D-alanin - D-alanin ligáza - D-alanine—D-alanine ligase
| D-alanin - D-alanin ligáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 6.3.2.4 | ||||||||
| Číslo CAS | 9023-63-6 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| N-konec D-ala D-ala ligázy | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 komplex y216f d-ala: d-ala ligáza s adp a fosforylfosfinátem | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Dala_Dala_lig_N | ||||||||
| Pfam | PF01820 | ||||||||
| InterPro | IPR011127 | ||||||||
| SCOP2 | 2 dln / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| C-konec D-ala D-ala ligázy | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
komplex y216f d-ala: d-ala ligáza s adp a fosforylfosfinátem | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Dala_Dala_lig_C | ||||||||
| Pfam | PF07478 | ||||||||
| Pfam klan | CL0179 | ||||||||
| InterPro | IPR011095 | ||||||||
| SCOP2 | 2 dln / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
v enzymologie, a D-alanin - D-alanin ligáza (ES 6.3.2.4 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce
- ATP + 2 D-alanin ADP + fosfát + D-alanyl-D-alanin
Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou ATP a D-alanin, zatímco jeho 3 produkty jsou ADP, fosfát, a D-alanyl-D-alanin.
Tento enzym patří do rodiny ligázy, konkrétně těch, které tvoří vazby uhlík-dusík jako ligázy kyselina-D-aminokyselina (peptidové syntázy). The systematické jméno této třídy enzymů je D-alanin: D-alanin ligáza (tvořící ADP). Mezi další běžně používaná jména patří alanin: alanin ligáza (tvořící ADP), a alanylalanin syntetáza. Tento enzym se účastní metabolismus d-alaninu a biosyntéza peptidoglykanu. Fosfinát a D-cykloserin je známo, že inhibovat tento enzym.
Předpokládá se, že je zapojena N-koncová oblast D-alanin-D-alanin ligázy Podklad vazba, zatímco C-konec je považován za a katalytické doména.[1]
Strukturální studie
Ke konci roku 2007, 8 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1EHI, 1IOV, 1IOW, 2DLN, 2FB9, 2I80, 2I87, a 2I8C.
Reference
- ^ Roper DI, Huyton T, Vagin A, Dodson G (srpen 2000). „Molekulární podstata rezistence na vankomycin u klinicky relevantních Enterokoků: krystalová struktura D-alanyl-D-laktát ligázy (VanA)“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (16): 8921–5. Bibcode:2000PNAS ... 97.8921R. doi:10.1073 / pnas.150116497. PMC 16797. PMID 10908650.
Další čtení
- Ito, E; Strominger JL (1962). "Enzymatická syntéza peptidu v bakteriálních uridinových nukleotidech II. Enzymatická syntéza a přidání D-alanyl-D-alaninu". J. Biol. Chem. 237: 2696–2703.
- Neuhaus FC (1962). „Kinetické studie na D-Ala-D-Ala syntetáze“. Fed. Proc. 21: 229.
- van Heijenoort J (2001). "Nedávné pokroky ve tvorbě bakteriální peptidoglykanové monomerní jednotky". Nat. Prod. Rep. 18 (5): 503–19. doi:10.1039 / a804532a. PMID 11699883.
| Tento EC 6.3 enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |