Dihydroorotát dehydrogenáza (chinon) - Dihydroorotate dehydrogenase (quinone) - Wikipedia
| Dihydroorotát: chinonoxidoreduktáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 1.3.5.2 | ||||||||
| Číslo CAS | 59088-23-2 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
Dihydroorotát dehydrogenázy třídy 2 (DHOQO, ES 1.3.5.2 ) je enzym s systematické jméno (S) -dihydroorotát:chinon oxidoreduktáza.[1][2][3][4][5] Tento enzym katalýzy elektronový přenos z dihydroorotát (dárce elektronů) a chinon (akceptor elektronů):
- (S) -dihydroorotát + chinon orotovat + chinol
Tyto enzymy se liší od dihydroorotát dehydrogenáz třídy 1 (DHODH) na akceptoru elektronů, jejich struktuře a jejich buněčné lokalizaci. Protože reakce katalyzovaná DHOQO je součástí elektronový transportní řetězec a syntéza pyrimidinu de novo Byl prozkoumán jako možný cíl pro léčbu rakoviny, imunologické poruchy a bakteriální / virové infekce. [6][7][8]
Struktura
Strukturálně jsou DHOQO organizovány v monomerech, které přijímají záhyb (βα) 8 (osminásobný beta alfa barel).[9] Enzym lze oddělit ve své N-terminální doméně (modrá na obrázku) a ve své C-terminální doméně (zelená na obrázku).
N-terminální doména se skládá ze dvou amfipatických α-helixů (αA - αB), které jsou odpovědné za lipidová membrána interakce. Předpokládá se také, že tato oblast proteinu zprostředkovává vazbu chinonu.
Pokud jde o C-koncovou doménu, většina jejích strukturních prvků je sdílena s rozpustnými protějšky DHOQO. Tato doména je zodpovědná za vazbu kofaktoru FMN (učinit tyto enzymy součástí Flavoprotein superrodina) a dárce elektronů dihydroorotát, v blízkosti jádra 8 β-vlákna.
V současné době existují krystalografické struktury DHOQO od 5 různých organismů:
- Escherichia coli (příklad PDB: 1F76)[10]
- Mycobacterium tuberculosis (příklad PDB: 4XQ6)[11]
- Homo sapiens (příklad PDB: 4IGH)[12]
- Rattus norvegicus (příklad PDB: 4ORI)[13]
- Plasmodium falciparum (příklad PDB: 1TV5)[14]
Reference
- ^ Forman HJ, Kennedy J (listopad 1978). "Savčí dihydroorotát dehydrogenáza: fyzikální a katalytické vlastnosti primárního enzymu". Archivy biochemie a biofyziky. 191 (1): 23–31. doi:10.1016/0003-9861(78)90063-2. PMID 216313.
- ^ Hines V, Keys LD, Johnston M (srpen 1986). „Čištění a vlastnosti mitochondriální dihydroorotát dehydrogenázy z hovězích jater“. The Journal of Biological Chemistry. 261 (24): 11386–92. PMID 3733756.
- ^ Bader B, Knecht W, Fries M, Löffler M (srpen 1998). "Exprese, čištění a charakterizace potkana značeného histidinem a lidského flavoenzymu dihydroorotát dehydrogenázy". Exprese a čištění proteinů. 13 (3): 414–22. doi:10.1006 / prep.1998.0925. PMID 9693067.
- ^ Fagan RL, Nelson MN, Pagano PM, Palfey BA (prosinec 2006). "Mechanismus redukce flavinů ve třídě 2 dihydroorotát dehydrogenáz". Biochemie. 45 (50): 14926–32. doi:10.1021 / bi060919g. PMID 17154530.
- ^ Björnberg O, Grüner AC, Roepstorff P, Jensen KF (březen 1999). „Aktivita dihydroorotátdehydrogenázy Escherichia coli závisí na konzervované smyčce identifikované sekvenční homologií, mutagenezí a omezenou proteolýzou.“ Biochemie. 38 (10): 2899–908. doi:10.1021 / bi982352c. PMID 10074342.
- ^ J. Leban, D. Vitt, inhibitory lidské dihydroorotátdehydrogenázy, nový přístup k léčbě autoimunitních a zánětlivých onemocnění, Arzneimittel-Forschung / Drug Res. (2011). https://doi.org/10.1055/s-0031-1296169
- ^ R.I. Christopherson, S.D. Lyons, P.K. Wilson, Inhibitory biosyntézy nukleotidů de novo jako léky, Acc. Chem. Res. (2002). https://doi.org/10.1021/ar0000509
- ^ M. Löffler, L.D. Fairbanks, E. Zameitat, A.M. Marinaki, H.A. Simmonds, Pyrimidinové dráhy ve zdraví a nemoci, Trends Mol. Med. (2005). https://doi.org/10.1016/j.molmed.2005.07.003
- ^ D. Lang, R. Thoma, M. Henn-Sax, R. Sterner, M. Wilmanns, Strukturální důkazy o vývoji lešení β / α v barvě genovou duplikací a fúzí, Science (80-.). (2000). https://doi.org/10.1126/science.289.5484.1546
- ^ Dihydroorotátdehydrogenáza z E. coli odhaluje strukturní a funkční rozlišení mezi různými třídami dihydroorotátdehydrogenáz. DOI: 10.1016 / s0969-2126 (02) 00831-6
- ^ KRYSTÁLNÍ STRUKTURA DEHYDROGENU DIHYDROOROTÁTU Z MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS. DOI: 10,2210 / pdb4XQ6 / pdb
- ^ Optimalizace 4-chinolin karboxylové kyseliny analogické se silnou antivirovou aktivitou na základě SAR. DOI: 10,1021 / ml300464h
- ^ Fluor moduluje druhovou selektivitu ve třídě triazolopyrimidinu inhibitorů dihydroorotát dehydrogenázy Plasmodium falciparum. DOI: 10,1021 / jm500481t
- ^ Struktura dihydroorotátdehydrogenázy Plasmodium falciparum s vázaným inhibitorem. DOI: 10.1107 / S0907444905042642
externí odkazy
- Dihydroorotát + dehydrogenáza + (chinon) v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
 | Tento enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |