .; Udvardi, Michael K .; Benedito, Vagner A .; Mayer, Klaus F. X .; Gouzy, Jérôme; Schoof, Heiko; Van de Peer, Yves; Proost, Sebastian; Cook, Douglas R .; Meyers, Blake C .; Spannagl, Manuel; Cheung, Foo; De Mita, Stéphane; Krishnakumar, Vivek; Gundlach, Heidrun; Zhou, Shiguo; Mudge, Joann; Bharti, Arvind K .; Murray, Jeremy D .; Naoumkina, Marina A .; Rosen, Benjamin; Silverstein, Kevin A. T .; Tang, Haibao; Rombauts, Stephane; Zhao, Patrick X .; et al. (16. listopadu 2011). „Genom Medicago poskytuje pohled do vývoje rhizobiální symbiózy“. Příroda. 480 (7378): 520–524. Bibcode:2011 Natur.480..520Y. doi:10.1038 / příroda10625. PMC  3272368. PMID  22089132.
  5. ^ http://www.medicago.org/genome/genome_stats.php[trvalý mrtvý odkaz ]
  6. ^ „JCVI: Medicago / Home“. Archivovány od originál dne 10. listopadu 2013. Citováno 20. února 2017.
  7. ^ Milius, Susan (23. září 2013). „Rostliny a houby uznávají velkorysé obchodní partnery“. Citováno 20. února 2017.[mrtvý odkaz ]

Další čtení

Courty, Pierre Emmanuel; Smith, Penelope; Koegel, Sally; Redecker, Dirk; Wipf, Daniel (1. června 2015). „Příjem a transport anorganického dusíku v prospěšných interakcích kořen-mikrob s rostlinou“. Kritické recenze v rostlinných vědách. 34 (1–3): 4–16. doi:10.1080/07352689.2014.897897. S2CID  85772198.

externí odkazy