Faktor replikace DNA CDT1 - DNA replication factor CDT1 - Wikipedia

CDT1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2LE8, 2WVR
Identifikátory
Aliasy	CDT1, DUP, RIS2, licencování chromatinu a faktor replikace DNA 1
Externí ID	OMIM: 605525 MGI: 1914427 HomoloGene: 32650 Genové karty: CDT1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	88,809,258 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	122,573,554 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba chromatinu; • Vazba DNA polymerázy;
Buněčná složka	• cytosol; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • jaderné těleso; • chromozom, centromerická oblast; • kondenzovaný chromozomový kinetochor; • chromozóm; • kinetochore; • cytoplazma;
Biologický proces	• Kontrolní bod replikace DNA; • replikace DNA; • buněčný cyklus; • regulace replikace DNA jaderného buněčného cyklu; • regulace transkripce podílející se na přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu; • regulace iniciace replikace DNA závislé na DNA; • segregace chromozomů; • připojení mitotických vřetenových mikrotubulů ke kinetochoru; • GO: 0007067 mitotický buněčný cyklus; • pozitivní regulace sestavy proteinového komplexu; • regulace organizace chromozomů; • pozitivní regulace vazby chromatinu; • buněčné dělení; • kinetochore organizace; • Sestava preiniciačního komplexu replikace DNA; • reakce na sorbitol; • deaktivace kontrolního bodu sestavy mitotického vřetena; • regulace vazby počátku replikace DNA; • negativní regulace lokalizace proteinu na kinetochore; • pozitivní regulace lokalizace proteinu na kinetochore; • pozitivní regulace replikace DNA závislé na DNA; • pozitivní regulace sestavy komplexu mediátorů; • G1 / S přechod mitotického buněčného cyklu; • pozitivní regulace replikace DNA; • mitotická cytokineze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	81620
	67177
	ENSG00000167513
	ENSMUSG00000006585
	Q9H211
	Q8R4E9
	NM_030928
	NM_026014
	NP_112190
	NP_080290
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

CDT1 (Chromatinová licence a faktor replikace DNA 1) je a protein že u lidí je kódován CDT1 gen.^[5]^[6]^[7]^[8] Jedná se o licenční faktor, který slouží k omezení replikace DNA více než jednou za buněčný cyklus.

Role v předreplikačních komplexech

Klíčem je protein kódovaný tímto genem licenční faktor v sestavě pre-replikační komplexy (pre-RC), ke kterému dochází během G1 fáze buněčného cyklu. V sestavě pre-RC rozpoznávají komplexy rozpoznávání počátku (ORC1-6) počátky replikace DNA a váží se na ně. CDT1, spolu s proteinem CDC6, poté jsou přijati do formujícího se pre-RC, následovaného komplexy pro údržbu minichromozomů (MCM2-7).^[9]

Aktivita CDT1 během buněčný cyklus je během fáze S přísně regulován proteinem geminin, který inhibuje jeho, a SCF^SKP2, který ubikvinuje protein, aby jej označil na proteazomální degradaci.^[10] Tato regulace je důležitá v prevenci opětovného licencování, čímž zajišťuje, že DNA se replikuje pouze jednou za buněčný cyklus.

Ortology

CDT1 patří do rodiny replikačních proteinů konzervovaných z kvasinek na člověka. Příklady ortology u jiných druhů patří:

S. pombe - CDT1 (přepis závislý na CDC10 1)^[11]
Drosophila melanogaster - „dvojitě zaparkováno“ nebo Dup^[12]
Xenopus laevis - CDT1^[13]

Interakce

Bylo prokázáno, že DNA replikační faktor CDT1 komunikovat s SKP2.^[14] Cdt1 je přijímán komplex rozpoznávání původu v původních licencích. Nulové mutace pro CDT1 jsou v kvasinkách smrtelné; spory procházejí mitózou bez replikace DNA. Nadměrná exprese CDT1 způsobuje rereplikaci u H. sapiens, která aktivuje cestu CHK1 a brání vstupu do mitózy.^[15]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167513 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006585 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Rialland M, Sola F, Santocanale C (březen 2002). "Základní role lidského CDT1 v replikaci DNA a licencování chromatinu". J Cell Sci. 115 (Pt 7): 1435–40. PMID 11896191.
^ Nishitani H, Taraviras S, Lygerou Z, Nishimoto T (listopad 2001). „Lidský licenční faktor pro replikaci DNA Cdt1 se hromadí v G1 a je destabilizován po zahájení S-fáze“. J Biol Chem. 276 (48): 44905–11. doi:10,1074 / jbc.M105406200. PMID 11555648.
^ „Entrez Gene: licencování chromatinu CDT1 a faktor replikace DNA 1“.
^ Reference, Genetics Home. "Gen CDT1". Genetická domácí reference. Citováno 2018-07-19.
^ Hoffman, Ronald; ), Edward J. Benz (Jr.; Silberstein, Leslie E.; Heslop, Helen; Weitz, Jeffrey I.; Anastasi, John; Salama, Mohamed E.; Abutalib, Syed A. (2018). Hematologie: základní principy a praxe. Hoffman, Ronald, 1945-, Benz, Edward J., Jr. ,, Silberstein, Leslie E. ,, Heslop, Helen ,, Weitz, Jeffrey I. ,, Anastasi, John (sedmé vydání). Philadelphia, PA. str. Kapitola 17, 176–185. ISBN 9780323509398. OCLC 1001961209.CS1 maint: číselné názvy: seznam autorů (odkaz)
^ Wohlschlegel JA, Dwyer BT, Dhar SK, Cvetic C, Walter JC, Dutta A (prosinec 2000). "Inhibice replikace eukaryotické DNA vazbou gemininu na Cdt1". Věda. 290 (5500): 2309–12. Bibcode:2000 sci ... 290,2309 W.. doi:10.1126 / science.290.5500.2309. PMID 11125146.
^ Hofmann JF, Beach D (leden 1994). „cdt1 je základním cílem transkripčního faktoru Cdc10 / Sct1: požadavek na replikaci DNA a inhibici mitózy“. EMBO J.. 13 (2): 425–34. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06277.x. PMC 394824. PMID 8313888.
^ Nakajima H, Watanabe N, Shibata F, Kitamura T, Ikeda Y, Handa M (květen 2006). „N-koncová oblast proteinu epsilon vázajícího se na CCAAT / enhancer je kritická pro zastavení buněčného cyklu, apoptózu a funkční zrání během myeloidní diferenciace“. J. Biol. Chem. 281 (20): 14494–502. doi:10,1074 / jbc.M600575200. PMID 16531405.
^ Maiorano D, Moreau J, Méchali M (duben 2000). „XCDT1 je vyžadován pro sestavení pre-replikativních komplexů v Xenopus laevis“. Příroda. 404 (6778): 622–5. Bibcode:2000Natur.404..622M. doi:10.1038/35007104. PMID 10766247. S2CID 4416138.
^ Li X, Zhao Q, Liao R, Sun P, Wu X (2003). „Komplex ubikvitin ligázy SCF (Skp2) interaguje s lidským replikačním licenčním faktorem Cdt1 a reguluje degradaci Cdt1“. J. Biol. Chem. 278 (33): 30854–8. doi:10,1074 / jbc.C300251200. PMID 12840033.
^ Machida YJ, Dutta A (2005). "Mechanismy kontrolních bodů buněk monitorující správné zahájení replikace DNA". J. Biol. Chem. 280 (8): 6253–6. doi:10,1074 / jbc.R400037200. PMID 15591064.

Další čtení

Xouri G, Dimaki M, Bastiaens PI, Lygerou Z (2007). „Interakce Cdt1 v procesu licencování: model pro dynamickou časoprostorovou kontrolu licencí“. Buněčný cyklus. 6 (13): 1549–52. doi:10,4161 / cc.6.13.4455. PMID 17598984.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY a kol. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC a kol. (1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Nishitani H, Lygerou Z, Nishimoto T, sestra P (2000). "Protein Cdt1 je vyžadován pro povolení DNA pro replikaci ve štěpných kvasinkách". Příroda. 404 (6778): 625–8. Bibcode:2000Natur.404..625N. doi:10.1038/35007110. PMID 10766248. S2CID 205005540.
Whittaker AJ, Royzman I, Orr-Weaver TL (2000). „Drosophila double zaparkovaná: konzervovaný základní esenciální replikační protein, který se kolokalizuje s komplexem pro rozpoznávání původu a spojuje replikaci DNA s mitózou a down-regulací transkriptů fáze S“. Genes Dev. 14 (14): 1765–76. PMC 316778. PMID 10898791.
Wohlschlegel JA, Dwyer BT, Dhar SK a kol. (2001). "Inhibice replikace eukaryotické DNA vazbou gemininu na Cdt1". Věda. 290 (5500): 2309–12. doi:10.1126 / science.290.5500.2309. PMID 11125146.
Yanagi K, Mizuno T, You Z, Hanaoka F (2002). „Myší geminin inhibuje nejen interakce Cdt1-MCM6, ale také novou vnitřní aktivitu vázání Cdt1 DNA“. J. Biol. Chem. 277 (43): 40871–80. doi:10,1074 / jbc.M206202200. PMID 12192004.
Bermejo R, Vilaboa N, Calés C (2003). „Regulace CDC6, gemininu a CDT1 v lidských buňkách, které procházejí polyploidizací“. Mol. Biol. Buňka. 13 (11): 3989–4000. doi:10,1091 / mbc.E02-04-0217. PMC 133609. PMID 12429841.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Li X, Zhao Q, Liao R a kol. (2003). „Komplex ubikvitin ligázy SCF (Skp2) interaguje s lidským replikačním licenčním faktorem Cdt1 a reguluje degradaci Cdt1“. J. Biol. Chem. 278 (33): 30854–8. doi:10,1074 / jbc.C300251200. PMID 12840033.
Cook JG, Chasse DA, Nevins JR (2004). „Regulovaná asociace Cdt1 s proteiny udržujícími minichromozomy a Cdc6 v buňkách savců“. J. Biol. Chem. 279 (10): 9625–33. doi:10,1074 / jbc.M311933200. PMID 14672932.
Sugimoto N, Tatsumi Y, Tsurumi T a kol. (2004). „Fosforylace Cdt1 kinázami závislými na cyklinu A negativně reguluje jeho funkci bez ovlivnění vazby gemininu“. J. Biol. Chem. 279 (19): 19691–7. doi:10,1074 / jbc.M313175200. PMID 14993212.
Liu E, Li X, Yan F a kol. (2004). „Cyklin-dependentní kinázy fosforylují lidský Cdt1 a indukují jeho degradaci“. J. Biol. Chem. 279 (17): 17283–8. doi:10.1074 / jbc.C300549200. PMID 15004027.
Ramachandran N, Hainsworth E, Bhullar B a kol. (2004). „Self-assembling protein microarrays“. Věda. 305 (5680): 86–90. Bibcode:2004Sci ... 305 ... 86R. doi:10.1126 / science.1097639. PMID 15232106. S2CID 20936301.
Ballabeni A, Melixetian M, Zamponi R a kol. (2005). „Lidský geminin podporuje tvorbu pre-RC a replikaci DNA stabilizací CDT1 v mitóze“. EMBO J.. 23 (15): 3122–32. doi:10.1038 / sj.emboj.7600314. PMC 514931. PMID 15257290.
Saxena S, Yuan P, Dhar SK a kol. (2004). „Dimerizovaná doména coiled-coil a přilehlá část gemininu interagují se dvěma místy na Cdt1 za účelem inhibice replikace“. Mol. Buňka. 15 (2): 245–58. doi:10.1016 / j.molcel.2004.06.045. PMID 15260975.
Kulartz M, Knippers R (2004). „Replikativní regulační protein geminin na chromatinu v buněčném cyklu HeLa“. J. Biol. Chem. 279 (40): 41686–94. doi:10,1074 / jbc.M405798200. PMID 15284237.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9H211 (Faktor replikace lidské DNA Cdt1) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q8R4E9 (Myší DNA replikační faktor Cdt1) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167513 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006585 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11896191-5] Rialland M, Sola F, Santocanale C (březen 2002). "Základní role lidského CDT1 v replikaci DNA a licencování chromatinu". J Cell Sci. 115 (Pt 7): 1435–40. PMID 11896191.

[pmid11555648-6] Nishitani H, Taraviras S, Lygerou Z, Nishimoto T (listopad 2001). „Lidský licenční faktor pro replikaci DNA Cdt1 se hromadí v G1 a je destabilizován po zahájení S-fáze“. J Biol Chem. 276 (48): 44905–11. doi:10,1074 / jbc.M105406200. PMID 11555648.

[entrez-7] „Entrez Gene: licencování chromatinu CDT1 a faktor replikace DNA 1“.

[8] Reference, Genetics Home. "Gen CDT1". Genetická domácí reference. Citováno 2018-07-19.

[9] Hoffman, Ronald; ), Edward J. Benz (Jr.; Silberstein, Leslie E.; Heslop, Helen; Weitz, Jeffrey I.; Anastasi, John; Salama, Mohamed E.; Abutalib, Syed A. (2018). Hematologie: základní principy a praxe. Hoffman, Ronald, 1945-, Benz, Edward J., Jr. ,, Silberstein, Leslie E. ,, Heslop, Helen ,, Weitz, Jeffrey I. ,, Anastasi, John (sedmé vydání). Philadelphia, PA. str. Kapitola 17, 176–185. ISBN 9780323509398. OCLC 1001961209.CS1 maint: číselné názvy: seznam autorů (odkaz)

[pmid11125146-10] Wohlschlegel JA, Dwyer BT, Dhar SK, Cvetic C, Walter JC, Dutta A (prosinec 2000). "Inhibice replikace eukaryotické DNA vazbou gemininu na Cdt1". Věda. 290 (5500): 2309–12. Bibcode:2000 sci ... 290,2309 W.. doi:10.1126 / science.290.5500.2309. PMID 11125146.

[pmid8313888-11] Hofmann JF, Beach D (leden 1994). „cdt1 je základním cílem transkripčního faktoru Cdc10 / Sct1: požadavek na replikaci DNA a inhibici mitózy“. EMBO J.. 13 (2): 425–34. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06277.x. PMC 394824. PMID 8313888.

[pmid16531405-12] Nakajima H, Watanabe N, Shibata F, Kitamura T, Ikeda Y, Handa M (květen 2006). „N-koncová oblast proteinu epsilon vázajícího se na CCAAT / enhancer je kritická pro zastavení buněčného cyklu, apoptózu a funkční zrání během myeloidní diferenciace“. J. Biol. Chem. 281 (20): 14494–502. doi:10,1074 / jbc.M600575200. PMID 16531405.

[pmid10766247-13] Maiorano D, Moreau J, Méchali M (duben 2000). „XCDT1 je vyžadován pro sestavení pre-replikativních komplexů v Xenopus laevis“. Příroda. 404 (6778): 622–5. Bibcode:2000Natur.404..622M. doi:10.1038/35007104. PMID 10766247. S2CID 4416138.

[pmid12840033-14] Li X, Zhao Q, Liao R, Sun P, Wu X (2003). „Komplex ubikvitin ligázy SCF (Skp2) interaguje s lidským replikačním licenčním faktorem Cdt1 a reguluje degradaci Cdt1“. J. Biol. Chem. 278 (33): 30854–8. doi:10,1074 / jbc.C300251200. PMID 12840033.

[pmid15591064-15] Machida YJ, Dutta A (2005). "Mechanismy kontrolních bodů buněk monitorující správné zahájení replikace DNA". J. Biol. Chem. 280 (8): 6253–6. doi:10,1074 / jbc.R400037200. PMID 15591064.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]