Thalassiosira pseudonana - Thalassiosira pseudonana

Thalassiosira pseudonana
Oogonium - 3 (34809275943) .jpg
A Thalassiosira pseudonana oogonium (vaječná buňka) začínající expandovat buněčnou stěnou. Umělé zbarvení označuje chlorofyl (modrý) a DNA (červený).
Vědecká klasifikace
(bez hodnocení):
SAR
Nadkmen:
Heterokonta
Třída:
Coscinodiscophyceae
Objednat:
Thalassiosirales
Rodina:
Thalassiosiraceae
Rod:
Thalassiosira
Druh:
T. pseudonana
Binomické jméno
Thalassiosira pseudonana
(Cleve, 1873)

Thalassiosira pseudonana je druh zaměřený na moře rozsivky. Bylo vybráno jako první eukaryotický námořní fytoplankton jako celek sekvenování genomu.[1] T. pseudonana byl vybrán pro tuto studii, protože se jedná o model pro studium fyziologie rozsivek, patří do rodu široce rozšířeného po celém světovém oceánu a má relativně malý genom při 34 mega základní páry. Vědci zkoumají absorpci světla rozsivky pomocí mořské rozsivky Thalassiosira. Rozsivka vyžaduje dostatečně vysokou koncentraci CO2 za účelem využití C.4 metabolismus a tato smyčka pozitivní zpětné vazby svědčí o tom, jak je zodpovědná za produkci 40% organického uhlíku pro oceánské dno (Clement et al. 2015).[2] Konstruovaná forma rozsivky byla považována za potenciální prostředek pro dodávání léčiv pro léčbu rakoviny chemoterapeutickými léky, které jsou špatně rozpustné ve vodě.[3]

The klon z T. pseudonana který byl sekvenován, je CCMP 1335 a je k dispozici na webu Národní centrum pro mořské řasy a mikrobioty na Bigelowská laboratoř pro oceánské vědy. Tento klon byl původně shromážděn v roce 1958 od Moriches Bay (Long Island, New York ) a byl průběžně udržován v kultura.

Symbióza

Thalassiosira pseudonana a heterotrofní alphaproteobacterium Ruegeria pomeroyi tvoří chemickou látku symbióza v kokultuře. Bakterie poskytují vitamin B12 na rozsivky, které na oplátku poskytují bakteriím organické živiny. Za přítomnosti rozsivky začnou bakterie produkovat transportér pro dihydroxypropansulfonát (DHPS), živinu produkovanou rozsivkou pro bakterie.[4]

Reference

  1. ^ Armbrust, E .; Berges, J .; Bowler, C .; Green, B .; Martinez, D .; Putnam, N .; Zhou, S .; Allen, A .; Apt, K .; Bechner, M .; Brzezinski, M. A .; Chaal, B. K .; Chiovitti, A .; Davis, A. K .; Demarest, M. S .; Detter, J. C .; Glavina, T .; Goodstein, D .; Hadi, M.Z .; Hellsten, U .; Hildebrand, M .; Jenkins, B. D .; Jurka, J .; Kapitonov, V. V .; Kröger, N .; Lau, W. W .; Lane, T. W .; Larimer, F. W .; Lippmeier, J. C .; Lucas, S. (2004). „Genom rozsivky Thalassiosira pseudonana: ekologie, evoluce a metabolismus“. Věda. 306 (5693): 79–86. Bibcode:2004Sci ... 306 ... 79A. CiteSeerX  10.1.1.690.4884. doi:10.1126 / science.1101156. PMID  15459382.
  2. ^ Clement, R., Dimnet, L., Maberly, S. C., Gontero, B. 2015. Povaha mechanismů koncentrace CO2 v mořské rozsivce, Thalassiosira pseudonana. New Phytologist Trust 209: 1417-1427.
  3. ^ Delalat, Bahman; Sheppard, Vonda C .; Rasi Ghaemi, Soraya; Rao, Shasha; Prestidge, Clive A .; McPhee, Gordon; Rogers, Mary-Louise; Donoghue, Jacqueline F .; Pillay, Vinochani; Johns, Terrance G .; Kröger, Nils; Voelcker, Nicolas H. (2015). „Cílené dodávání léčiv pomocí geneticky upravené křemeliny“. Příroda komunikace. 6: 8791. Bibcode:2015NatCo ... 6.8791D. doi:10.1038 / ncomms9791. PMID  26556723.
  4. ^ Kujawinski, Elizabeth B .; et al. (2016). „The Ocean Microbiome: Metabolic Engine of the Marine Carbon Cycle“. Časopis pro mikroby. 11 (6): 262–267. doi:10.1128 / mikrob 11.11.262.1.

Další čtení

Meksiarun, Phiranuphon; Spegazzini, Nicolas; Matsui, Hiroaki; Nakajima, Kensuke; Matsuda, Yusuke; Sato, Hidetoshi (leden 2015). "In Vivo Studie akumulace lipidů v mikrořasách Marine Diatom Thalassiosira pseudonana pomocí Ramanovy spektroskopie". Aplikovaná spektroskopie. 69 (1): 45–51. Bibcode:2015ApSpe..69 ... 45M. doi:10.1366/14-07598. PMID  25506782.

Yi, Andy Xianliang; Leung, Priscilla T. Y .; Leung, Kenneth M. Y. (září 2014). "Fotosyntetické a molekulární reakce mořského rozsivky Thalassiosira pseudonana na expozici trifenyltinu". Vodní toxikologie. 154: 48–57. doi:10.1016 / j.aquatox.2014.05.004. PMID  24858899.

Luo, Chun-Shan; Liang, Jun-Rong; Lin, Qun; Li, Caixia; Bowler, Chris; Anderson, Donald; Wang, Peng; Wang, Xin-Wei; Gao, Ya-Hui (prosinec 2014). „Buněčné odpovědi spojené s produkcí ROS a rozhodnutím o buněčném osudu v časné stresové reakci na omezení železa u Diatom Thalassiosira pseudonana“. Journal of Proteome Research. 13 (12): 5510–5523. doi:10.1021 / pr5004664. PMC  4261981. PMID  25372880.

Sunda, William G .; Shertzer, Kyle W .; Coggins, Lew (říjen 2014). „Pozitivní zpětné vazby mezi kontrolami zdola nahoru a shora dolů podporují tvorbu a toxicitu ekosystémů rušivých květů řas: modelová studie“. Škodlivé řasy. 39: 342–356. doi:10.1016 / j.hal.2014.09.005.

Samukawa, Mio; Shen, Chen; Hopkinson, Brian; Matsuda, Yusuke (2014). „Lokalizace domnělých karboanhydráz v mořské rozsivce, Thalassiosira pseudonana“. Fotosyntetický výzkum. 121 (2–3): 235–249. doi:10.1007 / s11120-014-9967-x. PMID  24414291.

Delalat, Bahman; Sheppard, Vonda C .; Ghaemi, Soraya Rasi; Rao, Shasha; Prestidge, Clive A .; McPhee, Gordon; Rogers, Mary-Louise; Donoghue, Jaqueline F .; Pillay, Vinochani; Johns, Terrance G .; Kroeger, Nils; Voelcker, Nicolas H. (2015). „Cílené dodávání léčiv pomocí geneticky upravené křemeliny“. Příroda komunikace. 6: 8791. Bibcode:2015NatCo ... 6.8791D. doi:10.1038 / ncomms9791. PMID  26556723.