Haploskupina M30 (mtDNA) - Haplogroup M30 (mtDNA)

Haploskupina M30
Možná doba vzniku14 600 až 30 200 YBP[1]
Možné místo původuJížní Asie
PředekM4'45
PotomciM30a, M30b, M30c, M30d, M30e
Definování mutací195A, 15431A, 12007A

v lidská mitochondriální genetika, Haploskupina M30 je haploskupina lidské mitochondriální DNA (mtDNA).

Původ

Haploskupina M30 (coding region: 195A-514dCA-12007-15431) is a South-Asian[2] nebo mateřská linie specifická pro Indii[3][4] makrohaploskupiny M identifikované mutacemi T195A, G15431A a G12007A.[3]

Haploskupina M30 bývala součástí haploskupiny M4, která se vyznačuje G15431A.[5] Haploskupina M30 sdílí společnou mutaci kódující oblasti (12007) společně s haploskupinami M4, M18, M37 a M38 z kořene haploskupina M. (superhaploskupina M4'30).[3][6] M4'30 super-klade je jediný klade, který sdílí střední linii mezi 2 haploskupinami, zatímco zbytek všech M linií pochází nezávisle na kořenu makrohaploskupiny M; čímž podporuje myšlenku rychlého rozptýlení moderní lidé podél asijský pobřeží poté, co odešli Afrika, po kterém následovalo dlouhé období izolace.[3]

Haploskupina M30 byla identifikována v roce 2005 na základě úplnosti mitochondriální genom sekvence 24 indický Vzorky.[7] Byla označena jako nová linie s subhaploskupinami M30a, M30b, M30c, M30d na základě pozorovaných mutačních míst. Mutace charakterizující tuto linii byly pozorovány u pěti vzorků z východní části Indie, tj Bihar (Kurmi, Yadav a Baniya ), Západní Bengálsko (Mahishya ), Orissa (Saora ) a dva vzorky z jižní Indie (Křesťané z Karnataka a Lambadi z Andhra Pradesh ). Dříve identifikováno Haploskupina M18 se zhroutil, aby pobýval v M30 jako podřízená linie.[6][7]

V roce 2006 byla definice M30 zúžena identifikací s mutacemi T195A, 15431A a G12007A.[6][8] Studie podrobně popisovala jednotlivce z Reddy populace Andhra Pradesh kategorizovaná do M30a; vzorek Thogataveera z Andhra Pradesh klasifikované do M30b; přítomnost M30c v Thogataveera z Andhra Pradesh a Chaturvedi z Uttarpradéš a nakonec identifikace M30d v Bhargava z Uttarpradéš a Thogataveera z Andhra Pradesh.[8] V roce 2009 byla Subhaplogroup M30e identifikována mezi Kathodi, Kathakur a Mathakur v západní oblasti Indie.[9]

V roce 2006 uvedli Sahoo a Kashyap v Oriji haploskupinu M30 Brahminové, Karanams, Khandayats, Gope (aka Gour nebo Yadavs );[10] a v kmenech Juang a Saora z Orissa. The Saora vykazovaly vysokou frekvenci M30 (asi 32% velikosti vzorku), po níž následovala Karanams (24%), Oriya Brahmins (20%) a Juang (20%). Khandayat a Gope vykázali nižší frekvenci (asi 6%) M30. M30 byla také detekována při nízkých frekvencích (1,5% - 2,5%) v roce Pardhan, Naikpod Gond a Andh kmenové populace Ándhrapradéš.[8]

Věk linie M30 byl odhadován na 33 042 ± 7 840 let před současností.[7] Thangarajah a kol. (2006) ji datovali na 15 400 ± 6300 YBP.[8] Rajkumar a kol. navrhla odhadovaný čas koalescence haploskupiny M30 na 15 400 ± 6300 ybp a čas jejích subhaploskupin M30a a M30c na 5100 ± 3600 ybp.[7] Věk M30b a M30d byl vypočítán na 4177 ± 2800 let a 12 800 ± 5700 ybp.[8] Toto období odpovídá pozdnímuMezolit v Indii a Levant.

Rozdělení

M30 má v Indii široký geografický, etnický a jazykový rozsah. Bylo zjištěno v severní a jižní Indii v roce 2006 Australoidy a Kavkazoidy a v Dravidian a Indoevropský Řečníci.[11] To údajně dodává důvěryhodnost dlouhé spekulované možnosti Dravidian migrující reproduktory Írán na Indie. Tento názor podporuje přítomnost indických haploskupin v Íránu,[12] a úzký vztah mezi Dravidian a Elamit jazyky.[13][14]

V systému byla detekována haploskupina M30 Palestinci a je to údajně kvůli nedávnému toku genů z Indie do této oblasti.[11] M30 se nachází ve východní jemenské populaci v Upper Egypt a Kesra (Tunisko ), zatímco bylo zjištěno, že jednotlivci M30 tvoří 7,5% z celkové populace Hadramawt (Jemen ).[10] Kromě Saúdské Arábie byla M30 detekována také v mateřských liniích Čína.[6] Peng et al. (2017) našli ve vzorku 28 jedinců, kteří patří do haploskupiny mtDNA M30c1 Tádžikové z Dušanbe, Tádžikistán, dva jedinci, kteří patří do haploskupiny mtDNA M30h (nesoucí mutace na lokusech 16093, 4394, 4491 a 12451) ve vzorku 68 Kyrgyzština z Taxkorgan, Sin-ťiang, Čína, jeden jedinec, který patří do haploskupiny mtDNA M30 * (nesoucí další mutace na lokusech 11437 a 16274) ve vzorku 66 Wakhi z Taxkorgan, a jeden jedinec, který patří do haploskupiny mtDNA M30 (nesoucí další mutace na 16234 a 16153 lokusů, případně označujících větev před M30e) ve vzorku 86 Sarikolis od Taxkorgan.[15]

Stručně řečeno, jednotlivci haploskupiny M30 byli nalezeni v

Subclades

Strom

Tento fylogenetický strom podskupin haploskupin je založen na stromu Van Oven 2008[16] a následný publikovaný výzkum.

Viz také

Fylogenetický strom haploskupiny lidské mitochondriální DNA (mtDNA)

 Mitochondriální Eva (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEGQ ÓASR JáŽXY
CZBFR0 před JT P U
HVJTK.
HPROTIJT

Reference

  1. ^ Soares, Pedro; Ermini, Luca; Thomson, Noel; Mormina, Maru; Rito, Teresa; Röhl, Arne; Salas, Antonio; Oppenheimer, Stephen; et al. (2009). „Oprava pro čištění výběru: Vylepšené lidské mitochondriální molekulární hodiny“. American Journal of Human Genetics. 84 (6): 740–59. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. PMC  2694979. PMID  19500773.
  2. ^ Yonsei University, Korea. Motivy mutace specifické kontrolní oblasti mtDNA haploskupiny [1][je nutné ověření ]
  3. ^ A b C d Thangaraj, Kumarasamy; Chaubey, Gyaneshwer; Singh, Vijay; Vanniarajan, Ayyasamy; Thanseem, Ismail; Reddy, Alla G; Singh, Lalji (2006). „In situ původ hluboce zakořeněných linií mitochondriální makrohaploskupiny„ M “v Indii“. BMC Genomics. 7: 151. doi:10.1186/1471-2164-7-151. PMC  1534032. PMID  16776823.
  4. ^ Sahoo, Sanghamitra; Kashyap, V.K. (2006). „Fylogeografie mitochondriální DNA a haploskupin Y-chromozomu odhaluje asymetrický tok genů v populacích východní Indie“. American Journal of Physical Anthropology. 131 (1): 84–97. doi:10.1002 / ajpa.20399. PMID  16485297.
  5. ^ Ian Logan, 2008 [2][úplná citace nutná ]
  6. ^ A b C d Sun, Chang; Kong, Qing-Peng; Palanichamy, zakladatel Malliya; Agrawal, Suraksha; Bandelt, Hans-Jürgen; Yao, Yong-Gang; Khan, Faisal; Zhu, Chun-Ling; et al. (2005). „Oslnivé pole bazálních větví v mtDNA Macrohaplogroup M z Indie odvozené z úplných genomů“. Molekulární biologie a evoluce. 23 (3): 683–90. doi:10.1093 / molbev / msj078. PMID  16361303.
  7. ^ A b C d Rajkumar, Revathi; Banerjee, Jheelam; Gunturi, Hima; Trivedi, R; Kashyap, VK (2005). "Fylogeneze a starověk M makrohaploskupiny odvozena z úplné sekvence mt DNA indických specifických linií". BMC Evoluční biologie. 5: 26. doi:10.1186/1471-2148-5-26. PMC  1079809. PMID  15804362.
  8. ^ A b C d E Maji, Suvendu; Krithika, S; Vasulu, TS (2009). "Fylogeografická distribuce mitochondriální DNA makrohaploskupiny M v Indii" (PDF). Journal of Genetics. 88 (1): 127–39. doi:10.1007 / s12041-009-0020-3. PMID  19417557. S2CID  28080968.
  9. ^ Chandrasekar, Adimoolam; Kumar, satish; Sreenath, Jwalapuram; Sarkar, Bishwa Nath; Urade, Bhaskar Pralhad; Mallick, Sujit; Bandopadhyay, Syam Sundar; Barua, Pinuma; et al. (2009). Quintana-Murci, Lluis (ed.). „Aktualizace fylogeneze mitochondriální DNA makrohaploskupiny M v Indii: šíření moderního člověka v jihoasijském koridoru“. PLOS ONE. 4 (10): e7447. Bibcode:2009PLoSO ... 4.7447C. doi:10.1371 / journal.pone.0007447. PMC  2757894. PMID  19823670.
  10. ^ A b Černý, Viktor; Mulligan, Connie J .; Rídl, Jakub; Žaloudková, Martina; Edens, Christopher M .; Hájek, Martin; Pereira, Luísa (2008). „Regionální rozdíly v distribuci subsaharské, západoasijské a jihoasijské linie mtDNA v Jemenu“. American Journal of Physical Anthropology. 136 (2): 128–37. doi:10.1002 / ajpa.20784. PMID  18257024.
  11. ^ A b González, Ana M; Larruga, José M; Abu-Amero, Khaled K; Shi, Yufei; Pestano, José; Cabrera, Vicente M (2007). „Mitochondriální linie M1 sleduje časný lidský zpětný tok do Afriky“. BMC Genomics. 8: 223. doi:10.1186/1471-2164-8-223. PMC  1945034. PMID  17620140.
  12. ^ González, Ana M; Larruga, José M; Abu-Amero, Khaled K; Shi, Yufei; Pestano, José; Cabrera, Vicente M (2007). „Mitochondriální linie M1 sleduje časný lidský zpětný tok do Afriky“. BMC Genomics. 8: 223. doi:10.1186/1471-2164-8-223. PMC  1945034. PMID  17620140.
  13. ^ McAlpin, David W. (1974). „Směrem k Proto-Elamo-Dravidian“. Jazyk. 50 (1): 89–101. doi:10.2307/412012. JSTOR  412012.
  14. ^ McAlpin, David W. (1981). „Proto-Elamo-Dravidian: Důkazy a jejich důsledky“. Transakce Americké filozofické společnosti. 71 (3): 1–155. doi:10.2307/1006352. JSTOR  1006352.
  15. ^ Min-Sheng Peng, Weifang Xu, Jiao-Jiao Song, et al. (2017), „Mitochondriální genomy odkrývají mateřskou historii populací Pamíru.“ European Journal of Human Genetics https://doi.org/10.1038/s41431-017-0028-8
  16. ^ Van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (2009). "Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA". Lidská mutace. 30 (2): E386–94. doi:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749.

externí odkazy